Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Hidden in plain sight: Masking RNA Pol II phosphorylation via proline isomerization during gene expression

Opis projektu

Rola izomerów proliny w regulacji procesu fosforylacji polimerazy II RNA

Izomeraza prolinowa PIN1 katalizuje przejście między naturalnie występującymi izomerami cis i trans prolin. Ostatnie badania wskazują, że PIN1 bierze udział w fosforylacji C-końcowej domeny (CTD) polimerazy II (Pol II) RNA, a mutacje PIN1 są powiązane z progresją nowotworu. Brak dostatecznej wiedzy na temat roli izomeryzacji prolin wynika z ograniczeń technologicznych utrudniających rozróżnianie izomerów cis i trans z użyciem spektrometrii mas. Zespół finansowanego ze środków UE projektu Iso-Proline CTD zamierza wyjaśnić wpływ izomeryzacji prolin na działanie Pol II, która odpowiada za regulację ekspresji genów. Badanie wykorzysta nowe osiągnięcia technologiczne w zakresie syntezy peptydów, co umożliwi zablokowanie prolin w konfiguracji cis lub trans i zbadanie oddziaływań zależnych od postaci izomeru.

Cel

Prolines are unique amongst aminoacids given that they naturally exist in two isomeric states: CIS and TRANS. The transition between these states is slow but can be catalyzed by the activity of proline isomerases such as PIN1. Recent in vitro work suggests that PIN1 can alter the phosphorylation dynamics of the C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II (Pol II) by inhibiting phosphatase recognition. Given Pol II is solely responsible for transcribing all protein-coding genes and that CTD phosphorylation dictates the timing of RNA co-transcriptional processes, these observations suggest a crucial role for CTD proline isomerization in gene expression. Importantly, mutations in PIN1 are associated with cancer progression but a direct role for proline isomerization has remained understudied given the technical limitations imposed by its complex enzymology, such as the inability of differentiating CIS and TRANS isomers using Mass Spectrometry. In this project, I aim to functionally dissect the role of proline isomerization during Pol II transcription using rigorous biochemical, cellular and genomic techniques. Specifically, I will exploit new technological advances in peptide synthesis to permanently “lock” prolines in CIS or TRANS and identify novel isomer-specific interacting factors. I will systematically examine the consequences of CTD proline mutations and of rapid depletion of PIN1 in human cells, focusing on CTD-dependent co-transcriptional RNA processes such as splicing and poly-A–dependent 3’ termination. At the basic research level, my results will provide unprecedented resolution to the dynamics of Pol II phosphorylation, which underlies regulation of gene expression in multicellular organisms. Translationally, given that various cancers hijack the transcriptional programmes of the cell, this mechanistic understanding of CTD proline isomerization will better equip future clinical studies interested in the yet-to-be-characterized role of PIN1 in oncogenesis.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Wkład UE netto

Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.

€ 219 312,00
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

€ 219 312,00
Moja broszura 0 0