Elucidating the causes and consequences of the global pattern of epigenetic variation in Arabidopsis thaliana

Informacje na temat projektu

EPICLINES

Identyfikator umowy o grant: 789037

DOI

10.3030/789037

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 15 Maja 2018

Data rozpoczęcia 1 Czerwca 2018

Data zakończenia 31 Maja 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 498 468,00

Wkład UE

€ 2 498 468,00

Koordynowany przez

GREGOR MENDEL INSTITUT FUR MOLEKULARE PFLANZENBIOLOGIE GMBH
Austria

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Non-peer reviewed articles (3)

Towards an unbiased characterization of genetic polymorphism

Autorzy: Anna A. Igolkina, Sebastian Vorbrugg, Fernando A. Rabanal, Hai-Jun Liu, Haim Ashkenazy, Aleksandra E. Kornienko, Joffrey Fitz, Max Collenberg, Christian Kubica, Almudena Mollá Morales, Benjamin Jaegle, Travis Wrightsman, Vitaly Voloshin, Victor Llaca, Viktoria Nizhynska, Ilka Reichardt, Christa Lanz, Felix Bemm, Pádraic J. Flood, Sileshi Nemomissa, Angela Hancock, Ya-Long Guo, Paul Kersey, Detle
Opublikowane w: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.05.30.596703

Alternative silencing states of Transposable Elements in Arabidopsis

Autorzy: Valentin Hure, Florence Piron-Prunier, Tamara Yehouessi, Clémentine Vitte, Aleksandra E. Kornienko, Gabrielle Adam, Magnus Nordborg, Angélique Déléris
Opublikowane w: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.03.16.585326

Bisulphite sequencing in the presence of cytosine-conversion errors

Autorzy: Thomas James Ellis, Viktoria Nyzhynska, Rahul Pisupati, Almudena Mollá-Morales, Magnus Nordborg
Opublikowane w: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.09.16.613193

Peer reviewed articles (6)

Extensive sequence duplication in Arabidopsis revealed by pseudo-heterozygosity

Autorzy: Benjamin Jaegle, Rahul Pisupati, Luz Mayela Soto-Jiménez, Robin Burns, Fernando A. Rabanal, Magnus Nordborg
Opublikowane w: Genome Biology, Numer 24, 2023, ISSN 1474-760X
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-023-02875-3

Population-level annotation of lncRNAs in Arabidopsis reveals extensive expression variation associated with transposable element–like silencing

Autorzy: Aleksandra E Kornienko, Viktoria Nizhynska, Almudena Molla Morales, Rahul Pisupati, Magnus Nordborg
Opublikowane w: The Plant Cell, Numer 36, 2023, Strona(/y) 85-111, ISSN 1040-4651
Wydawca: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plcell/koad233

Conditional GWAS of non-CG transposon methylation in Arabidopsis thaliana reveals major polymorphisms in five genes

Autorzy: Eriko Sasaki; Joanna Gunis; Ilka Reichardt-Gomez; Viktoria Nizhynska; Magnus Nordborg
Opublikowane w: PLOS Genetics, Numer 18(9), 2022, Strona(/y) 1-24, ISSN 1553-7390
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010345

Common alleles of CMT2 and NRPE1 are major determinants of CHH methylation variation in Arabidopsis thaliana

Autorzy: Eriko Sasaki, Taiji Kawakatsu, Joseph R. Ecker, Magnus Nordborg
Opublikowane w: PLOS Genetics, Numer 15/12, 2019, Strona(/y) e1008492, ISSN 1553-7390
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1008492

On the causes of gene-body methylation variation in Arabidopsis thaliana

Autorzy: Rahul Pisupati, Viktoria Nizhynska, Almudena Mollá Morales, Magnus Nordborg
Opublikowane w: PLOS Genetics, Numer 19, 2023, Strona(/y) e1010728, ISSN 1553-7390
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010728

Genetic basis of Arabidopsis thaliana responses to infection by naïve and adapted isolates of turnip mosaic virus

Autorzy: Anamarija Butkovic, Thomas James Ellis, Ruben Gonzalez, Benjamin Jaegle, Magnus Nordborg, Santiago F Elena
Opublikowane w: eLife, Numer 12, 2024, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.89749