Opis projektu
Rozpoznanie sekwencji wyciszających w ludzkim genomie
Większa część ludzkiego genomu zawiera elementy regulacyjne takie jak promotory, wzmacniacze i izolatory, które kontrolują przestrzenno-czasową ekspresję genów kodujących białka. Zespół finansowanego przez UE projektu Silencer zbada sekwencje wyciszające, czyli elementy regulacyjne odpowiadające za tłumienie transkrypcji genów, które do tej pory nie zostały do końca poznane. W tym celu naukowcy wykorzystają nową metodę dokładnej identyfikacji funkcjonalnych sekwencji wyciszających wraz z ich modyfikacjami epigenetycznymi i motywami sekwencyjnymi. Wyniki projektu pozwolą na rozpoznanie nowych szlaków biologicznych regulowanych przez sekwencje wyciszające oraz zdefiniowanie roli tych elementów regulacyjnych w różnych chorobach.
Cel
Less than 1.5% of the human genome contains protein coding information of the estimated 25,000 genes. The rest of the non-coding genome includes many regulatory elements that control the spatial and temporal transcription of genes. With the help of the non-coding regulatory elements, the diverse cell types and tissues of a complex human body could be derived from the combinational expression of a limited number of genes from the same copy of the genome. Most regulatory elements (REs) have been characterized extensively, e.g. promoters, enhancers and insulators. These REs have been implicated to play very important roles in cell physiology, tissue development and disease onsets. Surprisingly, one class of REs—silencers—which repress the transcription of genes, have not been systematically characterized and studied. I have developed a lentiviral system to systematically identify functional silencer elements. In the small-scale proof-of-principle experiments, by focusing on the transcriptional factor (TF) accessible DNA sequences, I showed that this system is robust to identify novel and bona fide silencers, which could be validated using complementary functional assays such as luciferase and CRISPR knockout assays. In this proposed research plan, I aim to identify silencers in an unbiased way, rather than focusing on TF accessible regions, to have a more general understanding of the biology of silencers. Based on the unbiased identification of silencers, I aim to identify a general pattern of epigenetic modifications of silencers, unique combination of sequence motifs, responsible regulatory TFs, biological pathways that are regulated by silencers, diseases that might be related to mutations in silencers, and finally better manipulation strategies of silencers.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna fizjologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
ERC-STG - Starting Grant
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2020-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
2333 ZA Leiden
Niderlandy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.