Naukowcy uzbrojeni w nową technikę dokładnie wskazują gorące punkty pasożyta malarii
W toku przełomowych badań, międzynarodowy zespół naukowców opracował nowe narzędzie do identyfikacji gorących punktów ewolucji pasożyta malarii, aby szybko i skutecznie śledzić wzrost oporności na leki przeciwmalaryczne. Odkrycia zostały zaprezentowane w czasopiśmie Nature. Naukowcy, pracujący pod kierunkiem Wellcome Trust Sanger Institute z Wlk. Brytanii, wykorzystali nowe technologie sekwencjonowania i metody informatyczne do ewaluacji genomów malarii w próbkach krwi pobranych od 227 chorych z sześciu krajów. Zidentyfikowali wiele różnic w rozwoju malarii w Afryce, Azji i Oceanii. Komary rozprzestrzeniają pasożyta Plasmodium falciparum, który jest odpowiedzialny za ostre postaci malarii. Ponad 200 mln osób cierpi na malarię, a około 600.000 umiera rok rocznie z jej powodu. Najbardziej zagrożone są dzieci w wieku do pięciu lat, które zamieszkują w Aryce subsaharyjskiej. "Jedną z uderzających cech P. falciparum jest jego zdolność do ewoluowania i przezwyciężania leków przeciwmalarycznych" - zauważył profesor Dominic Kwiatkowski z Wellcome Trust Sanger Institute i z Uniwersytetu Oksfordzkiego w Wlk. Brytanii, autor naczelny raportu z badań. "Chlorochina stała się nieskuteczna w walce z malarią i zaczyna się pojawiać oporność na inne kluczowe leki. Jeżeli chcemy kontrolować oporność, to musimy najpierw być w stanie monitorować różnorodność genetyczną P. falciparum i identyfikować pojawianie się gorących punktów możliwej oporności. Szybkie sekwencjonowanie genomów pasożyta we krwi zainfekowanych ludzi jest skutecznym sposobem na wykrywanie zmian w populacji pasożyta i potencjalnie nowym narzędziem obserwacji w arsenale broni do nadzorowania malarii". Narzędzie opracowane przez zespół umożliwia ekstrakcję kwasu dezoksyrybonukleinowego (DNA) pasożyta z krwi. Naukowcy potrafią również usunąć jak najwięcej ludzkiego DNA z próbki. Dzięki tej technice nie ma już konieczności hodowania pasożyta w posiewie krwi przed sekwencjonowaniem. Zatem proces nie tylko ulega skróceniu, ale maleje także liczba błędów replikacji. Zdaniem zespołu zadanie sekwencjonowania P. falciparum jest złożone, ponieważ istnieje konieczność wielokrotnego sekwencjonowania DNA, nie tak jak w przypadku ludzkiego DNA. Tak więc rekonstrukcja wszystkich sekwencji genomu DNA pasożyta, przy wykorzystywaniu aktualnych metod sekwencjonowania DNA, jest powolna, kosztowna i narażona na błędy. Dzięki wykorzystaniu danych sekwencyjnych do wygenerowania zmian pojedynczych liter DNA, określanych jako polimorfizmy jednego nukleotydu (SNP), naukowcy zidentyfikowali i zmierzyli zmienność w naturalnych populacjach pasożyta. "Skatalogowaliśmy około 86.000 SNP w genomie pasożyta, które umożliwiają nam dokładne określenie różnic między pasożytami na świecie, co stanowi punkt wyjścia do poznania, jak te populacje adaptują się do zmian w swoim środowisku" - powiedział dr Magnus Manske, pierwszy współautor z Wellcome Trust Sanger Institute. Dr Olivo Miotto z Wellcome Trust Sanger Institute i Uniwersytetu Oksfordzkiego, pierwszy współautor, stwierdził: "Wielu chorych na malarię, zwłaszcza w Afryce, jest stale zakażanych przez pasożyty malarii, a my opracowaliśmy nowe narzędzie do badania różnorodności genetycznej u pojedynczego pacjenta i porównywania jej z różnorodnością w jego środowisku".Więcej informacji: Wellcome Trust Sanger Institute: http://www.sanger.ac.uk/(odnośnik otworzy się w nowym oknie) Nature: http://www.nature.com/(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Kraje
Zjednoczone Królestwo