Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
CORDIScovery podcast 50th episode CORDIScovery podcast 50th episode

Untangling eco-evolutionary impacts on diatom genomes over timescales relevant to current climate change

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (37)
A roadmap for using the UN Decade of Ocean Science for Sustainable Development in support of science, policy, and action. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Claudet, J., Bopp, L., Cheung, W. W. L., Devillers, R., Escobar-Briones, E., Haugan, P., Heymans, J. H., Masson-Delmotte, V., Matz-Luck, N., Miloslavich, P., Mullineaux, L., Visbeck, M., Watson, R., Zivian, A. M., Ansorge, I., Araujo, M., Arico, S., Bailly, D., Barbière, J., Barnerias, C., Bowler, C., Brun, V., Cazenave, A., Diver, C., Euzen, A., Thierno Gaye, A., Hilmi, N., Ménard, F., Moulin,
Opublikowane w: One Earth, Numer 1, 2020, Strona(/y) 123, ISSN 2590-3330
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.oneear.2019.10.012

Macroscale patterns of oceanic zooplankton composition and size structure. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Brandão, M. C., Benedetti, F., Martini, S., Soviadan, Y. D., Irisson, J. O., Romagnan, J. B., Elineau, A., Desnos, C., Jalabert, L., Freire, A. S., Picheral, M., Guidi, L., Gorsky, G., Bowler, C., Karp-Boss, L., Henry, N., de Vargas, C., Sullivan, M. B., Tara Oceans Consortium Coordinators, Stemmann, L. and Lombard, F.
Opublikowane w: Sci Rep, Numer 11, 2021, Strona(/y) 15714, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-94615-5

Global Trends in Marine Plankton Diversity across Kingdoms of Life. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ibarbalz, Federico M.; Henry, Nicolas; Brandão, Manoela C.; Martini, Séverine; Busseni, Greta; Byrne, Hannah; Coelho, Luis Pedro; Endo, Hisashi; Gasol, Josep M.; Gregory, Ann C.; Mahé, Frédéric; Rigonato, Janaina; Royo-Llonch, Marta; Salazar, Guillem; Sanz-Sáez, Isabel; Scalco, Eleonora; Soviadan, Dodji; Zayed, Ahmed A.; Zingone, Adriana; Labadie, Karine; Ferland, Joannie; Marec, Claudie; Ka
Opublikowane w: EISSN: 1097-4172, Numer 3, 2019, Strona(/y) 12345, ISSN 1097-4172
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.3929/ethz-b-000378196

Large scale patterns of marine diatom richness: Drivers and trends in a changing ocean (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Busseni, G., Caputi, L., Piredda, R., Fremont, P., Mele, B. H., Campese, L., Scalco, E., de Vargas, C., Bowler, C., d'Ovidio, F., Zingone, A., Ribera d’Alcalà, M. Iudicone, D.
Opublikowane w: Global Ecol. Biogeo., Numer 1, 2020, Strona(/y) 1-14, ISSN 1466-822X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/geb.13161

Priorities for ocean microbiome research (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tara Ocean Foundation, Tara Oceans, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), European Marine Biological Resource Centre - European Research Infrastructure Consortium (EMBRC-ERIC). Corresponding author Bowler, C.
Opublikowane w: Nature Microbiology, Numer 7, 2022, Strona(/y) 937-947, ISSN 2058-5276
Wydawca: Springer
DOI: 10.1038/s41564-022-01145-5

Exploration of marine phytoplankton: from their historical appreciation to the omics era. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pierella Karlusich, J. J., Ibarbalz, F. M. and Bowler, C.
Opublikowane w: J Plankton Res, Numer 42, 2020, Strona(/y) 595-612, ISSN 0142-7873
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/plankt/fbaa049

Functional repertoire convergence of distantly related eukaryotic plankton lineages abundant in the sunlit ocean (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Delmont, T. O., Gaia, M., Hinsinger, D. D., Fremont, P., Vanni, C., Fernandez Guerra, A., Eren, A. M., Kourlaiev, A., d’Agata, L., Clayssen, Q., et al.
Opublikowane w: Cell Genomics, Numer 2, 2022, Strona(/y) 12345, ISSN 2666-979X
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1101/2020.10.15.341214

Genome wide natural variation of H3K27me3 selectively marks genes predicted to be important for cell differentiation in Phaeodactylum tricornutum (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Zhao, X, Rastogi A., Deton Cabanillas, A. F., Ait Mohamed, O., Cantrel, C., Lombard, B., Murik, O., Genovesio, A., Bowler, C., Bouyer, D., Loew, D., Lin, X., Veluchamy, A., Vieira, F. R. J. and Tirichine, L.
Opublikowane w: New Phytol, Numer 12, 2021, Strona(/y) 12345, ISSN 0028-646X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17129

The possible fates of Fragilariopsis cylindrus (polar diatom) cells exposed to prolonged darkness (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sciandra, T., Forget, M. H., Bruyant, F., Béguin, M., Lacour, T., Bowler, C. and Babin, M.
Opublikowane w: J Phycol, Numer 12, 2022, Strona(/y) 12345, ISSN 0022-3646
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jpy.13232

Genome-wide analysis of allele-specific expression of genes in the model diatom Phaeodactylum tricornutum. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hoguin, A., Rastogi, A. and Bowler, C. and Tirichine, L.
Opublikowane w: Sci Rep, Numer 11, 2021, Strona(/y) 2954, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-82529-1

Mitotic recombination between homologous chromosomes drives genomic diversity in diatoms. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Bulankova, P., Sekulić, M., Jallet, D., Nef, C., van Oosterhout, C., Delmont, T. O., Vercauteren, I., Osuna-Cruz, C. M., Vancaester, E., Mock, T., Sabbe, K., Daboussi, F., Bowler, C., Vyverman, W., Vandepoele, K. and De Veylder, L.
Opublikowane w: Curr Biol, Numer S0960-9822(21)00672-2, 2021, Strona(/y) S0960-9822(21)00672-2, ISSN 0960-9822
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2021.05.013

Contribution of genome-scale metabolic modelling to niche theory (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Régimbeau, A., Budinich, M., Larhlimi, A., Pierella Karlusich, J. J., Aumont, O., Memery, L., Bowler, C. and Eveillard, D.
Opublikowane w: Ecol Lett, Numer 25, 2022, Strona(/y) 1352-1364, ISSN 1461-023X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ele.13954

A robust approach to estimate relative phytoplankton cell abundances from metagenomes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Juan José Pierella Karlusich; Eric Pelletier; Lucie Zinger; Fabien Lombard; Adriana Zingone; Sébastien Colin; Josep M. Gasol; Richard G. Dorrell; Nicolas Henry; Eleonora Scalco; Silvia G. Acinas; Patrick Wincker; Colomban Vargas; Chris Bowler
Opublikowane w: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03559541, Numer 1, 2022, Strona(/y) 123, ISSN 1755-0998
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1111/1755-0998.13592

Coupling imaging and omics in plankton surveys: State-of-the-art, challenges, and future directions (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pierella Karlusich, J. J., Lombard, F., Irisson, J.-O., Bowler, C. and Foster, R. A.
Opublikowane w: Frontiers Mar Sci, Numer 9, 2022, Strona(/y) 878803, ISSN 2296-7745
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2022.878803

Probing the diversity of Polycomb and Trithorax proteins in cultured and environmentally sampled microalgae. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Zhao, X., Deton Cabanillas, A.-F., Veluchamy, A., Bowler, C., Vieira, F. R. J. and Tirichine, L.
Opublikowane w: Frontiers Mar Sci, Numer 12, 2020, Strona(/y) 12345, ISSN 2296-7745
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2020.00189

Tara Oceans: towards global ocean ecosystems biology. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Shinichi Sunagawa; Silvia G. Acinas; Peer Bork; Peer Bork; Chris Bowler; Tara Oceans Coordinators; Damien Eveillard; Gabriel Gorsky; Lionel Guidi; Daniele Iudicone; Eric Karsenti; Fabien Lombard; Hiroyuki Ogata; Stephane Pesant; Matthew B. Sullivan; Patrick Wincker; Colomban de Vargas
Opublikowane w: "Nature Reviews Microbiology, Nature Publishing Group, 2020, 18, pp.428-445. ⟨10.1038/s41579-020-0364-5⟩", Numer 1, 2020, Strona(/y) 428-445, ISSN 1740-1534
Wydawca: Springer
DOI: 10.1038/s41579-020-0364-5

Compendium of 530 metagenome-assembled bacterial and archaeal genomes from the polar Arctic Ocean (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Royo-Llonch, M., Sánchez, P., Ruiz-González, C., Salazar, G., Pedrós-Alió, C., Sebastián, M., Labadie, K., Paoli, L., Ibarbalz, F. M., Zinger, L., Churcheward, B., Tara Oceans Coordinators, Chaffron, S., Eveillard, D., Karsenti, E., Sunagawa, S., Wincker, P., Karp-Boss, L., Bowler, C. and Acinas, S. G.
Opublikowane w: Nature Microbiology, Numer 6, 2021, Strona(/y) 1561-1574, ISSN 2058-5276
Wydawca: Springer
DOI: 10.1038/s41564-021-00979-9

Carbon Dioxide Concentration Mechanisms in Natural Populations of Marine Diatoms: Insights From Tara Oceans. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Juan José Pierella Karlusich; Juan José Pierella Karlusich; Chris Bowler; Chris Bowler; Haimanti Biswas
Opublikowane w: Frontiers in Marine Sciences, Numer 5, 2021, Strona(/y) 657821, ISSN 1664-462X
Wydawca: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2021.657821

A genomics approach reveals the global genetic polymorphism, structure and functional diversity of ten accessions of the marine model diatom Phaeodactylum tricornutum (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rastogi, A., Vieira, F. R. J., Deton-Cabanillas, A.-F., Veluchamy, A., Cantrel, C., Wang, G., Vanormelingen, P., Bowler, C., Piganeau, G., Hu, H. and Tirichine, L.
Opublikowane w: ISME J, Numer 12, 2020, Strona(/y) 12345, ISSN 1751-7370
Wydawca: Springer
DOI: 10.1038/s41396-019-0528-3

Phylogenomic fingerprinting of tempo and functions of horizontal gene transfer within ochrophytes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Richard G. Dorrell, Adrien Villain, Benoît Perez-Lamarque, Guillemette Audren de Kerdrel, Giselle McCallum, Andrew K. Watson, Ouardia Ait-Mohamed, Adriana Alberti, Erwann Corre, Kyle R. Frischkorn, Juan J. Pierella Karlusich, Eric Pelletier, Hélène Morlon, Chris Bowler, Guillaume Blanc
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 118/4, 2021, Strona(/y) e2009974118, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2009974118

Genome-enabled phylogenetic and functional reconstruction of an araphid pennate diatom Plagiostriata sp. CCMP470, previously assigned as a radial centric diatom, and its bacterial commensal. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sato, S., Nanjappa, D., Dorrell, R. G., Vieira, F. R. J., Kazamia, E., Tirichine, L., Veluchamy, A., Heilig, R., Aury, J. M., Jaillon, O., Wincker, P., Fussy, Z., Obornik, M., Muñoz-Gómez, S. A., Mann, D. G., Bowler, C. and Zingone, A.
Opublikowane w: Sci Rep, Numer 10, 2020, Strona(/y) 9449, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-65941-x

Whole-genome scanning reveals selection mechanisms in epipelagic Chaetoceros diatom populations (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nef, C., Madoui, M.-A., Pelletier, E. and Bowler, C.
Opublikowane w: BioRxiv, Numer 12, 2022, Strona(/y) 12345, ISSN 2692-8205
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.05.19.492674

Global drivers of eukaryotic plankton biogeography in the sunlit ocean. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sommeria-Klein, G., Watteaux, R., Ibarbalz, F. M., Pierella Karlusich, J. J., Iudicone, D., Bowler, C. and Morlon, H.
Opublikowane w: Science, Numer 374, 2021, Strona(/y) 594-599, ISSN 1095-9203
Wydawca: AAAS
DOI: 10.1126/science.abb3717

Diatoms Are Selective Segregators in Global Ocean Planktonic Communities. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Vincent, Flora; Bowler, Chris
Opublikowane w: mSystems, Vol 5, Iss 1 (2020), Numer 3, 2020, Strona(/y) 12345, ISSN 1069-5524
Wydawca: ASM
DOI: 10.1128/msystems.00444-19

Molecular biology for green recovery-A call for action. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rodríguez-Martínez, M., Nielsen, J., Dupont, S., Vamathevan, J., Glover, B. J., Crosswell, L. C., Rouse, B., Luisi, B. F., Bowler, C., Gasser, S. M., Arendt, D., Erb, T. J., de Lorenzo, V., Heard, E. and Patil, K. R.
Opublikowane w: PLoS Biol, Numer 20, 2022, Strona(/y) e3001623, ISSN 1544-9173
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001623

Within-Arctic horizontal gene transfer as a driver of convergent evolution in distantly related microalgae (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Dorrell, R. G., Kuo, A., Füssy, Z., Richardson, E., Salamov, A., Zarevski, N., Freyria, N. J., Ibarbalz, F. M., Jenkins, J., Pierella Karlusich, J. J., Steindorff, A. S., Edgar, R. E., Handley, L., Lail, K., Lipzen, A., Lombard, V., McFarlane, J., Nef, C., Novák Vanclová, A. M. G., Peng, Y., Plott, C., Potvin, M., Rocha Jimenez Vieira, F., Barry, K., Dacks, J. B., de Vargas, C., Henrissat, B.,
Opublikowane w: BioRxiv, Numer 1, 2022, Strona(/y) 12345, ISSN 2692-8205
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2021.07.31.454568

Paleo-diatom composition from Santa Barbara Basin deep-sea sediments: a comparison of 18S-V9 and diat-rbcL metabarcoding vs shotgun metagenomics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Armbrecht, L., Eisenhofer, R., Utge, J., Sibert, E. C., Rocha, F., Ward, R., Pierella Karlusich, J. J., Tirichine, L., Norris, R., Summers, M. and Bowler, C.
Opublikowane w: ISME Comm, Numer 12, 2021, Strona(/y) 12345, ISSN 2730-6151
Wydawca: Springer
DOI: 10.1038/s43705-021-00070-8

Complex response of the Chlorarachniophyte Bigelowiella natans to iron availability (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Kotabova, E., Malych, R., Pierella Karlusich, J. J., Kazamia, E., Eichner, M., Mach, J., Lesuisse, E., Bowler, C., Prášil, O. and Sutak, R.
Opublikowane w: mSys, Numer 6, 2021, Strona(/y) e00738-00720, ISSN 1823-6782
Wydawca: Akademi Sains Malaysia
DOI: 10.1128/msystems.00738-20

Heterotrophic bacterial diazotrophs are more abundant than their cyanobacterial counterparts in metagenomes covering most of the sunlit ocean (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Delmont, T. O., Pierella Karlusich, J. J., Veseli, I., Fuessel, J., Eren, A. M., Foster, R. A., Bowler, C., Wincker, P. and Pelletier, E.
Opublikowane w: ISME J, Numer 16, 2021, Strona(/y) 927-936, ISSN 1751-7370
Wydawca: Springer
DOI: 10.1038/s41396-021-01135-1

Global identification of a marine diatom long noncoding natural antisense transcripts (NATs) and their response to phosphate fluctuations. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cruz de Carvalho, M. H. and Bowler, C.
Opublikowane w: Sci Rep, Numer 10, 2020, Strona(/y) 14110, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-71002-0

Gene Expression Changes and Community Turnover Differentially Shape the Global Ocean Metatranscriptome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Salazar, Guillem; Paoli, Lucas; Alberti, Adriana; Huerta-Cepas, Jaime; Ruscheweyh, Hans-Joachim; Cuenca, Miguelangel; Field, Christopher M.; Coelho, Luis Pedro; Cruaud, Corinne; Engelen, Stefan; Gregory, Ann C.; Labadie, Karine; Marec, Claudie; Pelletier, Eric; Royo-Llonch, Marta; Roux, Simon; Sánchez, Pablo; Uehara, Hideya; Zayed, Ahmed A.; Zeller, Georg; Carmichael, Margaux; Dimier, Céline; Fe
Opublikowane w: EISSN: 1097-4172, Numer 3, 2019, Strona(/y) 12345, ISSN 1097-4172
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.10.014

PhaeoNet: A Holistic RNAseq-Based Portrait of Transcriptional Coordination in the Model Diatom Phaeodactylum tricornutum. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ouardia Ait-Mohamed; Anna M. G. Novák Vanclová; Nathalie Joli; Yue Liang; Xue Zhao; Xue Zhao; Auguste Genovesio; Leila Tirichine; Leila Tirichine; Chris Bowler; Richard G. Dorrell
Opublikowane w: Frontiers in Plant Science, Vol 11 (2020), Numer 3, 2020, Strona(/y) 12345, ISSN 1664-462X
Wydawca: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2020.590949

Phytoplankton in the Tara Ocean (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pierella Karlusich, J. J., Ibarbalz, F. M. and Bowler, C.
Opublikowane w: Annu. Rev. Mar. Sci., Numer 12, 2020, Strona(/y) 233-265, ISSN 1941-1405
Wydawca: Annual Reviews Inc.
DOI: 10.1146/annurev-marine-010419-010706

Environmental vulnerability of the global ocean epipelagic plankton community interactome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Samuel Chaffron; Erwan Delage; Marko Budinich; Damien Vintache; Nicolas Henry; Charlotte Nef; Mathieu Ardyna; Mathieu Ardyna; Ahmed A. Zayed; Pedro C. Junger; Pierre E. Galand; Connie Lovejoy; Alison E. Murray; Hugo Sarmento; Tara Oceans Coordinators; Silvia G. Acinas; Marcel Babin; Marcel Babin; Daniele Iudicone; Olivier Jaillon; Eric Karsenti; Patrick Wincker; Lee Karp-Boss; Matthew B. Sullivan;
Opublikowane w: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03458184, Numer 2, 2021, Strona(/y) 12345, ISSN 2375-2548
Wydawca: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.abg1921

Iron metabolism strategies in diatoms (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gao, X., Bowler, C. and Kazamia, E.
Opublikowane w: J Exp Bot, Numer 72, 2021, Strona(/y) 2165-2180, ISSN 0022-0957
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/eraa575

Biosynthetic potential of the global ocean microbiome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Paoli, L., Ruscheweyh, H.-J., Forneris, C. C., Hubrich. F., Kautsar, S., Bhushan, A., Lotti, A., Clayssen, Q., Salazar, G., Milanese, A., Carlström, C. I., Papadopoulou, C., Gehrig, D., Karasikov, M., Mustafa, H., Larralde, M., Carroll, L. M., Sánchez, P., Zayed, A. A., Cronin, D. R., Acinas, S. G., Bork, P., Bowler, C., Delmont, T. O., Gasol, J. M., Gossert, A. D., Kahles, A., Sullivan, M. B.,
Opublikowane w: Nature, Numer 607, 2022, Strona(/y) 111-118, ISSN 1476-4687
Wydawca: Springer
DOI: 10.1038/s41586-022-04862-3

Global distribution patterns of marine nitrogen-fixers by imaging and molecular methods (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Juan José Pierella Karlusich; Eric Pelletier; Fabien Lombard; Madeline Carsique; Etienne Dvorak; Sébastien Colin; Marc Picheral; Francisco M. Cornejo-Castillo; Silvia G. Acinas; Rainer Pepperkok; Eric Karsenti; Colomban de Vargas; Patrick Wincker; Chris Bowler; Rachel A Foster
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 1, 2021, Strona(/y) 12345, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.10.17.343731

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Udostępnij tę stronę Udostępnij tę stronę w mediach społecznościowych

Pobierz Pobierz zawartość strony

Ostatnia aktualizacja: 1 Września 2025

Moja broszura

Permalink: https://cordis.europa.eu/project/id/835067/results/pl

European Union, 2026

Moja broszura 0 0