Una diagnosi rapida della polmonite
Le infezioni del tratto respiratorio (respiratory tract infection, RTI) causate da patogeni batterici, virali, fungali o di altra natura sono responsabili di milioni di decessi ogni anno. Le RTI contratte in comunità sono dette polmonite acquisita in comunità (community acquired pneumonia, CAP) e quelle contratte in ospedale sono chiamate polmonite nosocomiale (hospital acquired pneumonia, HAP), e includono la polmonite associata a ventilazione (ventilator associated pneumonia, VAP). Attualmente per la diagnosi di laboratorio delle RTI sono necessari almeno due giorni, durante i quali i pazienti ricevono antibiotici empirici. Oltre a essere inefficace tale trattamento può anche compromettere l’outcome dei pazienti. L’obiettivo del progetto RID-RTI (Rapid identification of respiratory tract infections), finanziato dall’UE, era sviluppare una piattaforma diagnostica per la diagnosi rapida di tipi differenti di polmonite in meno di due ore. La piattaforma generata si basava sul rilevamento molecolare del patogeno e prevedeva l’isolamento del DNA del patogeno da campioni respiratori. Come prima fase i ricercatori hanno identificato diversi target patogeni e geni di resistenza agli antibiotici per l’amplificazione PCR. Un campione rappresentativo di patogeni RTI-specifici è stato selezionato per ogni tipo di polmonite (CAP, HAP e VAP). Sono stati progettati e ottimizzati esami Multiplex PCR real-time sempre abbinati a sonde di ibridazione. La piattaforma ottenuta integrava preparazione di campioni con singola cartuccia, amplificazione degli acidi nucleici e rilevamento tramite ibridazione. Inoltre il dispositivo RID-RTI incorporava il software di controllo degli strumenti, analisi e interfaccia utente e la cartuccia HAP/VAP è stata sottoposta a test analitici. Considerando che le RTI restano difficili da diagnosticare a causa dell’ampia gamma di patogeni coinvolti, la piattaforma RID-RTI offre uno strumento eccellente per una diagnosi accurata. Cosa più importante, la tempestività dell’approccio faciliterà decisioni immediate rispetto alla terapia antibiotica e migliorerà l’esito generale dei pazienti.
Parole chiave
Polmonite, infezione del tratto respiratorio, patogeno, RID-RTI, PCR
