Oznaczanie bakterii E.coli w warunkach terenowych
Około 10% pałeczek E. coli jest laktozo-ujemnych, zatem nie są zliczane w przypadku użycia metody identyfikacji wyłącznie kolonii laktozo-dodatnich. W celu rozwiązania tego problemu uczestnicy projektu ANTRES opracowali prostą i niedrogą procedurę identyfikacji pałeczek E. coli w warunkach terenowych. W teście wykrywano enzym beta-D-glukuronidazę przy użyciu substratu w postaci 4-metyloumbeliferylo-beta-D-glukuronianu (ang. MUG, 4-methylumbelliferyl-beta-D glucuronide), dzięki czemu wytwarzany jest związek o nazwie 4-metyloumbeliferon. Wynik dodatni był sygnalizowany przez silną fluorescencję w kolorze błękitnym widoczną w promieniach UV. Detekcja tego enzymu jest istotna, ponieważ jest on wytwarzany przez prawie wszystkie szczepy E. coli. Ponadto inne bakterie produkujące ten enzym nie rozwijają się w hodowlach z użyciem podłoża stosowanego w przypadku bakterii E. coli. Test opracowany w ramach projektu ANTRES był znacznie tańszy niż poprzednie testy, w których stosowano podłoże hodowli z dodatkiem kompleksu MUG. Zastosowanie mikropłytek pozwoliło na szybkie i proste oznaczenie dużej liczby szczepów. Technika ta okazała się przydatna do wykorzystania w warunkach terenowych. Jedną z głównych zalet nowej metody jest znaczne zmniejszenie liczby fałszywie dodatnich wyników testów. Test umożliwił dokładną identyfikację bakterii E. coli wśród kolonii zdolnych do fermentacji laktozy. W trakcie badań terenowych w Boliwii i Peru test z użyciem kompleksu MUG przeprowadzono dla kilku kolonii bakterii fekalnych oraz kolonii bakterii atypowych. W rezultacie uzyskano znaczącą poprawę umiejętności miejscowego personelu laboratoryjnego w zakresie klasyfikacji wyizolowanych szczepów hodowanych na agarze McConkeya.
