Skip to main content
European Commission logo
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
CORDIS Web 30th anniversary CORDIS Web 30th anniversary

Decoding epistatic genome/RNome interactions in eukaryotic fitness gain using Leishmania parasites as a unique model system

Opis projektu

Czy niestabilność genomu w komórkach eukariotycznych wpływa na kondycję?

Leishmania to rodzaj pasożytniczych pierwotniaków przenoszonych na ludzi i zwierzęta poprzez ukąszenie zarażonych meszek, powodując u nich szereg chorób. W przeciwieństwie do większości komórek eukariotycznych pasożyty z rodzaju Leishmania mogą zwiększać ekspresję określonych genów przez zmiany dawki genów poprzez amplifikację całych chromosomów, regionów chromosomów lub pojedynczych genów. Celem finansowanego przez Europejską Radę ds. Badań Naukowych projektu DECOLeishRN jest zbadanie, w jaki sposób wykorzystują one taką niestabilność genomu do regulowania swojej kondycji. Naukowcy skupią się na mechanizmach molekularnych, które mogą odfiltrować toksyczne zmiany dawkowania genów od tych korzystnych, w tym modyfikacji RNA kierowanych przez niekodujące RNA. Biorąc pod uwagę, że niestabilność genomu sprzyja rozwojowi raka, wyniki projektu wykraczają tematyką poza same pasożyty z rodzaju Leishmania.

Cel

Darwinian evolution plays a central yet poorly understood role in human disease. Iterations between genetic mutation and environmental selection drive cancer development, microbial infection and therapeutic failure, thus increasing human mortality. The molecular mechanisms that harness the deleterious effects of genome instability to generate beneficial phenotypes in these pathogenic systems are unknown. Here we investigate this important unsolved question in the protozoan parasite Leishmania that causes devastating human infections. In the absence of transcriptional regulation, these early-branching eukaryotes exploit genome instability to regulate expression by gene dosage. Leishmania thus represents an ideal system to investigate how genome instability drives fitness gain in fast evolving, eukaryotic cells, such as observed during cancer development. Synergizing our expertise in genomics, evolution, systems and RNA biology, we have recently made several breakthrough discoveries that link parasite fitness gain to epistatic interactions between co-amplifying genes of small, non-coding RNAs, which program epitranscriptomic and translational regulation. We hypothesize that these genome/RNome interactions generate the phenotypic landscape underlying Leishmania fitness gain. Our proposal investigates this ground-breaking concept through two Specific Aims that (i) combine experimental parasite differentiation and evolution in vitro and in vivo to reveal molecular mechanisms underlying Leishmania predictive adaptation and fitness gain, and (ii) investigate how RNA modification and non-coding RNAs contribute to adaptation by regulating mRNA stability and translational control. Our findings will be highly relevant to other fast growing, eukaryotic systems that rely on genome instability, such as cancer or fungal pathogens.

Instytucja przyjmująca

INSTITUT PASTEUR
Wkład UE netto
€ 3 134 594,00
Adres
RUE DU DOCTEUR ROUX 25-28
75724 Paris
Francja

Zobacz na mapie

Region
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Rodzaj działalności
Research Organisations
Linki
Koszt całkowity
€ 3 134 594,00

Beneficjenci (3)