Model-guided Engineering of Complex Microbial Communities

Projektinformationen

ModEM

ID Finanzhilfevereinbarung: 866028

DOI 10.3030/866028

EK-Unterschriftsdatum 22 September 2020

Startdatum 1 Oktober 2020

Enddatum 30 September 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 995 818,00

EU-Beitrag € 1 995 818,00

Koordiniert durch

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Vereinigtes Königreich

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Veröffentlichungen

Fachlich begutachtete Artikel (5)

metaGEM: reconstruction of genome scale metabolic models directly from metagenomes

Autoren: Francisco Zorrilla, Filip Buric, Kiran R Patil, Aleksej Zelezniak
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab815

Unravelling metabolic cross‐feeding in a yeast–bacteria community using <scp> ¹³ C </scp> ‐based proteomics

Autoren: Natalia Gabrielli; Christoniki Maga‐Nteve; Eleni Kafkia; Mandy Rettel; Jakob Loeffler; Stephan Kamrad; Athanasios Typas; Kiran Raosaheb Patil
Veröffentlicht in: Molecular Systems Biology, Ausgabe 1, 2023, ISSN 1744-4292
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202211501

Adaptive laboratory evolution of microbial co‐cultures for improved metabolite secretion

Autoren: Dimitrios Konstantinidis; Filipa Pereira; Eva‐Maria Geissen; Kristina Grkovska; Eleni Kafkia; Paula Jouhten; Yongkyu Kim; Saravanan Devendran; Michael Zimmermann; Kiran Raosaheb Patil
Veröffentlicht in: Molecular Systems Biology, Ausgabe 17:e10189, 2021, ISSN 1744-4292
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202010189

Predictive evolution of metabolic phenotypes using model-designed environments

Autoren: Jouhten, Paula; Konstantinidis, Dimitrios; Pereira, Filipa; Andrejev, Sergej; Grkovska, Kristina; Castillo, Sandra; Ghiachi, Payam; Beltran, Gemma; Almaas, Eivind; Mas, Albert; Warringer, Jonas; Gonzalez, Ramon; Morales, Pilar; Patil, Kiran R.; 0000-0003-1075-7448; 0000-0002-9125-326X; 0000-0002-0763-1679; 0000-0001-6144-2740; 0000-0002-0130-6111; 0000-0002-6166-8640
Veröffentlicht in: Molecular Systems Biology, Ausgabe 2, 2022, ISSN 1744-4292
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202210980

Ecological modelling approaches for predicting emergent properties in microbial communities

Autoren: Naomi Iris van den Berg, Daniel Machado, Sophia Santos, Isabel Rocha, Jeremy Chacón, William Harcombe, Sara Mitri & Kiran R. Patil
Veröffentlicht in: Nature Ecology and Evolution, 2022, ISSN 2397-334X
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41559-022-01746-7