Opis projektu
Badanie inwersji chromosomalnych w celu poznania adaptacji do środowiska
Pomimo ogromnego postępu w badaniach nad biologią ewolucyjną, polimorfizmy inwersyjne związane z adaptacją do lokalnego środowiska pozostają niezbadanym obszarem. Skupiając się na badaniach śledzia oceanicznego (Clupea harengus), zespół finansowanego ze środków Unii Europejskiej projektu INVERT2ADAPT zajmie się analizą mechanizmów odpowiedzialnych za adaptację do środowiska opartą na inwersjach chromosomalnych. Aby to osiągnąć, naukowcy wykorzystają szereg różnorodnych narzędzi, takich jak genomika porównawcza, filogenomika, genomika populacyjna, badania ekspresji genów i genomika funkcjonalna. Projekt ma na celu przyczynienie się do lepszego zrozumienia interakcji pomiędzy genotypem, fenotypem i środowiskiem oraz roli zmienności strukturalnej w adaptacji w populacjach naturalnych.
Cel
Large chromosomal inversions have been increasingly linked to local adaptation in natural populations. Despite their importance, there is current debate about what evolutionary forces maintain inversion polymorphisms in natural populations, particularly regarding the interplay between balancing and divergent selection. Furthermore, limitations of sequencing technologies often result in poor characterization of inversion breakpoints obscuring our understanding of their functional impact. INVERT2ADAPT will focus on Atlantic herring (Clupea harengus) as a model system to study the contribution of chromosomal inversions to local adaptation using multiple genomics tools. First, I will characterize the chromosomal inversions and date their origin relatively to the evolutionary history of Atlantic herring using comparative genomics and phylogenomics. Second, I will study the selection regimes that maintain the inversions across a gradient of sea water temperate using population genomics. Lastly, I will pinpoint the genes and regulatory elements within the inversions that are involved in adaptation to sea water temperature using gene expression and functional genomics. The project will allow to better understand how Atlantic herring is able to survive across a wide range of sea water temperature in the Atlantic Ocean. A clear establishment of the link between linking genotype, phenotype and environment is important to understand how Atlantic herring might adapt to changes in sea water temperature induced by global warming. INVERT2ADAPT will also contribute to a better understanding of how structural variation, including large chromosomal inversions, contribute to adaptation in natural populations. The project will be implemented in Uppsala University under the supervision of Professor Leif Andersson.
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordynator
751 05 Uppsala
Szwecja