Opis projektu
Podejście obliczeniowe może zrewolucjonizować leczenie raka
Sekwencje DNA bogate w guaninę mogą tworzyć struktury czteroniciowe, zwane G-kwadrupleksami (G4). Nowe dane sugerują, że G4 biorą udział w takich procesach jak transkrypcja, replikacja, stabilizacja genomu, regulacja epigenetyczna, a także wzrost i rozwój komórek rakowych. W tym kontekście indukowana ligandami stabilizacja znajdujących się w telomerach i związanych z onkogennością G4 może być skuteczną metodą celowanego leczenia przeciwnowotworowego. Zespół finansowanego ze środków UE projektu G4-mtQSAR planuje opracować metodologię obliczeniową do celów przesiewowego badania małych ligandów, które mogą docierać do związanych z rozwojem raka G4 w DNA. Celem badaczy jest wykorzystanie wielofunkcyjnych modeli ilościowych opisujących zależność struktura–aktywność (QSAR) w celu znalezienia potencjalnych wielofunkcyjnych ligandów celowanych, mających zdolność stabilizowania wielu G4 dla kilku onkogenów jednocześnie.
Cel
The goal of the proposed research is to develop computational methodology which can screen out small ligand molecules having potential to selectively target G-quadruplex (G4) DNA which are associated with cancer pathology. Multiple oncogenes and telomerase activity are deregulated in various types of cancers. Ligand induced stabilization of G4s associated with the oncogenes (c-myc, c-kit, k-ras, etc.) and stabilization of telomeric G4s are efficient ways in targeted cancer therapy. Here, we intend to develop multi-target QSAR models that can aid in finding potential multi-target directed ligands (MTDLs) that can stabilize multiple G4s from different oncogenes simultaneously. It is the first computational study for identifying MTDLs against multiple G4s in Cancer treatment. Different multi-target QSAR approaches will be explored including ‘multiple regression and classification’ QSAR models, multi-target QSAR using Box-Jenkins moving average approach and multi-target QSAR using Perturbation approach. Several advanced machine learning techniques will be employed. A state-of-the-art software tool will be developed where all the successful multi-target QSAR models and in-house ADMET models will be incorporated as a knowledgebase. Notably, desirability-based multi-objective optimization approach will be used for identifying drug-like molecules. The software along with in-house KNIME workflows will then be used to screen potential MTDLs against multiple G4s. The selectivity and binding characteristics of the screened MTDLs towards G4s over duplex DNA will be analysed by performing molecular docking and molecular dynamics studies. The binding capacity of the screened MTDLs with intended G4s over duplex DNAs will then be confirmed using experiments such as isothermal fluorescence, UV-Vis, CD spectroscopies and FRET melting assay. The findings will aid in identifying new leads and reducing false positive outcomes in the crucial early stages of drug discovery and development.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna farmakologia i farmacja opracowywanie leków
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna patologia
- nauki przyrodnicze informatyka sztuczna inteligencja inteligencja obliczeniowa
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
46018 Valencia
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.