Breaking borders, Functional genetic screens of structural regulatory DNA elements

Projektinformationen

Breakborder

ID Finanzhilfevereinbarung: 832844

DOI

10.3030/832844

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 23 Mai 2019

Startdatum 1 September 2019

Enddatum 31 August 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 497 000,00

EU-Beitrag

€ 2 497 000,00

Koordiniert durch

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netherlands

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (11)

A comprehensive enhancer screen identifies TRAM2 as a key and novel mediator of YAP oncogenesis

Autoren: Li Li, Alejandro P. Ugalde, Colinda L. G. J. Scheele, Sebastian M. Dieter, Remco Nagel, Jin Ma, Abhijeet Pataskar, Gozde Korkmaz, Ran Elkon, Miao-Ping Chien, Li You, Pin-Rui Su, Onno B. Bleijerveld, Maarten Altelaar, Lyubomir Momchev, Zohar Manber, Ruiqi Han, Pieter C. van Breugel, Rui Lopes, Peter ten Dijke, Jacco van Rheenen, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Genome Biology, Ausgabe 22/1, 2021, ISSN 1474-760X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-021-02272-8

A CRISPR-Cas9 screen identifies essential CTCF anchor sites for estrogen receptor-driven breast cancer cell proliferation

Autoren: Gozde Korkmaz, Zohar Manber, Rui Lopes, Stefan Prekovic, Karianne Schuurman, Yongsoo Kim, Hans Teunissen, Koen Flach, Elzo de Wit, Giorgio G Galli, Wilbert Zwart, Ran Elkon, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 47/18, 2019, Seite(n) 9557-9572, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkz675

DNA damage induces p53-independent apoptosis through ribosome stalling

Autoren: Nicolaas J. Boon, Rafaela A. Oliveira, Pierré-René Körner, Adva Kochavi, Sander Mertens, Yuval Malka, Rhianne Voogd, Suzanne E. M. van der Horst, Maarten A. Huismans, Lidwien P. Smabers, Jonne M. Draper, Lodewyk F. A. Wessels, Peter Haahr, Jeanine M. L. Roodhart, Ton N. M. Schumacher, Hugo J. Snippert, Reuven Agami, Thijn R. Brummelkamp
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 384, 2024, Seite(n) 785-792, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adh7950

Molecular mechanisms of non-genetic aberrant peptide production in cancer

Autoren: Demi Wernaart, Amos Fumagalli, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Oncogene, Ausgabe 43, 2024, Seite(n) 2053-2062, ISSN 0950-9232
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41388-024-03069-2

Arginine deprivation enriches lung cancer proteomes with cysteine by inducing arginine-to-cysteine substitutants

Autoren: Chao Yang, Abhijeet Pataskar, Xiaodong Feng, Jasmine Montenegro Navarro, Inés Paniagua, Jacqueline J.L. Jacobs, Esther A. Zaal, Celia R. Berkers, Onno B. Bleijerveld, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 84, 2024, Seite(n) 1904-1916.e7, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.04.012

Tryptophan depletion results in tryptophan-to-phenylalanine substitutants

Autoren: Abhijeet Pataskar, Julien Champagne, Remco Nagel, Juliana Kenski, Maarja Laos, Justine Michaux, Hui Song Pak, Onno B. Bleijerveld, Kelly Mordente, Jasmine Montenegro Navarro, Naomi Blommaert, Morten M. Nielsen, Domenica Lovecchio, Everett Stone, George Georgiou, Mark C. de Gooijer, Olaf van Tellingen, Maarten Altelaar, Robbie P. Joosten, Anastassis Perrakis, Johanna Olweus, Michal Bassani-Sternber
Veröffentlicht in: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04499-2

Oncogene-dependent sloppiness in mRNA translation

Autoren: Julien Champagne, Abhijeet Pataskar, Naomi Blommaert, Remco Nagel, Demi Wernaart, Sofia Ramalho, Juliana Kenski, Onno B Bleijerveld, Esther A Zaal, Celia R Berkers, Maarten Altelaar, Daniel S Peeper, William J Faller, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Molecular Cell, 2021, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.09.002

Alternative cleavage and polyadenylation generates downstream uncapped RNA isoforms with translation potential

Autoren: Yuval Malka, Ferhat Alkan, Shinyeong Ju, Pierre-Rene Körner, Abhijeet Pataskar, Eldad Shulman, Fabricio Loayza-Puch, Julien Champagne, Casper Wenzel, William James Faller, Ran Elkon, Cheolju Lee, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 82, 2024, Seite(n) 3840-3855.e8, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.09.036

Boosting Antitumor Immunity with an Expanded Neoepitope Landscape

Autoren: Remco Nagel, Abhijeet Pataskar, Julien Champagne, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Cancer Research, Ausgabe 82, 2023, Seite(n) 3637-3649, ISSN 0008-5472
Herausgeber: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-22-1525

Proteome diversification by mRNA translation in cancer

Autoren: Adva Kochavi, Domenica Lovecchio, William James Faller, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 83, 2024, Seite(n) 469-480, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.11.014

Anti-tumour immunity induces aberrant peptide presentation in melanoma

Autoren: Osnat Bartok, Abhijeet Pataskar, Remco Nagel, Maarja Laos, Eden Goldfarb, Deborah Hayoun, Ronen Levy, Pierre-Rene Körner, Inger Z. M. Kreuger, Julien Champagne, Esther A. Zaal, Onno B. Bleijerveld, Xinyao Huang, Juliana Kenski, Jennifer Wargo, Alexander Brandis, Yishai Levin, Orel Mizrahi, Michal Alon, Sacha Lebon, Weiwen Yang, Morten M. Nielsen, Noam Stern-Ginossar, Maarten Altelaar, Celia R. Be
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 590/7845, 2021, Seite(n) 332-337, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-03054-1

Non-peer reviewed articles (1)

Two-layer design protects genes from mutations in their enhancers

Autoren: Ran Elkon, Reuven Agami
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 609, 2022, Seite(n) 477-478, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/d41586-022-02341-3