Nowatorskie cele antybiotykoterapii
Na powierzchni bakterii znajdują się podłużne struktury znane jako pile lub fimbrie, dzięki którym bakterie przyczepiają się do komórki docelowej. Te struktury są budowane z użyciem systemu sekrecji zwanego szlakiem chaperone-usher i jawią się jako nowe cele w antybiotykoterapii. Naukowcy z projektu INFIMAS (The study of Initial limiting steps for fimbrae assembly in E.coli) finansowanego ze środków UE, obrali sobie za cel zbadanie szlaku warunkującego rozwój fimbrii. Wykorzystali jako model badawczy uropatogenny szczep bakterii E.coli która przyczepia się do tkanek dróg moczowych zakażając je. Zespół zbadał etapy i komponenty odpowiadające za sterowanie procesem polimeryzacji fimbrii typu 1. Działania koncentrowały się na błonie zewnętrznej białka FimD, będącego katalizatorem polimeryzacji podjednostek fimbrii na powierzchni bakterii. Naukowcy odkryli, że w pierwszym etapie tworzenia się fimbrii zachodzą zmiany konformacyjne trójwymiarowej struktury FimD do konfiguracji aktywnej przez podjednostkę FimH. Związki między FimD i FimH wynikają z pewnego wzorca sekwencyjnego, który, zgodnie z ustaleniami naukowców, zachował się u wielu różnych gatunków. Prace nad mutantami FimD i FimH doprowadziły badaczy do wniosku, że w obu białkach wzorzec ten ma podstawowe znaczenie dla polimeryzacji fimbrii. Ustalenia projektu INFIMAS sugerują, że wspólny wzorzec sekwencyjny białka FimD i jego aktywatora FimH jest kluczowym elementem tworzenia się fimbrii. Partnerzy wierzą, że ten wzorzec mógłby posłużyć jako nowy cel w antybiotykoterapii, przy opracowywaniu peptydów hamujących zdolnych pokonać lekooporność.
