Beyond super-resolution: ultra-resolution imaging provides solutions for synapse physiology and brain pathology

Projektinformationen

ULTRARESOLUTION

ID Finanzhilfevereinbarung: 951275

DOI

10.3030/951275

EK-Unterschriftsdatum 1 März 2021

Startdatum 1 Juni 2021

Enddatum 31 Mai 2027

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 11 100 221,00

EU-Beitrag

€ 11 100 221,00

Koordiniert durch

UNIVERSITAETSMEDIZIN GOETTINGEN - GEORG-AUGUST-UNIVERSITAET GOETTINGEN - STIFTUNG OEFFENTLICHEN RECHTS
Germany

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (17)

Microtubules as a versatile reference standard for expansion microscopy

Autoren: Rajdeep Chowdhury, Tiago Mimoso, Abed Alrahman Chouaib, Nikolaos Mougios, Donatus Krah, Felipe Opazo, Sarah Köster, Silvio O. Rizzoli, Ali H. Shaib
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 8, 2025, Seite(n) USA, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-025-07967-3

PCNA as Protein‐Based Nanoruler for Sub‐10 nm Fluorescence Imaging

Autoren: Dominic A. Helmerich, Made Budiarta, Danush Taban, Sören Doose, Gerti Beliu, Markus Sauer
Veröffentlicht in: Advanced Materials, Ausgabe 36, 2024, ISSN 0935-9648
Herausgeber: United Nations Industrial Developement Organization
DOI: 10.1002/adma.202310104

Convex hull as diagnostic tool in single-molecule localization microscopy.

Autoren: Ebert V, Eiring P, Helmerich DA, Seifert R, Sauer M, Doose S.
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2022, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac700

Functionalized Docetaxel Probes for Refined Visualization of Mitotic Spindles by Expansion Microscopy

Autoren: Gang Wen, Xiong Chen, Patrick Eiring, Volker Leen, Johan Hofkens, Markus Sauer
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 147, 2025, Seite(n) 6604-6611, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.4c15608

Multiplexed expansion revealing for imaging multiprotein nanostructures in healthy and diseased brain

Autoren: Jinyoung Kang, Margaret E. Schroeder, Youngmi Lee, Chaitanya Kapoor, Eunah Yu, Tyler B. Tarr, Kat Titterton, Menglong Zeng, Demian Park, Emily Niederst, Donglai Wei, Guoping Feng, Edward S. Boyden
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53729-w

Extracellular matrix remodeling throughendocytosis and resurfacing of Tenascin-R

Autoren: Dankovich TM, Kaushik R, Olsthoorn LHM, Petersen GC, Giro PE, Kluever V, Agüi-Gonzalez P, Grewe K, Bao G, Beuermann S, Hadi HA, Doeren J, Klöppner S, Cooper BH, Dityatev A, Rizzoli SO
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-27462-7

ReCSAI: recursive compressed sensing artificial intelligence for confocal lifetime localization microscopy.

Autoren: Reinhard S, Helmerich DA, Boras D, Sauer M, Kollmannsberger P
Veröffentlicht in: BMC Bioinformatics, 2022, ISSN 1471-2105
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-022-05071-5

Visualization of F-Actin Through Expansion Microscopy (ExM) with Trifunctional Linker-Conjugated Phalloidin

Autoren: Jianjun Huang, Gang Wen, Thibo Iven, Débora Linhares, Leewon Koo, Markus Sauer, Wim Dehaen, Volker Leen, Johan Hofkens
Veröffentlicht in: BIO-PROTOCOL, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2331-8325
Herausgeber: Bio-Protocol, LLC
DOI: 10.21769/bioprotoc.5273

Photoswitching fingerprint analysis bypasses the 10-nm resolution barrier

Autoren: Helmerich DA, Beliu G, Taban D, Meub M, Streit M, Kuhlemann A, Doose S, Sauer M
Veröffentlicht in: Nature Methods, 2022, ISSN 1548-7105
Herausgeber: Nature Research
DOI: 10.1038/s41592-022-01548-6

Decoding the molecular interplay of CD20 and therapeutic antibodies with fast volumetric nanoscopy

Autoren: Arindam Ghosh, Mara Meub, Dominic A. Helmerich, Julia Weingart, Patrick Eiring, Thomas Nerreter, K. Martin Kortüm, Sören Doose, Markus Sauer
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 387, 2025, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adq4510

Enhanced synaptic protein visualization by multicolor super-resolution expansion microscopy

Autoren: Janna Eilts, Sebastian Reinhard, Nikolas Michetschläger, Christian Werner, Markus Sauer
Veröffentlicht in: Neurophotonics, Ausgabe 10, 2024, ISSN 2329-423X
Herausgeber: SPIE-Intl Soc Optical Eng
DOI: 10.1117/1.nph.10.4.044412

One-step nanoscale expansion microscopy reveals individual protein shapes

Autoren: Ali H. Shaib, Abed Alrahman Chouaib, Rajdeep Chowdhury, Jonas Altendorf, Daniel Mihaylov, Chi Zhang, Donatus Krah, Vanessa Imani, Russell K. W. Spencer, Svilen Veselinov Georgiev, Nikolaos Mougios, Mehar Monga, Sofiia Reshetniak, Tiago Mimoso, Han Chen, Parisa Fatehbasharzad, Dagmar Crzan, Kim-Ann Saal, Mohamad Mahdi Alawieh, Nadia Alawar, Janna Eilts, Jinyoung Kang, Alireza Soleimani, Marcus Mül
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-024-02431-9

Single-shot 20-fold expansion microscopy

Autoren: Shiwei Wang, Tay Won Shin, Harley B. Yoder, Ryan B. McMillan, Hanquan Su, Yixi Liu, Chi Zhang, Kylie S. Leung, Peng Yin, Laura L. Kiessling, Edward S. Boyden
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 21, 2024, Seite(n) 2128-2134, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02454-9

Coronaviruses Use ACE2 Monomers as Entry-Receptors

Autoren: Eiring P, Klein T, Backes S, Streit M, Jungblut M, Doose S, Beliu G, Sauer M.
Veröffentlicht in: Angew Chem Int Ed Engl, 2023, ISSN 1521-3757
Herausgeber: Society of German Chemists
DOI: 10.1002/anie.202300821

Bioorthogonal labeling of transmembrane proteins with non-canonical amino acids unveils masked epitopes in live neurons.

Autoren: Diogo Bessa-Neto; Gerti Beliu; Alexander Kuhlemann; Valeria Pecoraro; Sören Doose; Natacha Retailleau; Nicolas Chevrier; David Perrais; Markus Sauer; Daniel Choquet
Veröffentlicht in: "Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-27025-w⟩", Ausgabe 1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-27025-w

Advanced Data Analysis for Fluorescence-Lifetime Single-Molecule Localization Microscopy

Autoren: Jan Christoph Thiele; Oleksii Nevskyi; Dominic A. Helmerich; Markus Sauer; Jörg Enderlein; Jörg Enderlein
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioinformatics, Vol 1 (2021), Ausgabe 1, 2021, ISSN 2673-7647
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fbinf.2021.740281

Heat denaturation enables multicolor X10-STED microscopy.

Autoren: Saal KA, Shaib AH, Mougios N, Crzan D, Opazo F, Rizzoli SO
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-32524-5

Other (3)

Visualizing proteins by expansion microscopy.

Autoren: Ali H. Shaib, Abed Alrahman Chouaib, Rajdeep Chowdhury, Daniel Mihaylov, Chi Zhang, Vanessa Imani, Svilen Veselinov Georgiev, Nikolaos Mougios, Mehar Monga, Sofiia Reshetniak, Tiago Mimoso, Han Chen, Parisa Fatehbasharzad, Dagmar Crzan, Kim-Ann Saal, Nadia Alawar, Janna Eilts, Jinyoung Kang, Luis Alvarez, Claudia Trenkwalder, Brit Mollenhauer, Tiago F. Outeiro, Sarah Köster, Julia Preobraschenski
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2023
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.08.03.502284

A Multifunctional Anchor for Multimodal Expansion Microscopy.

Autoren: Yi Cui, Gaojie Yang, Daniel R. Goodwin, Ciara H. O’Flanagan, Anubhav Sinha, Chi Zhang, Kristina E. Kitko, Demian Park, Samuel Aparicio, IMAXT Consortium, Edward S. Boyden
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2022
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.06.19.496699

Trifunctional linkers enable improved visualization of actin by expansion microscopy.

Autoren: G Wen, MD Lycas, Y Jia, V Leen, M Sauer, J Hofkens
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2023
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.05.10.540261v1