Opis projektu
Odkrycie kluczowych modulatorów odpowiedzi odpornościowej na wirusy
Wywołanie odpowiedzi immunologicznej przeciwko wirusom ma kluczowe znaczenie dla zdrowia ludzkiego. W ramach finansowanego przez UE projektu ProDAP badane są interakcje między białkami wirusowymi a białkami pozyskanymi od gospodarzy, które to interakcje regulują odpowiedź komórek odpornościowych. Wykorzystując spektrometrię mas i modelowanie statystyczne, naukowcy zidentyfikowali białka gospodarzy, które po infekcji wirusowej zmieniają swoją zdolność interakcji lub wskaźnik rotacji. Białka te wydają się mieć kluczowe znaczenie dla odporności przeciwwirusowej, a ich szczegółowa charakterystyka pomoże wnikliwie przeanalizować złożone szlaki odpowiedzi immunologicznej. Oczekuje się, że wgląd w regulację interakcji między gospodarzem a patogenem doprowadzi do odkrycia nowych strategii leczenia chorób wirusowych.
Cel
The innate antiviral defense system is of central importance to protect from viral pathogens. Its ability to mitigate a detrimental outcome of an infectious event relies on interactions that happen between viral and host-derived proteins as well as on signalling cascades that regulate the cellular response. However, despite the importance of these interactions, the involved processes and proteins are not yet fully understood.
We established state of the art mass spectrometry techniques and statistical modelling to characterise protein-protein interactions that are affected by viruses. We identified a class of proteins we name “viral affected proteins changing their interaction” (iVAPs). In addition, we established protein turnover rates of >6900 proteins in virus infected cells and identified a group of “viral affected proteins changing turnover rates” (tVAPs). tVAPs are regulated on basis of protein stabilisation, degradation or translation. Preliminary experiments show critical importance of iVAPs and tVAPs in antiviral immunity, suggesting functional similarities to Interferon stimulated genes (ISGs). Alike ISGs, VAPs therefore represent a critical component of the immune system.
ProDAP will establish the function of iVAPs and tVAPs in the antiviral immune response. Systematic screens employing depletion and overexpression experiments, integration of these data in functional networks and mechanistic follow up studies will be performed. Already identified and new candidate proteins will be tested mechanistically for their immune-regulatory capacity and their influence on virus infections in vitro and in vivo.
ProDAP will allow insights in yet unstudied modulators of host-pathogen interplay and will influence our current understanding of immune regulation in general. It is well established that ISGs are of central importance to defend virus infections and we hypothesize that VAPs may fulfil a similarly important protective function that has yet not been elucid
Dziedzina nauki
- natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsproteomics
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologyvirology
- medical and health sciencesbasic medicineimmunology
- natural scienceschemical sciencesanalytical chemistrymass spectrometry
- medical and health sciencesbasic medicinepharmacology and pharmacypharmaceutical drugsantivirals
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-COG - Consolidator GrantInstytucja przyjmująca
80333 Muenchen
Niemcy