Szybka diagnoza posocznicy
Obecne metody rozpoznawania posocznicy polegają na posiewie krwi pacjenta, identyfikacji uzyskanych bakterii i badaniu antybiotykooporności, co może zająć nawet kilka dni. Szybka identyfikacja wywołujących posocznicę bakterii pozwoliłaby uratować życie zakażonych pacjentów. Finansowany przez UE projekt ACUSEP(odnośnik otworzy się w nowym oknie) miał na celu udowodnienie skuteczności nowej metody rozpoznawania posocznicy polegającej na wykrywaniu bardzo niewielkich ilości bakterii we krwi w ciągu kilku godzin. W projekcie ACUSEP prowadzono prace nad jednorazowym, gotowym do użycia wkładzie do szybkiej analizy wywołujących posocznicę mikroorganizmów bezpośrednio z próbek krwi. Naukowcy skorzystali z metod mikrocieczowych i akustoforezy, aby uzyskać bakterie z małej próbki przy użyciu fal ultradźwiękowych. Następnie bakterie i ich geny oporności na antybiotyki identyfikuje się techniką PCR. System detekcji składa się z kilku elementów, opracowanych przez uczestników projektu. Urządzenie do akustoforezy, służące do oddzielania od krwi i wzbogacania próbki bakterii, okazało się skuteczne w przypadku próbek krwi zawierających bakterie. Innowacyjne metody wyznakowania luminescencyjnymi lantanowcami pozwoliły wykryć DNA bakteryjne w reakcji PCR. Oznaczenie z użyciem sondy oligonukleotydowej w fazie stałej umożliwiło jednorodne, wielowymiarowe wykrywanie produktów reakcji PCR. Czułe oznaczenia na bazie PCR pozwoliły wykryć i zidentyfikować pięć bakterii najczęściej wywołujących posocznicę oraz szereg genów oporności na antybiotyki. Zintegrowany układ oznaczeń na bazie PCR na chipach z suchymi odczynnikami umożliwił automatyzację reakcji PCR. W projekcie stworzono i przetestowano z powodzeniem cztery prototypy takiego zintegrowanego systemu. Najlepszy prototyp przeszedł następnie badanie kliniczne i porównano jego zastosowanie z tradycyjnymi metodami rozpoznawania posocznicy. Prototyp urządzenia ACUSEP pozwalał wykryć bakterie we krwi pacjenta w ciągu dwóch godzin. Wyniki potwierdzano następnie prowadząc posiew krwi. System ACUSEP ma ogromny potencjał. Jeśli zostanie udoskonalony i wprowadzony na rynek, może stać się istotnym narzędziem w opiece szpitalnej nad pacjentami, u których podejrzewa się posocznicę. Szybka identyfikacja bakterii wywołujących posocznicę i ryzyka oporności na antybiotyki zmniejszy chorobowość i śmiertelność pacjentów.
