HEPARIN AND HEPARAN SULPHATE: FROM SEQUENCE DETERMINATION TO THERAPEUTIC STRATEGIES FOR PARKINSON’S DISEASE

Informazioni relative al progetto

HS-SEQ

ID dell’accordo di sovvenzione: 899687

DOI

10.3030/899687

Progetto chiuso

Data della firma CE 28 Maggio 2020

Data di avvio 1 Ottobre 2020

Data di completamento 30 Settembre 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Costo totale

€ 3 998 385,00

Contributo UE

€ 3 848 385,00

Coordinato da

UNIVERSITEIT UTRECHT
Netherlands

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Documents, reports (4)

Prototype MS-IMS-IR instrument based on Waters SYNAPT G2S

Prototype MSIMSIR instrument based on Waters SYNAPT G2S

Automation platform for chemoenzymatic synthesis of HS saccharide standards
Advanced separations methods for natural heparin and HS
Workflows for phage-display antibodies development using synthetic and cellular HS

Workflows for phagedisplay antibodies development using synthetic and cellular HS

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Public website

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (16)

A reference human induced pluripotent stem cell line for large-scale collaborative studies

Autori: Pantazis C.B., Yang A., Lara E., McDonough J.A., Blauwendraat C., Peng L., Oguro H., Kanaujiya J., Zou J., Sebesta D., Pratt G., Cross E., Blockwick J., Buxton P., Kinner-Bibeau L., Medura C., Tompkins C., Hughes S., Santiana M., Faghri F., Nalls M.A., Vitale D., Ballard S., Qi Y.A., Ramos D.M., Anderson K.M., Stadler J., Narayan P., Papademetriou J., Reilly L., Nelson M.P., Aggarwal S., Rosen L.U
Pubblicato in: Cell Stem Cell, 2022, Pagina/e 1685-1702 e22, ISSN 1934-5909
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.004

Heparin increases the antibiotic efficacy of colistin

Autori: Szekeres G.P., Hanozin E., Diehn R., Horlebein J., Polewski L., Zappe A., Lauster D., Pagel K.
Pubblicato in: Frontiers in Analytical Science, 2023, ISSN 2673-9283
Editore: Frontiers
DOI: 10.3389/frans.2023.1154391

Chondroitin Sulfate Disaccharides in the Gas Phase: Differentiation and Conformational Constraints

Autori: Maike Lettow, Kim Greis, Márkó Grabarics, Jan Horlebein, Rebecca L. Miller, Gerard Meijer, Gert von Helden, Kevin Pagel
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry A, Numero 125/20, 2021, Pagina/e 4373-4379, ISSN 1089-5639
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpca.1c02463

Identification of heparin-binding amino acid residues in antibody HS4C3 with the potential to design antibodies against heparan sulfate domains

Autori: Lars A A Damen, Thao P Bui, Thierry van Wessel, Yong Li, Bart F Straten, Robin Pampiermole, Willeke F Daamen, David G Fernig, Toin H van Kuppevelt
Pubblicato in: Glycobiology, Numero 34, 2024, ISSN 1460-2423
Editore: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/glycob/cwae046

Ion Mobility Mass Spectrometry‐Based Disaccharide Analysis of Glycosaminoglycans

Autori: Lukasz Polewski, Eunjin Moon, Andreas Zappe, Michael Götze, Gergo Peter Szekeres, Christian Roth, Kevin Pagel
Pubblicato in: Chemistry – A European Journal, Numero 30, 2024, ISSN 0947-6539
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202400783

Predicting structural motifs of glycosaminoglycans using cryogenic infrared spectroscopy and random forest

Autori: Riedel J., Lettow M., Grabarics M., Gotze M., Miller R.L., Boons G.J., Meijer G., von Helden G., Szekeres G.P., Pagel K.
Pubblicato in: J. Am. Chem. Soc., 2023, Pagina/e 7859-7868, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c12762

Chemokine Oligomers and the Impact of Fondaparinux Binding

Autori: Gergo Peter Szekeres, Douglas P. Dyer, Rebecca L. Miller, Kevin Pagel
Pubblicato in: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, Numero 35, 2024, Pagina/e 1550-1555, ISSN 1044-0305
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1021/jasms.4c00142

Analytical challenges of glycosaminoglycans at biological interfaces

Autori: Gergo Peter Szekeres, Kevin Pagel, Zsuzsanna Heiner
Pubblicato in: Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, ISSN 1618-2642
Editore: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00216-021-03705-w

Ion mobility-tandem mass spectrometry of mucin-type O-glycans

Autori: Leïla Bechtella, Jin Chunsheng, Kerstin Fentker, Güney R. Ertürk, Marc Safferthal, Łukasz Polewski, Michael Götze, Simon Y. Graeber, Gaël M. Vos, Weston B. Struwe, Marcus A. Mall, Philipp Mertins, Niclas G. Karlsson, Kevin Pagel
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, Pagina/e 1-10, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46825-4

Mass Spectrometry-Based Techniques to Elucidate the Sugar Code

Autori: Márkó Grabarics, Maike Lettow, Carla Kirschbaum, Kim Greis, Christian Manz, Kevin Pagel
Pubblicato in: Chemical Reviews, 2021, ISSN 0009-2665
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.chemrev.1c00380

The interaction of chondroitin sulfate with a lipid monolayer observed by using nonlinear vibrational spectroscopy

Autori: Gergo Peter Szekeres, Szilvia Krekic, Rebecca L. Miller, Mark Mero, Kevin Pagel, Zsuzsanna Heiner
Pubblicato in: Physical Chemistry Chemical Physics, Numero 23/23, 2021, Pagina/e 13389-13395, ISSN 1463-9076
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cp01975a

Well-defined heparin mimetics can inhibit binding of the trimeric spike of SARS—COV2 in a length-dependent manner

Autori: Sun L., Chopra P., Tomris I., van der Woude R., Liu L., de Vries R.P., Boons G.J.
Pubblicato in: JACS Au, 2023, Pagina/e 1185-1195, ISSN 2691-3704
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacsau.3c00042

Chemokine CXCL4 interactions with extracellular matrix proteoglycans mediate widespread immune cell recruitment independent of chemokine receptors

Autori: Gray A.L., Karlsson R., Roberts A.R.E., Ridley A.J.L., Pun N., Khan B., Lawless C., Luis R., Szpakowska M., Chevigne A., Hughes C.E., Medina-Ruiz L., Birchenough H.L., Mulholland I.Z., Salanga C.L., Yates E.A., Turnbull J.E., Handel T.M., Graham G.J., Jowitt T.A., Schiessl I., Richter R.P., Miller R.L., Dyer D.P.
Pubblicato in: Cell Rep, 2023, Pagina/e 111930, ISSN 2211-1247
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111930

Chemoenzymatic Synthesis of Heparan Sulfate Oligosaccharides having a Domain Structure**

Autori: Sun, Lifeng; Chopra, Pradeep; Boons, Geert-Jan; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery
Pubblicato in: Angewandte Chemie-International Edition, 2022, Pagina/e e202211112, ISSN 1433-7851
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202211112

State‐of‐the‐art glycosaminoglycan characterization

Autori: Andreas Zappe, Rebecca L. Miller, Weston B. Struwe, Kevin Pagel
Pubblicato in: Mass Spectrometry Reviews, 2021, ISSN 0277-7037
Editore: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mas.21737

Protein Secondary Structure Affects Glycan Clustering in Native Mass Spectrometry

Autori: Hao Yan, Julia Lockhauserbäumer, Gergo Peter Szekeres, Alvaro Mallagaray, Robert Creutznacher, Stefan Taube, Thomas Peters, Kevin Pagel, Charlotte Uetrecht
Pubblicato in: Life, Numero 11/6, 2021, Pagina/e 554, ISSN 2075-1729
Editore: MDPI
DOI: 10.3390/life11060554