Breaking borders, Functional genetic screens of structural regulatory DNA elements

Informacje na temat projektu

Breakborder

Identyfikator umowy o grant: 832844

DOI

10.3030/832844

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 23 Maja 2019

Data rozpoczęcia 1 Września 2019

Data zakończenia 31 Sierpnia 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 497 000,00

Wkład UE

€ 2 497 000,00

Koordynowany przez

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netherlands

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (11)

A comprehensive enhancer screen identifies TRAM2 as a key and novel mediator of YAP oncogenesis

Autorzy: Li Li, Alejandro P. Ugalde, Colinda L. G. J. Scheele, Sebastian M. Dieter, Remco Nagel, Jin Ma, Abhijeet Pataskar, Gozde Korkmaz, Ran Elkon, Miao-Ping Chien, Li You, Pin-Rui Su, Onno B. Bleijerveld, Maarten Altelaar, Lyubomir Momchev, Zohar Manber, Ruiqi Han, Pieter C. van Breugel, Rui Lopes, Peter ten Dijke, Jacco van Rheenen, Reuven Agami
Opublikowane w: Genome Biology, Numer 22/1, 2021, ISSN 1474-760X
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-021-02272-8

A CRISPR-Cas9 screen identifies essential CTCF anchor sites for estrogen receptor-driven breast cancer cell proliferation

Autorzy: Gozde Korkmaz, Zohar Manber, Rui Lopes, Stefan Prekovic, Karianne Schuurman, Yongsoo Kim, Hans Teunissen, Koen Flach, Elzo de Wit, Giorgio G Galli, Wilbert Zwart, Ran Elkon, Reuven Agami
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 47/18, 2019, Strona(/y) 9557-9572, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkz675

DNA damage induces p53-independent apoptosis through ribosome stalling

Autorzy: Nicolaas J. Boon, Rafaela A. Oliveira, Pierré-René Körner, Adva Kochavi, Sander Mertens, Yuval Malka, Rhianne Voogd, Suzanne E. M. van der Horst, Maarten A. Huismans, Lidwien P. Smabers, Jonne M. Draper, Lodewyk F. A. Wessels, Peter Haahr, Jeanine M. L. Roodhart, Ton N. M. Schumacher, Hugo J. Snippert, Reuven Agami, Thijn R. Brummelkamp
Opublikowane w: Science, Numer 384, 2024, Strona(/y) 785-792, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adh7950

Molecular mechanisms of non-genetic aberrant peptide production in cancer

Autorzy: Demi Wernaart, Amos Fumagalli, Reuven Agami
Opublikowane w: Oncogene, Numer 43, 2024, Strona(/y) 2053-2062, ISSN 0950-9232
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41388-024-03069-2

Arginine deprivation enriches lung cancer proteomes with cysteine by inducing arginine-to-cysteine substitutants

Autorzy: Chao Yang, Abhijeet Pataskar, Xiaodong Feng, Jasmine Montenegro Navarro, Inés Paniagua, Jacqueline J.L. Jacobs, Esther A. Zaal, Celia R. Berkers, Onno B. Bleijerveld, Reuven Agami
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 84, 2024, Strona(/y) 1904-1916.e7, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.04.012

Tryptophan depletion results in tryptophan-to-phenylalanine substitutants

Autorzy: Abhijeet Pataskar, Julien Champagne, Remco Nagel, Juliana Kenski, Maarja Laos, Justine Michaux, Hui Song Pak, Onno B. Bleijerveld, Kelly Mordente, Jasmine Montenegro Navarro, Naomi Blommaert, Morten M. Nielsen, Domenica Lovecchio, Everett Stone, George Georgiou, Mark C. de Gooijer, Olaf van Tellingen, Maarten Altelaar, Robbie P. Joosten, Anastassis Perrakis, Johanna Olweus, Michal Bassani-Sternber
Opublikowane w: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04499-2

Oncogene-dependent sloppiness in mRNA translation

Autorzy: Julien Champagne, Abhijeet Pataskar, Naomi Blommaert, Remco Nagel, Demi Wernaart, Sofia Ramalho, Juliana Kenski, Onno B Bleijerveld, Esther A Zaal, Celia R Berkers, Maarten Altelaar, Daniel S Peeper, William J Faller, Reuven Agami
Opublikowane w: Molecular Cell, 2021, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.09.002

Alternative cleavage and polyadenylation generates downstream uncapped RNA isoforms with translation potential

Autorzy: Yuval Malka, Ferhat Alkan, Shinyeong Ju, Pierre-Rene Körner, Abhijeet Pataskar, Eldad Shulman, Fabricio Loayza-Puch, Julien Champagne, Casper Wenzel, William James Faller, Ran Elkon, Cheolju Lee, Reuven Agami
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 82, 2024, Strona(/y) 3840-3855.e8, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.09.036

Boosting Antitumor Immunity with an Expanded Neoepitope Landscape

Autorzy: Remco Nagel, Abhijeet Pataskar, Julien Champagne, Reuven Agami
Opublikowane w: Cancer Research, Numer 82, 2023, Strona(/y) 3637-3649, ISSN 0008-5472
Wydawca: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-22-1525

Proteome diversification by mRNA translation in cancer

Autorzy: Adva Kochavi, Domenica Lovecchio, William James Faller, Reuven Agami
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 83, 2024, Strona(/y) 469-480, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.11.014

Anti-tumour immunity induces aberrant peptide presentation in melanoma

Autorzy: Osnat Bartok, Abhijeet Pataskar, Remco Nagel, Maarja Laos, Eden Goldfarb, Deborah Hayoun, Ronen Levy, Pierre-Rene Körner, Inger Z. M. Kreuger, Julien Champagne, Esther A. Zaal, Onno B. Bleijerveld, Xinyao Huang, Juliana Kenski, Jennifer Wargo, Alexander Brandis, Yishai Levin, Orel Mizrahi, Michal Alon, Sacha Lebon, Weiwen Yang, Morten M. Nielsen, Noam Stern-Ginossar, Maarten Altelaar, Celia R. Be
Opublikowane w: Nature, Numer 590/7845, 2021, Strona(/y) 332-337, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-03054-1

Non-peer reviewed articles (1)

Two-layer design protects genes from mutations in their enhancers

Autorzy: Ran Elkon, Reuven Agami
Opublikowane w: Nature, Numer 609, 2022, Strona(/y) 477-478, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/d41586-022-02341-3