Bright, coherent and focused light to resolve neural circuits

Informacje na temat projektu

BRILLIANCE

Identyfikator umowy o grant: 852455

DOI

10.3030/852455

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 28 Lutego 2020

Data rozpoczęcia 1 Marca 2020

Data zakończenia 28 Lutego 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 430 275,00

Wkład UE

€ 1 430 275,00

Koordynowany przez

EUROPEAN SYNCHROTRON RADIATION FACILITY
France

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Open Research Data Pilot

Publikacje

Peer reviewed articles (10)

Dense neuronal reconstruction through X-ray holographic nano-tomography

Autorzy: Aaron T. Kuan, Jasper S. Phelps, Logan A. Thomas, Tri M. Nguyen, Julie Han, Chiao-Lin Chen, Anthony W. Azevedo, John C. Tuthill, Jan Funke, Peter Cloetens, Alexandra Pacureanu, Wei-Chung Allen Lee
Opublikowane w: Nature Neuroscience, Numer 23/12, 2020, Strona(/y) 1637-1643, ISSN 1097-6256
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-020-0704-9

Functional and multiscale 3D structural investigation of brain tissue through correlative in vivo physiology, synchrotron microtomography and volume electron microscopy

Autorzy: Carles Bosch, Tobias Ackels, Alexandra Pacureanu, Yuxin Zhang, Christopher J. Peddie, Manuel Berning, Norman Rzepka, Marie-Christine Zdora, Isabell Whiteley, Malte Storm, Anne Bonnin, Christoph Rau, Troy Margrie, Lucy Collinson & Andreas T. Schaefer
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 20411723, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30199-6

Sample Preparation and Warping Accuracy for Correlative Multimodal Imaging in the Mouse Olfactory Bulb Using 2-Photon, Synchrotron X-Ray and Volume Electron Microscopy

Autorzy: Yuxin Zhang, Tobias Ackels, Alexandra Pacureanu, Marie-Christine Zdora, Anne Bonnin, Andreas T Schaefer, Carles Bosch
Opublikowane w: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Numer 2296634X, 2022, ISSN 2296-634X
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fcell.2022.880696

Biomechanical origins of proprioceptor feature selectivity and topographic maps in the Drosophila leg

Autorzy: Akira Mamiya, Anne Sustar, Igor Siwanowicz, Yanyan Qi, Tzu-Chiao Lu, Pralaksha Gurung, Chenghao Chen, Jasper S. Phelps, Aaron T. Kuan, Alexandra Pacureanu, Wei-Chung Allen Lee, Hongjie Li, Natasha Mhatre, John C. Tuthill
Opublikowane w: Neuron, Numer 111, 2024, Strona(/y) 3230-3243.e14, ISSN 0896-6273
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2023.07.009

Nondestructive X-ray tomography of brain tissue ultrastructure

Autorzy: Carles Bosch, Tomas Aidukas, Mirko Holler, Alexandra Pacureanu, Elisabeth Müller, Christopher J. Peddie, Yuxin Zhang, Phil Cook, Lucy Collinson, Oliver Bunk, Andreas Menzel, Manuel Guizar-Sicairos, Gabriel Aeppli, Ana Diaz, Adrian A. Wanner, Andreas T. Schaefer
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 22, 2025, Strona(/y) 2631-2638, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-025-02891-0

Connectomic reconstruction of a female Drosophila ventral nerve cord

Autorzy: Anthony Azevedo, Ellen Lesser, Jasper S. Phelps, Brandon Mark, Leila Elabbady, Sumiya Kuroda, Anne Sustar, Anthony Moussa, Avinash Khandelwal, Chris J. Dallmann, Sweta Agrawal, Su-Yee J. Lee, Brandon Pratt, Andrew Cook, Kyobi Skutt-Kakaria, Stephan Gerhard, Ran Lu, Nico Kemnitz, Kisuk Lee, Akhilesh Halageri, Manuel Castro, Dodam Ih, Jay Gager, Marwan Tammam, Sven Dorkenwald, Forrest Collman, Casey
Opublikowane w: Nature, Numer 631, 2024, Strona(/y) 360-368, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07389-x

Scaling up X-ray holographic nanotomography for neuronal tissue imaging

Autorzy: Jayde Livingstone, Carles Bosch, Aaron T. Kuan, Lucas Benoït, Paolo Busca, Thierry Martin, Mohd F. E. B. Mazri, Wangchu Xiang, Wei-Chung Allen Lee, Andreas T. Schaefer, Peter Cloetens, Alexandra Pacureanu
Opublikowane w: Biomedical Optics Express, Numer 16, 2025, Strona(/y) 2047, ISSN 2156-7085
Wydawca: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.559263

Femtosecond laser preparation of resin embedded samples for correlative microscopy workflows in life sciences

Autorzy: C Bosch, J Lindenau, A Pacureanu, CJ Peddie, M Majkut, AC Douglas, R Carzaniga, A Rack, L Collinson, AT Schaefer, H Stegmann
Opublikowane w: Applied Physiscs Letters, 2024, ISSN 1077-3118
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1101/2023.01.10.523473

Critical point drying of brain tissue for X-ray phase-contrast imaging

Autorzy: Safe Khan, Jonas Albers, Artem Vorobyev, Yuxin Zhang, Jakob Reichmann, Angelika Svetlove, Fabio De Marco, Ksenia Denisova, Yikai Yang, Florent Seichepine, James O. Douglas, Elizabeth Duke, Peter Cloetens, Alexandra Pacureanu, Andreas T. Schaefer, Carles Bosch
Opublikowane w: Journal of Synchrotron Radiation, Numer 33, 2026, Strona(/y) 759-768, ISSN 1600-5775
Wydawca: International Union of Crystallography (IUCr)
DOI: 10.1107/s1600577526001402

Experimental comparison of X-ray ptychographic and holographic nanotomography of metal-stained neuronal tissue

Autorzy: Alexandra Pacureanu, Thomas Thies, Carles Bosch, Mirko Holler, Manuel Guizar-Sicairos, Elisabeth Müller, Joakim Reuteler, Dmitry Karpov, Andreas T. Schaefer, Peter Cloetens, Andreas Menzel, Ana Diaz
Opublikowane w: Optics Express, Numer 33, 2025, Strona(/y) 26915, ISSN 1094-4087
Wydawca: Optical Society of America
DOI: 10.1364/oe.563186

Conference proceedings (3)

The XPRESS Challenge: Xray Projectomic Reconstruction -- Extracting Segmentation with Skeletons

Autorzy: Nguyen, Tri; Narwani, Mukul; Larson, Mark; Li, Yicong; Xie, Shuhan; Pfister, Hanspeter; Wei, Donglai; Shavit, Nir; Mi, Lu; Pacureanu, Alexandra; Lee, Wei-Chung; Kuan, Aaron T.
Opublikowane w: 2023 IEEE 20th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Numer 1, 2023
Wydawca: IEEE

MAE-XNT: A Foundation Model for Segmenting Neuronal Tissue VolumesGenerated with X-Ray Nanotomography

Autorzy: Alfred Laugros, Sebastien Roig, Alexandra Pacureanu
Opublikowane w: Computer Vision and Pattern Recognition, 2026
Wydawca: IEEE

X-Ray2EM: Uncertainty-Aware Cross-Modality Image Reconstruction from X-Ray to Electron Microscopy in Connectomics

Autorzy: Yicong Li, Yaron Meirovitch, Aaron T. Kuan, Jasper S. Phelps, Alexandra Pacureanu, Wei-Chung Allen Lee, Nir Shavit, Lu Mi
Opublikowane w: 2023 IEEE 20th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2023, Strona(/y) 1-5
Wydawca: IEEE
DOI: 10.1109/isbi53787.2023.10230759

Other (2)

Self-supervised image restoration in coherent X-ray neuronal microscopy

Autorzy: Alfred Laugros, Peter Cloetens, Carles Bosch, Richard Schoonhoven, Liam Pavlovic, Aaron T. Kuan, Jayde Livingstone, Yuxin Zhang, Minsu Kim, Allard Hendriksen, Mirko Holler, Adrian A. Wanner, Anthony Azevedo, K. Joost Batenburg, John C. Tuthill, Wei-Chung Allen Lee, Andreas T. Schaefer, Nicola Vigano, Alexandra Pacureanu
Opublikowane w: bioRxiv, 2026
Wydawca: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.02.10.633538

Structure-Function Mapping of Olfactory Bulb Circuits with Synchrotron X-ray Nanotomography

Autorzy: Yuxin Zhang, Carles Bosch, Tobias Ackels, Alfred Laugros, Anne Bonnin, Jayde Livingstone, Carsten Waltenberg, Manuel Berning, Sina Tootoonian, Mihaly Kollo, Andrea Nathansen, Norman Rzepka, Peter Cloetens, Alexandra Pacureanu, Andreas T. Schaefer
Opublikowane w: bioRxiv, 2026
Wydawca: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.04.24.650439