Opis projektu
Ewolucja modyfikacji epigenetycznych i ich rola w adaptacji gatunkowej
Modyfikacje epigenetyczne to zmiany chemiczne zachodzące w obrębie histonów i DNA, które pełnią nadrzędną rolę w regulacji ekspresji genów. Wciąż niewiele wiadomo na temat tego, jak te modyfikacje zmieniają się w toku ewolucji. Badacze z finansowanego ze środków UE projektu DECAF posłużą się modelem metylacji DNA i zbadają miejsca stabilnej metylacji w genomie ptaków. Będą również próbowali zrozumieć i określić działanie selektywnych sił wpływających na zróżnicowanie metylacji DNA w populacjach naturalnych. Wyniki projektu pomogą w zrozumieniu roli miejsc metylacji w różnicowaniu się gatunków i dostarczą całkowicie nowych informacji na temat procesów adaptacyjnych, w których głównym czynnikiem jest epigenetyka.
Cel
Epigenetics plays a fundamental role in the function and regulation of the genome. From an evolutionary viewpoint, a pressing question is whether epigenetic modifications are a source of adaptive variation. To answer this question substantial attention is being given to the epigenetic marks themselves, but surprisingly little is known about the evolutionary underpinnings of the genomic sites that anchor them. Using novel analytical and technical approaches, I want to address this fundamental knowledge gap. I will use the best understood epigenetic mark, DNA methylation, as a model and advance on recent findings in avian genome evolution, epigenetic inheritance and sequencing technology. This will enable me to pinpoint signatures of epigenetically driven adaptation. I have designed separate approaches at three different levels: (1) At the individual level, to identify stably methylated anchors in the avian germline with focus on a recently discovered germline-specific chromosome, (2) at the population level, to establish the selective forces acting on DNA methylation diversity in natural populations and (3) at the species level, to gain insight into how fast-mutating anchors of DNA methylation act as potential facilitators of species differentiation and barriers. Ultimately, by combining these three levels I will be able to pinpoint epigenetic anchors that are involved in molecular adaptation. The possible research outcomes will not only be valuable to evolutionary biologists and ecologists, but will also make fundamental contributions to molecular biology and possibly medical research, and will deepen our understanding of how epigenetic marks manifest themselves at the sequence level.
Dziedzina nauki
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-STG - Starting GrantInstytucja przyjmująca
44227 Dortmund
Niemcy