HEPARIN AND HEPARAN SULPHATE: FROM SEQUENCE DETERMINATION TO THERAPEUTIC STRATEGIES FOR PARKINSON’S DISEASE

Informacje na temat projektu

HS-SEQ

Identyfikator umowy o grant: 899687

DOI

10.3030/899687

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 28 Maja 2020

Data rozpoczęcia 1 Października 2020

Data zakończenia 30 Września 2025

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Koszt całkowity

€ 3 998 385,00

Wkład UE

€ 3 848 385,00

Koordynowany przez

UNIVERSITEIT UTRECHT
Netherlands

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Documents, reports (4)

Prototype MS-IMS-IR instrument based on Waters SYNAPT G2S

Prototype MSIMSIR instrument based on Waters SYNAPT G2S

Automation platform for chemoenzymatic synthesis of HS saccharide standards
Advanced separations methods for natural heparin and HS
Workflows for phage-display antibodies development using synthetic and cellular HS

Workflows for phagedisplay antibodies development using synthetic and cellular HS

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Public website

Publikacje

Peer reviewed articles (16)

A reference human induced pluripotent stem cell line for large-scale collaborative studies

Autorzy: Pantazis C.B., Yang A., Lara E., McDonough J.A., Blauwendraat C., Peng L., Oguro H., Kanaujiya J., Zou J., Sebesta D., Pratt G., Cross E., Blockwick J., Buxton P., Kinner-Bibeau L., Medura C., Tompkins C., Hughes S., Santiana M., Faghri F., Nalls M.A., Vitale D., Ballard S., Qi Y.A., Ramos D.M., Anderson K.M., Stadler J., Narayan P., Papademetriou J., Reilly L., Nelson M.P., Aggarwal S., Rosen L.U
Opublikowane w: Cell Stem Cell, 2022, Strona(/y) 1685-1702 e22, ISSN 1934-5909
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.004

Heparin increases the antibiotic efficacy of colistin

Autorzy: Szekeres G.P., Hanozin E., Diehn R., Horlebein J., Polewski L., Zappe A., Lauster D., Pagel K.
Opublikowane w: Frontiers in Analytical Science, 2023, ISSN 2673-9283
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/frans.2023.1154391

Chondroitin Sulfate Disaccharides in the Gas Phase: Differentiation and Conformational Constraints

Autorzy: Maike Lettow, Kim Greis, Márkó Grabarics, Jan Horlebein, Rebecca L. Miller, Gerard Meijer, Gert von Helden, Kevin Pagel
Opublikowane w: The Journal of Physical Chemistry A, Numer 125/20, 2021, Strona(/y) 4373-4379, ISSN 1089-5639
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpca.1c02463

Identification of heparin-binding amino acid residues in antibody HS4C3 with the potential to design antibodies against heparan sulfate domains

Autorzy: Lars A A Damen, Thao P Bui, Thierry van Wessel, Yong Li, Bart F Straten, Robin Pampiermole, Willeke F Daamen, David G Fernig, Toin H van Kuppevelt
Opublikowane w: Glycobiology, Numer 34, 2024, ISSN 1460-2423
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/glycob/cwae046

Ion Mobility Mass Spectrometry‐Based Disaccharide Analysis of Glycosaminoglycans

Autorzy: Lukasz Polewski, Eunjin Moon, Andreas Zappe, Michael Götze, Gergo Peter Szekeres, Christian Roth, Kevin Pagel
Opublikowane w: Chemistry – A European Journal, Numer 30, 2024, ISSN 0947-6539
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202400783

Predicting structural motifs of glycosaminoglycans using cryogenic infrared spectroscopy and random forest

Autorzy: Riedel J., Lettow M., Grabarics M., Gotze M., Miller R.L., Boons G.J., Meijer G., von Helden G., Szekeres G.P., Pagel K.
Opublikowane w: J. Am. Chem. Soc., 2023, Strona(/y) 7859-7868, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c12762

Chemokine Oligomers and the Impact of Fondaparinux Binding

Autorzy: Gergo Peter Szekeres, Douglas P. Dyer, Rebecca L. Miller, Kevin Pagel
Opublikowane w: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, Numer 35, 2024, Strona(/y) 1550-1555, ISSN 1044-0305
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1021/jasms.4c00142

Analytical challenges of glycosaminoglycans at biological interfaces

Autorzy: Gergo Peter Szekeres, Kevin Pagel, Zsuzsanna Heiner
Opublikowane w: Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, ISSN 1618-2642
Wydawca: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00216-021-03705-w

Ion mobility-tandem mass spectrometry of mucin-type O-glycans

Autorzy: Leïla Bechtella, Jin Chunsheng, Kerstin Fentker, Güney R. Ertürk, Marc Safferthal, Łukasz Polewski, Michael Götze, Simon Y. Graeber, Gaël M. Vos, Weston B. Struwe, Marcus A. Mall, Philipp Mertins, Niclas G. Karlsson, Kevin Pagel
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, Strona(/y) 1-10, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46825-4

Mass Spectrometry-Based Techniques to Elucidate the Sugar Code

Autorzy: Márkó Grabarics, Maike Lettow, Carla Kirschbaum, Kim Greis, Christian Manz, Kevin Pagel
Opublikowane w: Chemical Reviews, 2021, ISSN 0009-2665
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.chemrev.1c00380

The interaction of chondroitin sulfate with a lipid monolayer observed by using nonlinear vibrational spectroscopy

Autorzy: Gergo Peter Szekeres, Szilvia Krekic, Rebecca L. Miller, Mark Mero, Kevin Pagel, Zsuzsanna Heiner
Opublikowane w: Physical Chemistry Chemical Physics, Numer 23/23, 2021, Strona(/y) 13389-13395, ISSN 1463-9076
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cp01975a

Well-defined heparin mimetics can inhibit binding of the trimeric spike of SARS—COV2 in a length-dependent manner

Autorzy: Sun L., Chopra P., Tomris I., van der Woude R., Liu L., de Vries R.P., Boons G.J.
Opublikowane w: JACS Au, 2023, Strona(/y) 1185-1195, ISSN 2691-3704
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacsau.3c00042

Chemokine CXCL4 interactions with extracellular matrix proteoglycans mediate widespread immune cell recruitment independent of chemokine receptors

Autorzy: Gray A.L., Karlsson R., Roberts A.R.E., Ridley A.J.L., Pun N., Khan B., Lawless C., Luis R., Szpakowska M., Chevigne A., Hughes C.E., Medina-Ruiz L., Birchenough H.L., Mulholland I.Z., Salanga C.L., Yates E.A., Turnbull J.E., Handel T.M., Graham G.J., Jowitt T.A., Schiessl I., Richter R.P., Miller R.L., Dyer D.P.
Opublikowane w: Cell Rep, 2023, Strona(/y) 111930, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111930

Chemoenzymatic Synthesis of Heparan Sulfate Oligosaccharides having a Domain Structure**

Autorzy: Sun, Lifeng; Chopra, Pradeep; Boons, Geert-Jan; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery
Opublikowane w: Angewandte Chemie-International Edition, 2022, Strona(/y) e202211112, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202211112

State‐of‐the‐art glycosaminoglycan characterization

Autorzy: Andreas Zappe, Rebecca L. Miller, Weston B. Struwe, Kevin Pagel
Opublikowane w: Mass Spectrometry Reviews, 2021, ISSN 0277-7037
Wydawca: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mas.21737

Protein Secondary Structure Affects Glycan Clustering in Native Mass Spectrometry

Autorzy: Hao Yan, Julia Lockhauserbäumer, Gergo Peter Szekeres, Alvaro Mallagaray, Robert Creutznacher, Stefan Taube, Thomas Peters, Kevin Pagel, Charlotte Uetrecht
Opublikowane w: Life, Numer 11/6, 2021, Strona(/y) 554, ISSN 2075-1729
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/life11060554