Opis projektu
Zrównoważony sposób wytwarzania nowych antybiotyków
Poliketydy to duża klasa wtórnych metabolitów bakterii, grzybów i roślin o ciekawym i ważnym działaniu. Są one wykorzystywane jako antybiotyki, środki przeciwgrzybicze i leki. Można też syntetyzować je chemicznie lub wytwarzać ze źródeł biologicznych. Zespół finansowanego przez UE projektu PrediKSion proponuje wykorzystanie enzymów syntazy poliketydowej acylotransferazy (AT PKS) wytwarzanych przez bakterie jako zrównoważonego sposobu pozyskiwania poliketydów. Aby odkryć nowe cechy biosyntezy w AT PKS, naukowcy opracują metodę obliczeniową, który pozwoli ocenić funkcjonalność nieopisanych dotąd enzymów. W dłuższej perspektywie doprowadzi to do odkrycia nowych produktów farmaceutycznych.
Cel
Many of the most valuable, yet complex chemicals in society are obtained from bacteria, who use giant, multimodular acyltransferase polyketide synthase (AT PKS) enzyme complexes to make these products. The modular nature of these enzymes holds the promise to engineer biosynthetic assembly lines to produce new, societally relevant products in a benign and sustainable manner. However, the chemical functionalities installed by the textbook cis-AT PKSs is mostly limited to several basic moieties.
In contrast, in a second class of PKSs, trans-AT PKSs, over 150 different module types have been identified, yet with many more still uncharacterized. Initial results show that bioinformatically-guided approaches can be effective ways to assign the functionality of these uncharacterized modules, but only individual examples have been studied. To catalyze the discovery of new functionality in trans-AT PKSs, I propose PrediKSion: a comprehensive, evolution-guided and experimentally validated computational pipeline to unravel the hidden chemical functionality of unassigned trans-AT PKS modules.
PrediKSion will facilitate unbiased discovery of new module functionalities by looking at the phylogeny of ketosynthases (KSs) in the PKS sequences. The high substrate selectivity in KSs reveals crucial information on chemistry installed by upstream modules and can thereby lead to the discovery of new and unexpected biosynthetic features in uncharacterized PKS modules and elusive trans-acting components. PrediKSion will be applied on the complete bacterial tree of life and achieve great impact by providing the community with a global mapping of predicted chemical functionality in trans-AT PKSs. The computational suggestions will finally be validated experimentally and the substrate scope of new PKS modules will be studied. In this way, PrediKSion will accelerate the mapping of uncharacterized PKSs and the discovery of new metabolites and potentially interesting pharmaceutical platforms.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne morfologia biologiczna morfologia porównawcza
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia bakteriologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka enzymy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
8092 Zuerich
Szwajcaria
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.