Projektbeschreibung
Identifikation von Silencern im menschlichen Genom
Der Großteil des menschlichen Genoms enthält regulierende Elemente wie Promoter, Enhancer oder Isolatoren, die die räumlich-zeitliche Expression von proteinkodierenden Genen steuern. Im EU-finanzierten Projekt Silencer wird es vor allem um die regulierenden Elemente gehen, die die Transkription von Genen unterdrücken und bisher kaum erforscht worden sind – die Silencer. Das wissenschaftliche Team wird mithilfe eines neuartigen Ansatzes ohne Forschungsbias nicht nur funktionale Silencerelemente identifizieren, sondern auch ihre epigenetischen Modifikationen und Sequenzmotive. Die Projektergebnisse werden unbekannte biologische Pfade, die von Silencern reguliert werden, und die Beteiligung dieser regulierenden Elemente an verschiedenen Erkrankungen aufzeigen.
Ziel
Less than 1.5% of the human genome contains protein coding information of the estimated 25,000 genes. The rest of the non-coding genome includes many regulatory elements that control the spatial and temporal transcription of genes. With the help of the non-coding regulatory elements, the diverse cell types and tissues of a complex human body could be derived from the combinational expression of a limited number of genes from the same copy of the genome. Most regulatory elements (REs) have been characterized extensively, e.g. promoters, enhancers and insulators. These REs have been implicated to play very important roles in cell physiology, tissue development and disease onsets. Surprisingly, one class of REs—silencers—which repress the transcription of genes, have not been systematically characterized and studied. I have developed a lentiviral system to systematically identify functional silencer elements. In the small-scale proof-of-principle experiments, by focusing on the transcriptional factor (TF) accessible DNA sequences, I showed that this system is robust to identify novel and bona fide silencers, which could be validated using complementary functional assays such as luciferase and CRISPR knockout assays. In this proposed research plan, I aim to identify silencers in an unbiased way, rather than focusing on TF accessible regions, to have a more general understanding of the biology of silencers. Based on the unbiased identification of silencers, I aim to identify a general pattern of epigenetic modifications of silencers, unique combination of sequence motifs, responsible regulatory TFs, biological pathways that are regulated by silencers, diseases that might be related to mutations in silencers, and finally better manipulation strategies of silencers.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikDNS
- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenBiochemieBiomoleküleProteine
- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikMutation
- Medizin- und GesundheitswissenschaftenGrundlagenmedizinPhysiologie
- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikGenom
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
Thema/Themen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2020-STG
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigenFinanzierungsplan
ERC-STG - Starting GrantGastgebende Einrichtung
2333 ZA Leiden
Niederlande