Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Spatiotemporal analysis of mammalian embryonic development at single-cell level

Opis projektu

Badanie wczesnego rozwoju embrionalnego na poziomie pojedynczych komórek

Wczesny rozwój embrionalny u ssaków zależy od przestrzenno-czasowej regulacji genów na poziomie pojedynczych komórek. Transkryptomika przestrzenna na poziomie pojedynczych komórek oraz obrazowanie in toto to niedawno opracowane techniki, które mogą pomóc w lepszym zrozumieniu procesu rozwoju dzięki powiązaniu ruchu komórek z ich stanem. Celem finansowanego w ramach programu działań „Maria Skłodowska-Curie” projektu sc4DMap jest wykorzystanie transkryptomiki przestrzennej w połączeniu z technologią obrazowania in toto do badania wczesnych etapów rozwoju ssaków. Śledzenie w czasie rzeczywistym dynamiki komórek i profili ekspresji genów w całym rozwijającym się zarodku dostarczy informacji o ruchu komórek, interakcji z innymi komórkami, regulacji ekspresji genów i określaniu losu komórek.

Cel

Mammalian early embryonic development requires exquisite spatiotemporal gene regulation at the level of individual cells. However, it is still unclear and remains a fundamental challenge how cell behaviours govern gastrulation and organogenesis in early embryos. Two techniques have recently been developed to investigate cell fate decisions in early mammalian development (spatial transcriptomics at single-cell level) or to study the dynamic transition from single cells to fully formed organisms (in toto imaging), and if only these two techniques could be combined would we be able to link cell motion with cell state and more completely understand developmental processes. There is precedence for combining live cell imaging with gene expression data in ascidians and annelids, but this has yet to be done, at scale, in more complex mammalian systems. To this end, the proposal aims to investigate early mammalian development by linking spatial transcriptomics and in toto imaging data. This will be the first combination of real-time tracking of cellular dynamics and spatiotemporal gene expression profiles across the developing embryo, thus providing insight into how cells move, interact with each other and how they regulate their own gene expression, ultimately revealing the fate that cells adopt. Accordingly, I will develop a novel integration framework and generate the first cellular-resolution mammalian embryo developmental gene expression map in four dimensions that reflects both cellular dynamics and spatiotemporal gene expression profiles at the single-cell level. Moreover, this work will pave the way for multi-omics integration, which has been increasingly explored but to date is confined to the single-cell space.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2021-PF-01

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Wkład UE netto
€ 217 019,44
Koszt całkowity
Brak danych