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European plant genome database network (PLANET)

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PlaNet: promozione della ricerca sulla genetica vegetale in Europa

Il Munich Information Centre for Protein Sequences e i partner del progetto PLANET hanno sfruttato le tecniche bioinformatiche per condividere via internet delle utili informazioni sul genoma vegetale.

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Gli scienziati europei hanno dato un significativo contributo al recente sequenziamento genetico della pianta Arabidopsis thaliana. Il progetto PLANET, finanziato in parte dal programma LIFE QUALITY, ha cercato di mettere a disposizione i dati del genoma di questa e di altre piante alla comunità di ricerca più vasta. Gli specialisti delle piante hanno richiesto l'aiuto di esperti di bioinformatica per sviluppare una soluzione d'avanguardia. Il risultato di questa collaborazione è una piattaforma integrata che consente l'accesso a oltre dieci database di genomi vegetali forniti dai sette centri di ricerca che partecipano a PLANET. Sono stati utilizzati degli strumenti e degli standard comuni, come BioMoby e Taverna, per facilitare le domande ai database, l'analisi complessa e la visualizzazione dei dati. Nella piattaforma sono integrati oltre 160 servizi web. È anche possibile stabilire dei collegamenti a database esterni definiti dall'utente. Il coordinatore di PLANET, il Munich Information Centre for Protein Sequences (MIPS), ha fornito delle guide ed altra documentazione sull'argomento online al sito: http://mips.gsf.de/projects/plants/PlaNetPortal/index_html Fornisce anche un elenco completo dei database disponibili e degli strumenti, incluso un motore di ricerca. MIPS desidera attirare l'attenzione sul fatto che il paradigma della piattaforma PlaNet si potrebbe estendere ad altri campi di ricerca.

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