Bright, coherent and focused light to resolve neural circuits

Projektinformationen

BRILLIANCE

ID Finanzhilfevereinbarung: 852455

DOI

10.3030/852455

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 28 Februar 2020

Startdatum 1 März 2020

Enddatum 28 Februar 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 430 275,00

EU-Beitrag

€ 1 430 275,00

Koordiniert durch

EUROPEAN SYNCHROTRON RADIATION FACILITY
France

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Open Research Data Pilot

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (10)

Dense neuronal reconstruction through X-ray holographic nano-tomography

Autoren: Aaron T. Kuan, Jasper S. Phelps, Logan A. Thomas, Tri M. Nguyen, Julie Han, Chiao-Lin Chen, Anthony W. Azevedo, John C. Tuthill, Jan Funke, Peter Cloetens, Alexandra Pacureanu, Wei-Chung Allen Lee
Veröffentlicht in: Nature Neuroscience, Ausgabe 23/12, 2020, Seite(n) 1637-1643, ISSN 1097-6256
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-020-0704-9

Functional and multiscale 3D structural investigation of brain tissue through correlative in vivo physiology, synchrotron microtomography and volume electron microscopy

Autoren: Carles Bosch, Tobias Ackels, Alexandra Pacureanu, Yuxin Zhang, Christopher J. Peddie, Manuel Berning, Norman Rzepka, Marie-Christine Zdora, Isabell Whiteley, Malte Storm, Anne Bonnin, Christoph Rau, Troy Margrie, Lucy Collinson & Andreas T. Schaefer
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 20411723, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30199-6

Sample Preparation and Warping Accuracy for Correlative Multimodal Imaging in the Mouse Olfactory Bulb Using 2-Photon, Synchrotron X-Ray and Volume Electron Microscopy

Autoren: Yuxin Zhang, Tobias Ackels, Alexandra Pacureanu, Marie-Christine Zdora, Anne Bonnin, Andreas T Schaefer, Carles Bosch
Veröffentlicht in: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Ausgabe 2296634X, 2022, ISSN 2296-634X
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fcell.2022.880696

Biomechanical origins of proprioceptor feature selectivity and topographic maps in the Drosophila leg

Autoren: Akira Mamiya, Anne Sustar, Igor Siwanowicz, Yanyan Qi, Tzu-Chiao Lu, Pralaksha Gurung, Chenghao Chen, Jasper S. Phelps, Aaron T. Kuan, Alexandra Pacureanu, Wei-Chung Allen Lee, Hongjie Li, Natasha Mhatre, John C. Tuthill
Veröffentlicht in: Neuron, Ausgabe 111, 2024, Seite(n) 3230-3243.e14, ISSN 0896-6273
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2023.07.009

Nondestructive X-ray tomography of brain tissue ultrastructure

Autoren: Carles Bosch, Tomas Aidukas, Mirko Holler, Alexandra Pacureanu, Elisabeth Müller, Christopher J. Peddie, Yuxin Zhang, Phil Cook, Lucy Collinson, Oliver Bunk, Andreas Menzel, Manuel Guizar-Sicairos, Gabriel Aeppli, Ana Diaz, Adrian A. Wanner, Andreas T. Schaefer
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 22, 2025, Seite(n) 2631-2638, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-025-02891-0

Connectomic reconstruction of a female Drosophila ventral nerve cord

Autoren: Anthony Azevedo, Ellen Lesser, Jasper S. Phelps, Brandon Mark, Leila Elabbady, Sumiya Kuroda, Anne Sustar, Anthony Moussa, Avinash Khandelwal, Chris J. Dallmann, Sweta Agrawal, Su-Yee J. Lee, Brandon Pratt, Andrew Cook, Kyobi Skutt-Kakaria, Stephan Gerhard, Ran Lu, Nico Kemnitz, Kisuk Lee, Akhilesh Halageri, Manuel Castro, Dodam Ih, Jay Gager, Marwan Tammam, Sven Dorkenwald, Forrest Collman, Casey
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 631, 2024, Seite(n) 360-368, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07389-x

Scaling up X-ray holographic nanotomography for neuronal tissue imaging

Autoren: Jayde Livingstone, Carles Bosch, Aaron T. Kuan, Lucas Benoït, Paolo Busca, Thierry Martin, Mohd F. E. B. Mazri, Wangchu Xiang, Wei-Chung Allen Lee, Andreas T. Schaefer, Peter Cloetens, Alexandra Pacureanu
Veröffentlicht in: Biomedical Optics Express, Ausgabe 16, 2025, Seite(n) 2047, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.559263

Femtosecond laser preparation of resin embedded samples for correlative microscopy workflows in life sciences

Autoren: C Bosch, J Lindenau, A Pacureanu, CJ Peddie, M Majkut, AC Douglas, R Carzaniga, A Rack, L Collinson, AT Schaefer, H Stegmann
Veröffentlicht in: Applied Physiscs Letters, 2024, ISSN 1077-3118
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1101/2023.01.10.523473

Critical point drying of brain tissue for X-ray phase-contrast imaging

Autoren: Safe Khan, Jonas Albers, Artem Vorobyev, Yuxin Zhang, Jakob Reichmann, Angelika Svetlove, Fabio De Marco, Ksenia Denisova, Yikai Yang, Florent Seichepine, James O. Douglas, Elizabeth Duke, Peter Cloetens, Alexandra Pacureanu, Andreas T. Schaefer, Carles Bosch
Veröffentlicht in: Journal of Synchrotron Radiation, Ausgabe 33, 2026, Seite(n) 759-768, ISSN 1600-5775
Herausgeber: International Union of Crystallography (IUCr)
DOI: 10.1107/s1600577526001402

Experimental comparison of X-ray ptychographic and holographic nanotomography of metal-stained neuronal tissue

Autoren: Alexandra Pacureanu, Thomas Thies, Carles Bosch, Mirko Holler, Manuel Guizar-Sicairos, Elisabeth Müller, Joakim Reuteler, Dmitry Karpov, Andreas T. Schaefer, Peter Cloetens, Andreas Menzel, Ana Diaz
Veröffentlicht in: Optics Express, Ausgabe 33, 2025, Seite(n) 26915, ISSN 1094-4087
Herausgeber: Optical Society of America
DOI: 10.1364/oe.563186

Conference proceedings (3)

The XPRESS Challenge: Xray Projectomic Reconstruction -- Extracting Segmentation with Skeletons

Autoren: Nguyen, Tri; Narwani, Mukul; Larson, Mark; Li, Yicong; Xie, Shuhan; Pfister, Hanspeter; Wei, Donglai; Shavit, Nir; Mi, Lu; Pacureanu, Alexandra; Lee, Wei-Chung; Kuan, Aaron T.
Veröffentlicht in: 2023 IEEE 20th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Ausgabe 1, 2023
Herausgeber: IEEE

MAE-XNT: A Foundation Model for Segmenting Neuronal Tissue VolumesGenerated with X-Ray Nanotomography

Autoren: Alfred Laugros, Sebastien Roig, Alexandra Pacureanu
Veröffentlicht in: Computer Vision and Pattern Recognition, 2026
Herausgeber: IEEE

X-Ray2EM: Uncertainty-Aware Cross-Modality Image Reconstruction from X-Ray to Electron Microscopy in Connectomics

Autoren: Yicong Li, Yaron Meirovitch, Aaron T. Kuan, Jasper S. Phelps, Alexandra Pacureanu, Wei-Chung Allen Lee, Nir Shavit, Lu Mi
Veröffentlicht in: 2023 IEEE 20th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2023, Seite(n) 1-5
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/isbi53787.2023.10230759

Other (2)

Self-supervised image restoration in coherent X-ray neuronal microscopy

Autoren: Alfred Laugros, Peter Cloetens, Carles Bosch, Richard Schoonhoven, Liam Pavlovic, Aaron T. Kuan, Jayde Livingstone, Yuxin Zhang, Minsu Kim, Allard Hendriksen, Mirko Holler, Adrian A. Wanner, Anthony Azevedo, K. Joost Batenburg, John C. Tuthill, Wei-Chung Allen Lee, Andreas T. Schaefer, Nicola Vigano, Alexandra Pacureanu
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.02.10.633538

Structure-Function Mapping of Olfactory Bulb Circuits with Synchrotron X-ray Nanotomography

Autoren: Yuxin Zhang, Carles Bosch, Tobias Ackels, Alfred Laugros, Anne Bonnin, Jayde Livingstone, Carsten Waltenberg, Manuel Berning, Sina Tootoonian, Mihaly Kollo, Andrea Nathansen, Norman Rzepka, Peter Cloetens, Alexandra Pacureanu, Andreas T. Schaefer
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.04.24.650439