COMBINING APPROACHES FOR PHOTOSYNTHETIC IMPROVEMENT TO ALLOW INCREASED SUSTAINABILITY IN EUROPEAN AGRICULTURE

Projektinformationen

CAPITALISE

ID Finanzhilfevereinbarung: 862201

DOI

10.3030/862201

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 15 April 2020

Startdatum 1 April 2020

Enddatum 30 November 2024

Finanziert unter

• INDUSTRIAL LEADERSHIP - Leadership in enabling and industrial technologies – Biotechnology

Gesamtkosten

€ 8 917 645,75

EU-Beitrag

€ 8 573 894,75

Koordiniert durch

WAGENINGEN UNIVERSITY
Netherlands

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Documents, reports (2)

Report on strategic agenda

A report will be produced, detailing the challenges, choices and impact of applying new innovations for increased photosynthetic efficiency. This will address general process recommendations for a reflective review of acceptance of new technologies.

European Strategic Research Agenda and Road Map to 2030

Road map and strategic research agenda available

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Project website operational

Project website online

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (25)

Improving C3 photosynthesis by exploiting natural genetic variation: Hirschfeldia incana as a model species

Autoren: Graham Taylor, Francesco Garassino, Mark G. M. Aarts, Jeremy Harbinson
Veröffentlicht in: Food and Energy Security, Ausgabe 12, 2023, ISSN 2048-3694
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/fes3.420

The genome sequence of Hirschfeldia incana, a new Brassicaceae model to improve photosynthetic light-use efficiency

Autoren: Francesco Garassino, Raul Y. Wijfjes, Rene Boesten, Francisca Reyes Marquez, Frank F. M. Becker, Vittoria Clapero, Iris van den Hatert, Rens Holmer, M. Eric Schranz, Jeremy Harbinson, Dick de Ridder, Sandra Smit, Mark G. M. Aarts
Veröffentlicht in: The Plant Journal, Ausgabe 112, 2022, Seite(n) 1298-1315, ISSN 0960-7412
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/tpj.16005

Genetic loci mediating circadian clock output plasticity and crop productivity under barley domestication

Autoren: Manas R. Prusty, Eyal Bdolach, Eiji Yamamoto, Lalit D. Tiwari, Roi Silberman, Adi Doron‐Faigenbaum, Jeffrey L. Neyhart, David Bonfil, Khalil Kashkush, Klaus Pillen, Kevin P. Smith, Eyal Fridman
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 230/5, 2021, Seite(n) 1787-1801, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17284

Excised leaves show limited and species-specific effects on photosynthetic parameters across crop functional types

Autoren: John N Ferguson, Tamanna Jithesh, Tracy Lawson, Johannes Kromdijk
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Botany, Ausgabe 74, 2023, Seite(n) 6662-6676, ISSN 0022-0957
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erad319

Topology of the redox network during induction of photosynthesis as revealed by time-resolved proteomics in tobacco

Autoren: David Zimmer, Corné Swart, Alexander Graf, Stéphanie Arrivault, Michael Tillich, Sebastian Proost, Zoran Nikoloski, Mark Stitt, Ralph Bock, Timo Mühlhaus, Alix Boulouis
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 7, 2024, ISSN 2375-2548
Herausgeber: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.abi8307

Proteomics and constraint-based modelling reveal enzyme kinetic properties of Chlamydomonas reinhardtii on a genome scale

Autoren: Marius Arend, David Zimmer, Rudan Xu, Frederik Sommer, Timo Mühlhaus, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-40498-1

<i>Solanum pennellii</i> (<scp>LA5240</scp>) backcross inbred lines (<scp>BILs</scp>) for high resolution mapping in tomato

Autoren: Shai Torgeman, Tzili Pleban, Yael Goldberg, Paola Ferrante, Giuseppe Aprea, Giovanni Giuliano, Yoav Yichie, Josef Fisher, Itay Zemach, Amit Koch, Edan Rochsar, Matan Oved, Kfir Bandel, Dani Zamir
Veröffentlicht in: The Plant Journal, Ausgabe 119, 2024, Seite(n) 595-603, ISSN 0960-7412
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/tpj.16755

Epistatic QTLs for yield heterosis in tomato

Autoren: Shai Torgeman, Dani Zamir
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 120, 2023, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2205787119

Maximization of non-idle enzymes improves the coverage of the estimated maximal <i>in vivo</i> enzyme catalytic rates in <i>Escherichia coli</i>

Autoren: Rudan Xu, Zahra Razaghi-Moghadam, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 37, 2023, Seite(n) 3848-3855, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btab575

Transcriptomic response to nitrogen availability reveals signatures of adaptive plasticity during tetraploid wheat domestication

Autoren: Alice Pieri, Romina Beleggia, Tania Gioia, Hao Tong, Valerio Di Vittori, Giulia Frascarelli, Elena Bitocchi, Laura Nanni, Elisa Bellucci, Fabio Fiorani, Nicola Pecchioni, Stefania Marzario, Concetta De Quattro, Antonina Rita Limongi, Pasquale De Vita, Marzia Rossato, Ulrich Schurr, Jacques L David, Zoran Nikoloski, Roberto Papa
Veröffentlicht in: The Plant Cell, Ausgabe 36, 2024, Seite(n) 3809-3823, ISSN 1040-4651
Herausgeber: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plcell/koae202

Relative flux trade-offs and optimization of metabolic network functionalities

Autoren: Seirana Hashemi, Zahra Razaghi-Moghadam, Roosa A. E. Laitinen, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: Computational and Structural Biotechnology Journal, Ausgabe 20, 2022, Seite(n) 3963-3971, ISSN 2001-0370
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2022.07.038

Cytonuclear interactions modulate the plasticity of photosynthetic rhythmicity and growth in wild barley

Autoren: Lalit Dev Tiwari, Eyal Bdolach, Manas Ranjan Prusty, Schewach Bodenheimer, Avital Be'ery, Adi Faigenboim‐Doron, Eiji Yamamoto, Klára Panzarová, Khalil Kashkush, Noam Shental, Eyal Fridman
Veröffentlicht in: Physiologia Plantarum, Ausgabe 176, 2024, ISSN 0031-9317
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ppl.14192

Maximizing multi-reaction dependencies provides more accurate and precise predictions of intracellular fluxes than the principle of parsimony

Autoren: Seirana Hashemi, Zahra Razaghi-Moghadam, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 19, 2023, Seite(n) e1011489, ISSN 1553-7358
Herausgeber: PLOS
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011489

Combination of network and molecule structure accurately predicts competitive inhibitory interactions

Autoren: Zahra Razaghi-Moghadam, Ewelina M. Sokolowska, Marcin A. Sowa, Aleksandra Skirycz, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: Computational and Structural Biotechnology Journal, Ausgabe 19, 2024, Seite(n) 2170-2178, ISSN 2001-0370
Herausgeber: CSB
DOI: 10.1016/j.csbj.2021.04.012

Regulation of Rubisco activity in crops

Autoren: Joana Amaral, Ana K. M. Lobo, Elizabete Carmo‐Silva
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 241, 2024, Seite(n) 35-51, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.19369

Crops under past diversification and ongoing climate change: more than just selection of nuclear genes for flowering

Autoren: Lalit Dev Tiwari, Ayelet Kurtz-Sohn, Eyal Bdolach, Eyal Fridman
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Botany, Ausgabe 74, 2023, Seite(n) 5431-5440, ISSN 0022-0957
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erad283

From data to knowledge – big data needs stewardship, a plant phenomics perspective

Autoren: Daniel Arend; Dennis Psaroudakis; Junaid Altaf Memon; Elena Rey‐Mazón; Danuta Schüler; Jedrzej Jakub Szymanski; Uwe Scholz; Astrid Junker; Matthias Lange
Veröffentlicht in: The Plant Journal, Ausgabe 09607412, 2022, Seite(n) 335-347, ISSN 0960-7412
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/tpj.15804

Data integration across conditions improves turnover number estimates and metabolic predictions

Autoren: Philipp Wendering, Marius Arend, Zahra Razaghi-Moghadam, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, Seite(n) 1485, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37151-2

Improving plant productivity by re-tuning the regeneration of RuBP in the Calvin–Benson–Bassham cycle

Autoren: Christine Raines
Veröffentlicht in: New Phytologist, 2022, Seite(n) 236, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18394

Genetic variation in photosynthesis: many variants make light work

Autoren: Johannes Kromdijk, Alistair J McCormick
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Botany, Ausgabe 73, 2022, Seite(n) 3053-3056, ISSN 0022-0957
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erac129

Prediction of metabolite–protein interactions based on integration of machine learning and constraint-based modeling

Autoren: Fayaz Soleymani Babadi, Zahra Razaghi-Moghadam, Fatemeh Zare-Mirakabad, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: Bioinformatics Advances, Ausgabe 3, 2023, ISSN 2635-0041
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioadv/vbad098

Perspectives on improving photosynthesis to increase crop yield

Autoren: Roberta Croce, Elizabete Carmo-Silva, Young B Cho, Maria Ermakova, Jeremy Harbinson, Tracy Lawson, Alistair J McCormick, Krishna K Niyogi, Donald R Ort, Dhruv Patel-Tupper, Paolo Pesaresi, Christine Raines, Andreas P M Weber, Xin-Guang Zhu
Veröffentlicht in: The Plant Cell, Ausgabe 36, 2024, Seite(n) 3944-3973, ISSN 1040-4651
Herausgeber: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plcell/koae132

Genetics as a key to improving crop photosynthesis

Autoren: Tom P.J.M Theeuwen; Louise L. Logie; Jeremy Harbinson; Mark G. M. Aarts
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Botany, Volume 73, Ausgabe 10, Ausgabe 10, 2022, Seite(n) 3122–3137, ISSN 0022-0957
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erac076

Breeding by intervening: Exploring the role of associations and deliberation in consumer acceptance of different breeding techniques

Autoren: Paul Nales, Arnout R.H. Fischer
Veröffentlicht in: Public Understanding of Science, Ausgabe 32, 2024, Seite(n) 889-906, ISSN 0963-6625
Herausgeber: SAGE Publications
DOI: 10.1177/09636625231168087

Identification of gene function based on models capturing natural variability of Arabidopsis thaliana lipid metabolism

Autoren: Sandra Correa Córdoba, Hao Tong, Asdrúbal Burgos, Feng Zhu, Saleh Alseekh, Alisdair R. Fernie, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-40644-9

Book chapters (2)

Radiometric determination of rubisco activation state and quantity in leaves

Autoren: Catherine J. Ashton, Rhiannon Page, Ana K.M. Lobo, Joana Amaral, Joao A. Siqueira, Douglas J. Orr, Elizabete Carmo-Silva
Veröffentlicht in: Methods in Enzymology, Carboxylases, 2024, Seite(n) 323-351
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.mie.2024.10.018

Purification of Rubisco from Leaves

Autoren: Joana Amaral, Ana K. M. Lobo, Elizabete Carmo-Silva, Douglas J. Orr
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology, Photosynthesis, 2024, Seite(n) 417-426
Herausgeber: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-3790-6_22

Other (1)

Harnessing the optimization of enzyme catalytic rates in engineering of metabolic phenotypes

Autoren: Zahra Razaghi-Moghadam, Fayaz Soleymani Babadi, Zoran Nikoloski
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, 2024
Herausgeber: Research Square Platform LLC
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3915216/v1