Chromatin readout: Dissecting the protein-chromatin interaction code in living cells

Informacje na temat projektu

ChromatinLEGO

Identyfikator umowy o grant: 865094

DOI

10.3030/865094

Data podpisania przez KE 22 Stycznia 2020

Data rozpoczęcia 1 Września 2020

Data zakończenia 31 Sierpnia 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 999 375,00

Wkład UE

€ 1 999 375,00

Koordynowany przez

UNIVERSITEIT UTRECHT
Netherlands

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (5)

The H3K36me3 methyltransferase SETD2 contributes to PAF1C interactions with RNA Pol II and is required for neuronal differentiation

Autorzy: Christina Ambrosi, Ramon Pfaendler, Kristeli Eleftheriou, Stefan Butz, Davide Recchia, Xue Bao, Richard Cardoso da Silva, Niklas Kupfer, Ilse M Lagerwaard, Hanneke Vlaming, Nina Schmolka, Vivek Bhardwaj, Tuncay Baubec
Opublikowane w: The EMBO Journal, Numer 45, 2026, Strona(/y) 3430-3443, ISSN 1460-2075
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44318-026-00768-2

Engineered chromatin readers track damaged chromatin dynamics in live cells and animals

Autorzy: Richard Cardoso da Silva, Kristeli Eleftheriou, Davide C. Recchia, Vincent Portegijs, Douwe ten Bulte, Niklas Kupfer, Nathalie P. Vroegindeweij-de Wagenaar, Xabier Vergara, Ayoub Ouchene, Sander van den Heuvel, Tuncay Baubec
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 16, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-65706-y

Dissecting the roles of MBD2 isoforms and domains in regulating NuRD complex function during cellular differentiation

Autorzy: Nina Schmolka, Ino D. Karemaker, Richard Cardoso da Silva, Davide C. Recchia, Vincent Spegg, Jahnavi Bhaskaran, Michael Teske, Nathalie P. de Wagenaar, Matthias Altmeyer, Tuncay Baubec
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 14, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39551-w

High-affinity chromodomains engineered for improved detection of histone methylation and enhanced CRISPR-based gene repression

Autorzy: G. Veggiani, Rodrigo Villaseñor, G. D. Martyn, J. Q. Tang, M. W. Krone, J. Gu, C. Chen, M. L. Waters, K. H. Pearce, Tuncay Baubec & S. S. Sidhu
Opublikowane w: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-34269-7

DNA sequence and chromatin modifiers cooperate to confer epigenetic bistability at imprinting control regions

Autorzy: Stefan Butz, Nina Schmolka, Ino D Karemaker, Rodrigo Villaseñor, Isabel Schwarz, Silvia Domcke, Esther C H Uijttewaal, Julian Jude, Florian Lienert, Arnaud R Krebs, Nathalie P de Wagenaar, Xue Bao, Johannes Zuber, Ulrich Elling, Dirk Schübeler, Tuncay Baubec
Opublikowane w: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01210-z

Other (3)

A modular toolbox for <i>in cellulo</i> screening of small molecule inhibitors targeting chromatin reader domains

Autorzy: Davide C. Recchia, Richard Cardoso da Silva, Niklas Kupfer, Angela Topic, Sara Giuliani, Rodrigo Villaseñor, Tuncay Baubec
Opublikowane w: biorxiv, 2026
Wydawca: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.09.06.674632

Probing DNA damage sites reveals context-dependent and novel DNA damage response factors

Autorzy: Richard Cardoso da Silva, Davide C. Recchia, Vincent Portegijs, Maria Cristina Trueba Sanchez, Kelly E. Stecker, Sander van den Heuvel, Tuncay Baubec
Opublikowane w: biorXiv, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.10.23.619792

SETD2 promotes PAF1C interactions with the elongating RNA Pol II and is required for neuronal differentiation

Autorzy: Christina Ambrosi, Ramon Pfaendler, Stefan Butz, Davide Recchia, Xue Bao, Nina Schmolka, Tuncay Baubec
Opublikowane w: biorXiv, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.10.23.619798

Non-peer reviewed articles (1)

Regulatory mechanisms governing chromatin organization and function

Autorzy: Rodrigo Villaseñor, Tuncay Baubec
Opublikowane w: Current Opinion in Cell Biology, 2021, ISSN 0955-0674
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ceb.2020.10.015