Skip to main content
Vai all'homepage della Commissione europea (si apre in una nuova finestra)
italiano italiano
CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS
CORDIScovery podcast 50th episode CORDIScovery podcast 50th episode

Untangling eco-evolutionary impacts on diatom genomes over timescales relevant to current climate change

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (37)
A roadmap for using the UN Decade of Ocean Science for Sustainable Development in support of science, policy, and action. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Claudet, J., Bopp, L., Cheung, W. W. L., Devillers, R., Escobar-Briones, E., Haugan, P., Heymans, J. H., Masson-Delmotte, V., Matz-Luck, N., Miloslavich, P., Mullineaux, L., Visbeck, M., Watson, R., Zivian, A. M., Ansorge, I., Araujo, M., Arico, S., Bailly, D., Barbière, J., Barnerias, C., Bowler, C., Brun, V., Cazenave, A., Diver, C., Euzen, A., Thierno Gaye, A., Hilmi, N., Ménard, F., Moulin,
Pubblicato in: One Earth, Numero 1, 2020, Pagina/e 123, ISSN 2590-3330
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.oneear.2019.10.012

Macroscale patterns of oceanic zooplankton composition and size structure. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Brandão, M. C., Benedetti, F., Martini, S., Soviadan, Y. D., Irisson, J. O., Romagnan, J. B., Elineau, A., Desnos, C., Jalabert, L., Freire, A. S., Picheral, M., Guidi, L., Gorsky, G., Bowler, C., Karp-Boss, L., Henry, N., de Vargas, C., Sullivan, M. B., Tara Oceans Consortium Coordinators, Stemmann, L. and Lombard, F.
Pubblicato in: Sci Rep, Numero 11, 2021, Pagina/e 15714, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-94615-5

Global Trends in Marine Plankton Diversity across Kingdoms of Life. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ibarbalz, Federico M.; Henry, Nicolas; Brandão, Manoela C.; Martini, Séverine; Busseni, Greta; Byrne, Hannah; Coelho, Luis Pedro; Endo, Hisashi; Gasol, Josep M.; Gregory, Ann C.; Mahé, Frédéric; Rigonato, Janaina; Royo-Llonch, Marta; Salazar, Guillem; Sanz-Sáez, Isabel; Scalco, Eleonora; Soviadan, Dodji; Zayed, Ahmed A.; Zingone, Adriana; Labadie, Karine; Ferland, Joannie; Marec, Claudie; Ka
Pubblicato in: EISSN: 1097-4172, Numero 3, 2019, Pagina/e 12345, ISSN 1097-4172
Editore: Cell Press
DOI: 10.3929/ethz-b-000378196

Large scale patterns of marine diatom richness: Drivers and trends in a changing ocean (si apre in una nuova finestra)

Autori: Busseni, G., Caputi, L., Piredda, R., Fremont, P., Mele, B. H., Campese, L., Scalco, E., de Vargas, C., Bowler, C., d'Ovidio, F., Zingone, A., Ribera d’Alcalà, M. Iudicone, D.
Pubblicato in: Global Ecol. Biogeo., Numero 1, 2020, Pagina/e 1-14, ISSN 1466-822X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/geb.13161

Priorities for ocean microbiome research (si apre in una nuova finestra)

Autori: Tara Ocean Foundation, Tara Oceans, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), European Marine Biological Resource Centre - European Research Infrastructure Consortium (EMBRC-ERIC). Corresponding author Bowler, C.
Pubblicato in: Nature Microbiology, Numero 7, 2022, Pagina/e 937-947, ISSN 2058-5276
Editore: Springer
DOI: 10.1038/s41564-022-01145-5

Exploration of marine phytoplankton: from their historical appreciation to the omics era. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Pierella Karlusich, J. J., Ibarbalz, F. M. and Bowler, C.
Pubblicato in: J Plankton Res, Numero 42, 2020, Pagina/e 595-612, ISSN 0142-7873
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/plankt/fbaa049

Functional repertoire convergence of distantly related eukaryotic plankton lineages abundant in the sunlit ocean (si apre in una nuova finestra)

Autori: Delmont, T. O., Gaia, M., Hinsinger, D. D., Fremont, P., Vanni, C., Fernandez Guerra, A., Eren, A. M., Kourlaiev, A., d’Agata, L., Clayssen, Q., et al.
Pubblicato in: Cell Genomics, Numero 2, 2022, Pagina/e 12345, ISSN 2666-979X
Editore: Cell Press
DOI: 10.1101/2020.10.15.341214

Genome wide natural variation of H3K27me3 selectively marks genes predicted to be important for cell differentiation in Phaeodactylum tricornutum (si apre in una nuova finestra)

Autori: Zhao, X, Rastogi A., Deton Cabanillas, A. F., Ait Mohamed, O., Cantrel, C., Lombard, B., Murik, O., Genovesio, A., Bowler, C., Bouyer, D., Loew, D., Lin, X., Veluchamy, A., Vieira, F. R. J. and Tirichine, L.
Pubblicato in: New Phytol, Numero 12, 2021, Pagina/e 12345, ISSN 0028-646X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17129

The possible fates of Fragilariopsis cylindrus (polar diatom) cells exposed to prolonged darkness (si apre in una nuova finestra)

Autori: Sciandra, T., Forget, M. H., Bruyant, F., Béguin, M., Lacour, T., Bowler, C. and Babin, M.
Pubblicato in: J Phycol, Numero 12, 2022, Pagina/e 12345, ISSN 0022-3646
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jpy.13232

Genome-wide analysis of allele-specific expression of genes in the model diatom Phaeodactylum tricornutum. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Hoguin, A., Rastogi, A. and Bowler, C. and Tirichine, L.
Pubblicato in: Sci Rep, Numero 11, 2021, Pagina/e 2954, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-82529-1

Mitotic recombination between homologous chromosomes drives genomic diversity in diatoms. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Bulankova, P., Sekulić, M., Jallet, D., Nef, C., van Oosterhout, C., Delmont, T. O., Vercauteren, I., Osuna-Cruz, C. M., Vancaester, E., Mock, T., Sabbe, K., Daboussi, F., Bowler, C., Vyverman, W., Vandepoele, K. and De Veylder, L.
Pubblicato in: Curr Biol, Numero S0960-9822(21)00672-2, 2021, Pagina/e S0960-9822(21)00672-2, ISSN 0960-9822
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2021.05.013

Contribution of genome-scale metabolic modelling to niche theory (si apre in una nuova finestra)

Autori: Régimbeau, A., Budinich, M., Larhlimi, A., Pierella Karlusich, J. J., Aumont, O., Memery, L., Bowler, C. and Eveillard, D.
Pubblicato in: Ecol Lett, Numero 25, 2022, Pagina/e 1352-1364, ISSN 1461-023X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ele.13954

A robust approach to estimate relative phytoplankton cell abundances from metagenomes (si apre in una nuova finestra)

Autori: Juan José Pierella Karlusich; Eric Pelletier; Lucie Zinger; Fabien Lombard; Adriana Zingone; Sébastien Colin; Josep M. Gasol; Richard G. Dorrell; Nicolas Henry; Eleonora Scalco; Silvia G. Acinas; Patrick Wincker; Colomban Vargas; Chris Bowler
Pubblicato in: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03559541, Numero 1, 2022, Pagina/e 123, ISSN 1755-0998
Editore: Wiley
DOI: 10.1111/1755-0998.13592

Coupling imaging and omics in plankton surveys: State-of-the-art, challenges, and future directions (si apre in una nuova finestra)

Autori: Pierella Karlusich, J. J., Lombard, F., Irisson, J.-O., Bowler, C. and Foster, R. A.
Pubblicato in: Frontiers Mar Sci, Numero 9, 2022, Pagina/e 878803, ISSN 2296-7745
Editore: Frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2022.878803

Probing the diversity of Polycomb and Trithorax proteins in cultured and environmentally sampled microalgae. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Zhao, X., Deton Cabanillas, A.-F., Veluchamy, A., Bowler, C., Vieira, F. R. J. and Tirichine, L.
Pubblicato in: Frontiers Mar Sci, Numero 12, 2020, Pagina/e 12345, ISSN 2296-7745
Editore: Frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2020.00189

Tara Oceans: towards global ocean ecosystems biology. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Shinichi Sunagawa; Silvia G. Acinas; Peer Bork; Peer Bork; Chris Bowler; Tara Oceans Coordinators; Damien Eveillard; Gabriel Gorsky; Lionel Guidi; Daniele Iudicone; Eric Karsenti; Fabien Lombard; Hiroyuki Ogata; Stephane Pesant; Matthew B. Sullivan; Patrick Wincker; Colomban de Vargas
Pubblicato in: "Nature Reviews Microbiology, Nature Publishing Group, 2020, 18, pp.428-445. ⟨10.1038/s41579-020-0364-5⟩", Numero 1, 2020, Pagina/e 428-445, ISSN 1740-1534
Editore: Springer
DOI: 10.1038/s41579-020-0364-5

Compendium of 530 metagenome-assembled bacterial and archaeal genomes from the polar Arctic Ocean (si apre in una nuova finestra)

Autori: Royo-Llonch, M., Sánchez, P., Ruiz-González, C., Salazar, G., Pedrós-Alió, C., Sebastián, M., Labadie, K., Paoli, L., Ibarbalz, F. M., Zinger, L., Churcheward, B., Tara Oceans Coordinators, Chaffron, S., Eveillard, D., Karsenti, E., Sunagawa, S., Wincker, P., Karp-Boss, L., Bowler, C. and Acinas, S. G.
Pubblicato in: Nature Microbiology, Numero 6, 2021, Pagina/e 1561-1574, ISSN 2058-5276
Editore: Springer
DOI: 10.1038/s41564-021-00979-9

Carbon Dioxide Concentration Mechanisms in Natural Populations of Marine Diatoms: Insights From Tara Oceans. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Juan José Pierella Karlusich; Juan José Pierella Karlusich; Chris Bowler; Chris Bowler; Haimanti Biswas
Pubblicato in: Frontiers in Marine Sciences, Numero 5, 2021, Pagina/e 657821, ISSN 1664-462X
Editore: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2021.657821

A genomics approach reveals the global genetic polymorphism, structure and functional diversity of ten accessions of the marine model diatom Phaeodactylum tricornutum (si apre in una nuova finestra)

Autori: Rastogi, A., Vieira, F. R. J., Deton-Cabanillas, A.-F., Veluchamy, A., Cantrel, C., Wang, G., Vanormelingen, P., Bowler, C., Piganeau, G., Hu, H. and Tirichine, L.
Pubblicato in: ISME J, Numero 12, 2020, Pagina/e 12345, ISSN 1751-7370
Editore: Springer
DOI: 10.1038/s41396-019-0528-3

Phylogenomic fingerprinting of tempo and functions of horizontal gene transfer within ochrophytes (si apre in una nuova finestra)

Autori: Richard G. Dorrell, Adrien Villain, Benoît Perez-Lamarque, Guillemette Audren de Kerdrel, Giselle McCallum, Andrew K. Watson, Ouardia Ait-Mohamed, Adriana Alberti, Erwann Corre, Kyle R. Frischkorn, Juan J. Pierella Karlusich, Eric Pelletier, Hélène Morlon, Chris Bowler, Guillaume Blanc
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 118/4, 2021, Pagina/e e2009974118, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2009974118

Genome-enabled phylogenetic and functional reconstruction of an araphid pennate diatom Plagiostriata sp. CCMP470, previously assigned as a radial centric diatom, and its bacterial commensal. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Sato, S., Nanjappa, D., Dorrell, R. G., Vieira, F. R. J., Kazamia, E., Tirichine, L., Veluchamy, A., Heilig, R., Aury, J. M., Jaillon, O., Wincker, P., Fussy, Z., Obornik, M., Muñoz-Gómez, S. A., Mann, D. G., Bowler, C. and Zingone, A.
Pubblicato in: Sci Rep, Numero 10, 2020, Pagina/e 9449, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-65941-x

Whole-genome scanning reveals selection mechanisms in epipelagic Chaetoceros diatom populations (si apre in una nuova finestra)

Autori: Nef, C., Madoui, M.-A., Pelletier, E. and Bowler, C.
Pubblicato in: BioRxiv, Numero 12, 2022, Pagina/e 12345, ISSN 2692-8205
Editore: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.05.19.492674

Global drivers of eukaryotic plankton biogeography in the sunlit ocean. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Sommeria-Klein, G., Watteaux, R., Ibarbalz, F. M., Pierella Karlusich, J. J., Iudicone, D., Bowler, C. and Morlon, H.
Pubblicato in: Science, Numero 374, 2021, Pagina/e 594-599, ISSN 1095-9203
Editore: AAAS
DOI: 10.1126/science.abb3717

Diatoms Are Selective Segregators in Global Ocean Planktonic Communities. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Vincent, Flora; Bowler, Chris
Pubblicato in: mSystems, Vol 5, Iss 1 (2020), Numero 3, 2020, Pagina/e 12345, ISSN 1069-5524
Editore: ASM
DOI: 10.1128/msystems.00444-19

Molecular biology for green recovery-A call for action. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Rodríguez-Martínez, M., Nielsen, J., Dupont, S., Vamathevan, J., Glover, B. J., Crosswell, L. C., Rouse, B., Luisi, B. F., Bowler, C., Gasser, S. M., Arendt, D., Erb, T. J., de Lorenzo, V., Heard, E. and Patil, K. R.
Pubblicato in: PLoS Biol, Numero 20, 2022, Pagina/e e3001623, ISSN 1544-9173
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001623

Within-Arctic horizontal gene transfer as a driver of convergent evolution in distantly related microalgae (si apre in una nuova finestra)

Autori: Dorrell, R. G., Kuo, A., Füssy, Z., Richardson, E., Salamov, A., Zarevski, N., Freyria, N. J., Ibarbalz, F. M., Jenkins, J., Pierella Karlusich, J. J., Steindorff, A. S., Edgar, R. E., Handley, L., Lail, K., Lipzen, A., Lombard, V., McFarlane, J., Nef, C., Novák Vanclová, A. M. G., Peng, Y., Plott, C., Potvin, M., Rocha Jimenez Vieira, F., Barry, K., Dacks, J. B., de Vargas, C., Henrissat, B.,
Pubblicato in: BioRxiv, Numero 1, 2022, Pagina/e 12345, ISSN 2692-8205
Editore: BioRxiv
DOI: 10.1101/2021.07.31.454568

Paleo-diatom composition from Santa Barbara Basin deep-sea sediments: a comparison of 18S-V9 and diat-rbcL metabarcoding vs shotgun metagenomics (si apre in una nuova finestra)

Autori: Armbrecht, L., Eisenhofer, R., Utge, J., Sibert, E. C., Rocha, F., Ward, R., Pierella Karlusich, J. J., Tirichine, L., Norris, R., Summers, M. and Bowler, C.
Pubblicato in: ISME Comm, Numero 12, 2021, Pagina/e 12345, ISSN 2730-6151
Editore: Springer
DOI: 10.1038/s43705-021-00070-8

Complex response of the Chlorarachniophyte Bigelowiella natans to iron availability (si apre in una nuova finestra)

Autori: Kotabova, E., Malych, R., Pierella Karlusich, J. J., Kazamia, E., Eichner, M., Mach, J., Lesuisse, E., Bowler, C., Prášil, O. and Sutak, R.
Pubblicato in: mSys, Numero 6, 2021, Pagina/e e00738-00720, ISSN 1823-6782
Editore: Akademi Sains Malaysia
DOI: 10.1128/msystems.00738-20

Heterotrophic bacterial diazotrophs are more abundant than their cyanobacterial counterparts in metagenomes covering most of the sunlit ocean (si apre in una nuova finestra)

Autori: Delmont, T. O., Pierella Karlusich, J. J., Veseli, I., Fuessel, J., Eren, A. M., Foster, R. A., Bowler, C., Wincker, P. and Pelletier, E.
Pubblicato in: ISME J, Numero 16, 2021, Pagina/e 927-936, ISSN 1751-7370
Editore: Springer
DOI: 10.1038/s41396-021-01135-1

Global identification of a marine diatom long noncoding natural antisense transcripts (NATs) and their response to phosphate fluctuations. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Cruz de Carvalho, M. H. and Bowler, C.
Pubblicato in: Sci Rep, Numero 10, 2020, Pagina/e 14110, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-71002-0

Gene Expression Changes and Community Turnover Differentially Shape the Global Ocean Metatranscriptome (si apre in una nuova finestra)

Autori: Salazar, Guillem; Paoli, Lucas; Alberti, Adriana; Huerta-Cepas, Jaime; Ruscheweyh, Hans-Joachim; Cuenca, Miguelangel; Field, Christopher M.; Coelho, Luis Pedro; Cruaud, Corinne; Engelen, Stefan; Gregory, Ann C.; Labadie, Karine; Marec, Claudie; Pelletier, Eric; Royo-Llonch, Marta; Roux, Simon; Sánchez, Pablo; Uehara, Hideya; Zayed, Ahmed A.; Zeller, Georg; Carmichael, Margaux; Dimier, Céline; Fe
Pubblicato in: EISSN: 1097-4172, Numero 3, 2019, Pagina/e 12345, ISSN 1097-4172
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.10.014

PhaeoNet: A Holistic RNAseq-Based Portrait of Transcriptional Coordination in the Model Diatom Phaeodactylum tricornutum. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ouardia Ait-Mohamed; Anna M. G. Novák Vanclová; Nathalie Joli; Yue Liang; Xue Zhao; Xue Zhao; Auguste Genovesio; Leila Tirichine; Leila Tirichine; Chris Bowler; Richard G. Dorrell
Pubblicato in: Frontiers in Plant Science, Vol 11 (2020), Numero 3, 2020, Pagina/e 12345, ISSN 1664-462X
Editore: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2020.590949

Phytoplankton in the Tara Ocean (si apre in una nuova finestra)

Autori: Pierella Karlusich, J. J., Ibarbalz, F. M. and Bowler, C.
Pubblicato in: Annu. Rev. Mar. Sci., Numero 12, 2020, Pagina/e 233-265, ISSN 1941-1405
Editore: Annual Reviews Inc.
DOI: 10.1146/annurev-marine-010419-010706

Environmental vulnerability of the global ocean epipelagic plankton community interactome (si apre in una nuova finestra)

Autori: Samuel Chaffron; Erwan Delage; Marko Budinich; Damien Vintache; Nicolas Henry; Charlotte Nef; Mathieu Ardyna; Mathieu Ardyna; Ahmed A. Zayed; Pedro C. Junger; Pierre E. Galand; Connie Lovejoy; Alison E. Murray; Hugo Sarmento; Tara Oceans Coordinators; Silvia G. Acinas; Marcel Babin; Marcel Babin; Daniele Iudicone; Olivier Jaillon; Eric Karsenti; Patrick Wincker; Lee Karp-Boss; Matthew B. Sullivan;
Pubblicato in: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03458184, Numero 2, 2021, Pagina/e 12345, ISSN 2375-2548
Editore: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.abg1921

Iron metabolism strategies in diatoms (si apre in una nuova finestra)

Autori: Gao, X., Bowler, C. and Kazamia, E.
Pubblicato in: J Exp Bot, Numero 72, 2021, Pagina/e 2165-2180, ISSN 0022-0957
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/eraa575

Biosynthetic potential of the global ocean microbiome (si apre in una nuova finestra)

Autori: Paoli, L., Ruscheweyh, H.-J., Forneris, C. C., Hubrich. F., Kautsar, S., Bhushan, A., Lotti, A., Clayssen, Q., Salazar, G., Milanese, A., Carlström, C. I., Papadopoulou, C., Gehrig, D., Karasikov, M., Mustafa, H., Larralde, M., Carroll, L. M., Sánchez, P., Zayed, A. A., Cronin, D. R., Acinas, S. G., Bork, P., Bowler, C., Delmont, T. O., Gasol, J. M., Gossert, A. D., Kahles, A., Sullivan, M. B.,
Pubblicato in: Nature, Numero 607, 2022, Pagina/e 111-118, ISSN 1476-4687
Editore: Springer
DOI: 10.1038/s41586-022-04862-3

Global distribution patterns of marine nitrogen-fixers by imaging and molecular methods (si apre in una nuova finestra)

Autori: Juan José Pierella Karlusich; Eric Pelletier; Fabien Lombard; Madeline Carsique; Etienne Dvorak; Sébastien Colin; Marc Picheral; Francisco M. Cornejo-Castillo; Silvia G. Acinas; Rainer Pepperkok; Eric Karsenti; Colomban de Vargas; Patrick Wincker; Chris Bowler; Rachel A Foster
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 1, 2021, Pagina/e 12345, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.10.17.343731

È in corso la ricerca di dati su OpenAIRE...

Si è verificato un errore durante la ricerca dei dati su OpenAIRE

Nessun risultato disponibile

Condividi questa pagina Condividi questa pagina sui social network

Scarica Scarica il contenuto della pagina

Ultimo aggiornamento: 1 Settembre 2025

Il mio fascicolo

Permalink: https://cordis.europa.eu/project/id/835067/results/it

European Union, 2026

Il mio fascicolo 0 0