HEPARIN AND HEPARAN SULPHATE: FROM SEQUENCE DETERMINATION TO THERAPEUTIC STRATEGIES FOR PARKINSON’S DISEASE

Projektinformationen

HS-SEQ

ID Finanzhilfevereinbarung: 899687

DOI

10.3030/899687

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 28 Mai 2020

Startdatum 1 Oktober 2020

Enddatum 30 September 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Gesamtkosten

€ 3 998 385,00

EU-Beitrag

€ 3 848 385,00

Koordiniert durch

UNIVERSITEIT UTRECHT
Netherlands

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Documents, reports (4)

Prototype MS-IMS-IR instrument based on Waters SYNAPT G2S

Prototype MSIMSIR instrument based on Waters SYNAPT G2S

Automation platform for chemoenzymatic synthesis of HS saccharide standards
Advanced separations methods for natural heparin and HS
Workflows for phage-display antibodies development using synthetic and cellular HS

Workflows for phagedisplay antibodies development using synthetic and cellular HS

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Public website

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (16)

A reference human induced pluripotent stem cell line for large-scale collaborative studies

Autoren: Pantazis C.B., Yang A., Lara E., McDonough J.A., Blauwendraat C., Peng L., Oguro H., Kanaujiya J., Zou J., Sebesta D., Pratt G., Cross E., Blockwick J., Buxton P., Kinner-Bibeau L., Medura C., Tompkins C., Hughes S., Santiana M., Faghri F., Nalls M.A., Vitale D., Ballard S., Qi Y.A., Ramos D.M., Anderson K.M., Stadler J., Narayan P., Papademetriou J., Reilly L., Nelson M.P., Aggarwal S., Rosen L.U
Veröffentlicht in: Cell Stem Cell, 2022, Seite(n) 1685-1702 e22, ISSN 1934-5909
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.004

Heparin increases the antibiotic efficacy of colistin

Autoren: Szekeres G.P., Hanozin E., Diehn R., Horlebein J., Polewski L., Zappe A., Lauster D., Pagel K.
Veröffentlicht in: Frontiers in Analytical Science, 2023, ISSN 2673-9283
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/frans.2023.1154391

Chondroitin Sulfate Disaccharides in the Gas Phase: Differentiation and Conformational Constraints

Autoren: Maike Lettow, Kim Greis, Márkó Grabarics, Jan Horlebein, Rebecca L. Miller, Gerard Meijer, Gert von Helden, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry A, Ausgabe 125/20, 2021, Seite(n) 4373-4379, ISSN 1089-5639
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpca.1c02463

Identification of heparin-binding amino acid residues in antibody HS4C3 with the potential to design antibodies against heparan sulfate domains

Autoren: Lars A A Damen, Thao P Bui, Thierry van Wessel, Yong Li, Bart F Straten, Robin Pampiermole, Willeke F Daamen, David G Fernig, Toin H van Kuppevelt
Veröffentlicht in: Glycobiology, Ausgabe 34, 2024, ISSN 1460-2423
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/glycob/cwae046

Ion Mobility Mass Spectrometry‐Based Disaccharide Analysis of Glycosaminoglycans

Autoren: Lukasz Polewski, Eunjin Moon, Andreas Zappe, Michael Götze, Gergo Peter Szekeres, Christian Roth, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Chemistry – A European Journal, Ausgabe 30, 2024, ISSN 0947-6539
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202400783

Predicting structural motifs of glycosaminoglycans using cryogenic infrared spectroscopy and random forest

Autoren: Riedel J., Lettow M., Grabarics M., Gotze M., Miller R.L., Boons G.J., Meijer G., von Helden G., Szekeres G.P., Pagel K.
Veröffentlicht in: J. Am. Chem. Soc., 2023, Seite(n) 7859-7868, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c12762

Chemokine Oligomers and the Impact of Fondaparinux Binding

Autoren: Gergo Peter Szekeres, Douglas P. Dyer, Rebecca L. Miller, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, Ausgabe 35, 2024, Seite(n) 1550-1555, ISSN 1044-0305
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1021/jasms.4c00142

Analytical challenges of glycosaminoglycans at biological interfaces

Autoren: Gergo Peter Szekeres, Kevin Pagel, Zsuzsanna Heiner
Veröffentlicht in: Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, ISSN 1618-2642
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00216-021-03705-w

Ion mobility-tandem mass spectrometry of mucin-type O-glycans

Autoren: Leïla Bechtella, Jin Chunsheng, Kerstin Fentker, Güney R. Ertürk, Marc Safferthal, Łukasz Polewski, Michael Götze, Simon Y. Graeber, Gaël M. Vos, Weston B. Struwe, Marcus A. Mall, Philipp Mertins, Niclas G. Karlsson, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, Seite(n) 1-10, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46825-4

Mass Spectrometry-Based Techniques to Elucidate the Sugar Code

Autoren: Márkó Grabarics, Maike Lettow, Carla Kirschbaum, Kim Greis, Christian Manz, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Chemical Reviews, 2021, ISSN 0009-2665
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.chemrev.1c00380

The interaction of chondroitin sulfate with a lipid monolayer observed by using nonlinear vibrational spectroscopy

Autoren: Gergo Peter Szekeres, Szilvia Krekic, Rebecca L. Miller, Mark Mero, Kevin Pagel, Zsuzsanna Heiner
Veröffentlicht in: Physical Chemistry Chemical Physics, Ausgabe 23/23, 2021, Seite(n) 13389-13395, ISSN 1463-9076
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cp01975a

Well-defined heparin mimetics can inhibit binding of the trimeric spike of SARS—COV2 in a length-dependent manner

Autoren: Sun L., Chopra P., Tomris I., van der Woude R., Liu L., de Vries R.P., Boons G.J.
Veröffentlicht in: JACS Au, 2023, Seite(n) 1185-1195, ISSN 2691-3704
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacsau.3c00042

Chemokine CXCL4 interactions with extracellular matrix proteoglycans mediate widespread immune cell recruitment independent of chemokine receptors

Autoren: Gray A.L., Karlsson R., Roberts A.R.E., Ridley A.J.L., Pun N., Khan B., Lawless C., Luis R., Szpakowska M., Chevigne A., Hughes C.E., Medina-Ruiz L., Birchenough H.L., Mulholland I.Z., Salanga C.L., Yates E.A., Turnbull J.E., Handel T.M., Graham G.J., Jowitt T.A., Schiessl I., Richter R.P., Miller R.L., Dyer D.P.
Veröffentlicht in: Cell Rep, 2023, Seite(n) 111930, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111930

Chemoenzymatic Synthesis of Heparan Sulfate Oligosaccharides having a Domain Structure**

Autoren: Sun, Lifeng; Chopra, Pradeep; Boons, Geert-Jan; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie-International Edition, 2022, Seite(n) e202211112, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202211112

State‐of‐the‐art glycosaminoglycan characterization

Autoren: Andreas Zappe, Rebecca L. Miller, Weston B. Struwe, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Mass Spectrometry Reviews, 2021, ISSN 0277-7037
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mas.21737

Protein Secondary Structure Affects Glycan Clustering in Native Mass Spectrometry

Autoren: Hao Yan, Julia Lockhauserbäumer, Gergo Peter Szekeres, Alvaro Mallagaray, Robert Creutznacher, Stefan Taube, Thomas Peters, Kevin Pagel, Charlotte Uetrecht
Veröffentlicht in: Life, Ausgabe 11/6, 2021, Seite(n) 554, ISSN 2075-1729
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/life11060554