Na właściwej drodze do wyjaśnienia interakcji białkowych
SUMO, czyli mały modyfikator ubikwitynowy (ang. small ubiquitin-related modifier), to specjalne białko, które modyfikuje kilka innych białek uczestniczących w ważnych procesach komórkowych, takich jak transport jądrowy. Aby zbadać szlak modyfikacyjny SUMO, ze środków europejskich sfinansowano projekt "Badania strukturalne i funkcjonalne nad szlakiem modyfikacyjnym SUMO" (SUMO Pathway). Dla wyjaśnienia, jak przebiega koniugacja SUMO z ligazami E3, zastosowano krystalografię rentgenowską. Dzięki temu możliwe było opisanie odpowiedniego motywu wiązania SUMO w wypadku ligazy E3 RNF4. Ponadto prowadzona jest ocena siły, z jaką kilka elementów rodziny proteaz SUMO poddaje SUMO dekoniugacji. Szczególne zainteresowanie budzi zdolność SENP6 i SENP7 do rozróżniania typów SUMO, tzw. izoform. Okazało się, że za pomocą specjalnych substratów możliwe było manipulowanie aktywnością proteazy – jej zwiększanie lub obniżanie. Eksperymenty te obejmują obecnie także laboratoryjne bakterie i inne mikroorganizmy. Wyniki projektu SUMO Pathway są udostępniane społeczności badawczej poprzez publikacje w recenzowanych czasopismach naukowych.
