Beyond super-resolution: ultra-resolution imaging provides solutions for synapse physiology and brain pathology

Informacje na temat projektu

ULTRARESOLUTION

Identyfikator umowy o grant: 951275

DOI

10.3030/951275

Data podpisania przez KE 1 Marca 2021

Data rozpoczęcia 1 Czerwca 2021

Data zakończenia 31 Maja 2027

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 11 100 221,00

Wkład UE

€ 11 100 221,00

Koordynowany przez

UNIVERSITAETSMEDIZIN GOETTINGEN - GEORG-AUGUST-UNIVERSITAET GOETTINGEN - STIFTUNG OEFFENTLICHEN RECHTS
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (17)

Microtubules as a versatile reference standard for expansion microscopy

Autorzy: Rajdeep Chowdhury, Tiago Mimoso, Abed Alrahman Chouaib, Nikolaos Mougios, Donatus Krah, Felipe Opazo, Sarah Köster, Silvio O. Rizzoli, Ali H. Shaib
Opublikowane w: Communications Biology, Numer 8, 2025, Strona(/y) USA, ISSN 2399-3642
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-025-07967-3

PCNA as Protein‐Based Nanoruler for Sub‐10 nm Fluorescence Imaging

Autorzy: Dominic A. Helmerich, Made Budiarta, Danush Taban, Sören Doose, Gerti Beliu, Markus Sauer
Opublikowane w: Advanced Materials, Numer 36, 2024, ISSN 0935-9648
Wydawca: United Nations Industrial Developement Organization
DOI: 10.1002/adma.202310104

Convex hull as diagnostic tool in single-molecule localization microscopy.

Autorzy: Ebert V, Eiring P, Helmerich DA, Seifert R, Sauer M, Doose S.
Opublikowane w: Bioinformatics, 2022, ISSN 1367-4811
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac700

Functionalized Docetaxel Probes for Refined Visualization of Mitotic Spindles by Expansion Microscopy

Autorzy: Gang Wen, Xiong Chen, Patrick Eiring, Volker Leen, Johan Hofkens, Markus Sauer
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, Numer 147, 2025, Strona(/y) 6604-6611, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.4c15608

Multiplexed expansion revealing for imaging multiprotein nanostructures in healthy and diseased brain

Autorzy: Jinyoung Kang, Margaret E. Schroeder, Youngmi Lee, Chaitanya Kapoor, Eunah Yu, Tyler B. Tarr, Kat Titterton, Menglong Zeng, Demian Park, Emily Niederst, Donglai Wei, Guoping Feng, Edward S. Boyden
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53729-w

Extracellular matrix remodeling throughendocytosis and resurfacing of Tenascin-R

Autorzy: Dankovich TM, Kaushik R, Olsthoorn LHM, Petersen GC, Giro PE, Kluever V, Agüi-Gonzalez P, Grewe K, Bao G, Beuermann S, Hadi HA, Doeren J, Klöppner S, Cooper BH, Dityatev A, Rizzoli SO
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-27462-7

ReCSAI: recursive compressed sensing artificial intelligence for confocal lifetime localization microscopy.

Autorzy: Reinhard S, Helmerich DA, Boras D, Sauer M, Kollmannsberger P
Opublikowane w: BMC Bioinformatics, 2022, ISSN 1471-2105
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-022-05071-5

Visualization of F-Actin Through Expansion Microscopy (ExM) with Trifunctional Linker-Conjugated Phalloidin

Autorzy: Jianjun Huang, Gang Wen, Thibo Iven, Débora Linhares, Leewon Koo, Markus Sauer, Wim Dehaen, Volker Leen, Johan Hofkens
Opublikowane w: BIO-PROTOCOL, Numer 15, 2025, ISSN 2331-8325
Wydawca: Bio-Protocol, LLC
DOI: 10.21769/bioprotoc.5273

Photoswitching fingerprint analysis bypasses the 10-nm resolution barrier

Autorzy: Helmerich DA, Beliu G, Taban D, Meub M, Streit M, Kuhlemann A, Doose S, Sauer M
Opublikowane w: Nature Methods, 2022, ISSN 1548-7105
Wydawca: Nature Research
DOI: 10.1038/s41592-022-01548-6

Decoding the molecular interplay of CD20 and therapeutic antibodies with fast volumetric nanoscopy

Autorzy: Arindam Ghosh, Mara Meub, Dominic A. Helmerich, Julia Weingart, Patrick Eiring, Thomas Nerreter, K. Martin Kortüm, Sören Doose, Markus Sauer
Opublikowane w: Science, Numer 387, 2025, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adq4510

Enhanced synaptic protein visualization by multicolor super-resolution expansion microscopy

Autorzy: Janna Eilts, Sebastian Reinhard, Nikolas Michetschläger, Christian Werner, Markus Sauer
Opublikowane w: Neurophotonics, Numer 10, 2024, ISSN 2329-423X
Wydawca: SPIE-Intl Soc Optical Eng
DOI: 10.1117/1.nph.10.4.044412

One-step nanoscale expansion microscopy reveals individual protein shapes

Autorzy: Ali H. Shaib, Abed Alrahman Chouaib, Rajdeep Chowdhury, Jonas Altendorf, Daniel Mihaylov, Chi Zhang, Donatus Krah, Vanessa Imani, Russell K. W. Spencer, Svilen Veselinov Georgiev, Nikolaos Mougios, Mehar Monga, Sofiia Reshetniak, Tiago Mimoso, Han Chen, Parisa Fatehbasharzad, Dagmar Crzan, Kim-Ann Saal, Mohamad Mahdi Alawieh, Nadia Alawar, Janna Eilts, Jinyoung Kang, Alireza Soleimani, Marcus Mül
Opublikowane w: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1087-0156
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-024-02431-9

Single-shot 20-fold expansion microscopy

Autorzy: Shiwei Wang, Tay Won Shin, Harley B. Yoder, Ryan B. McMillan, Hanquan Su, Yixi Liu, Chi Zhang, Kylie S. Leung, Peng Yin, Laura L. Kiessling, Edward S. Boyden
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 21, 2024, Strona(/y) 2128-2134, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02454-9

Coronaviruses Use ACE2 Monomers as Entry-Receptors

Autorzy: Eiring P, Klein T, Backes S, Streit M, Jungblut M, Doose S, Beliu G, Sauer M.
Opublikowane w: Angew Chem Int Ed Engl, 2023, ISSN 1521-3757
Wydawca: Society of German Chemists
DOI: 10.1002/anie.202300821

Bioorthogonal labeling of transmembrane proteins with non-canonical amino acids unveils masked epitopes in live neurons.

Autorzy: Diogo Bessa-Neto; Gerti Beliu; Alexander Kuhlemann; Valeria Pecoraro; Sören Doose; Natacha Retailleau; Nicolas Chevrier; David Perrais; Markus Sauer; Daniel Choquet
Opublikowane w: "Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-27025-w⟩", Numer 1, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-27025-w

Advanced Data Analysis for Fluorescence-Lifetime Single-Molecule Localization Microscopy

Autorzy: Jan Christoph Thiele; Oleksii Nevskyi; Dominic A. Helmerich; Markus Sauer; Jörg Enderlein; Jörg Enderlein
Opublikowane w: Frontiers in Bioinformatics, Vol 1 (2021), Numer 1, 2021, ISSN 2673-7647
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fbinf.2021.740281

Heat denaturation enables multicolor X10-STED microscopy.

Autorzy: Saal KA, Shaib AH, Mougios N, Crzan D, Opazo F, Rizzoli SO
Opublikowane w: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-32524-5

Other (3)

Visualizing proteins by expansion microscopy.

Autorzy: Ali H. Shaib, Abed Alrahman Chouaib, Rajdeep Chowdhury, Daniel Mihaylov, Chi Zhang, Vanessa Imani, Svilen Veselinov Georgiev, Nikolaos Mougios, Mehar Monga, Sofiia Reshetniak, Tiago Mimoso, Han Chen, Parisa Fatehbasharzad, Dagmar Crzan, Kim-Ann Saal, Nadia Alawar, Janna Eilts, Jinyoung Kang, Luis Alvarez, Claudia Trenkwalder, Brit Mollenhauer, Tiago F. Outeiro, Sarah Köster, Julia Preobraschenski
Opublikowane w: BioRxiv, 2023
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.08.03.502284

A Multifunctional Anchor for Multimodal Expansion Microscopy.

Autorzy: Yi Cui, Gaojie Yang, Daniel R. Goodwin, Ciara H. O’Flanagan, Anubhav Sinha, Chi Zhang, Kristina E. Kitko, Demian Park, Samuel Aparicio, IMAXT Consortium, Edward S. Boyden
Opublikowane w: BioRxiv, 2022
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.06.19.496699

Trifunctional linkers enable improved visualization of actin by expansion microscopy.

Autorzy: G Wen, MD Lycas, Y Jia, V Leen, M Sauer, J Hofkens
Opublikowane w: BioRxiv, 2023
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.05.10.540261v1