Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Long-TREC: The Long-Reads Transcriptomics European Consortium. The next generation transcriptome biology revealed by single molecule sequencing technologies

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Interim report including links to a protocol repository (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Updated report on the state of library preparation, sequencing and mapping algorithm developments, including links to a protocol repository (i.e. protocols.io) and GitHub for code of novel mapping algorithms

Interim report on the state of algorithm developments in WP4 applied to use cases (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Updated progress report on the state of algorithm developments in WP4, including a list of links to GitHub repositories containing code

Initial report on the state of algorithm developments in WP5 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Interim report on the state of algorithm developed in WP5 and pipelines comparison (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Updated progress report on the state of algorithm developments in WP5 and comparison of pipelines

Initial progress report on the state of algorithm developments in WP3 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Progress report on the state of algorithm developments in WP3

Progress report on the state of library preparation, sequencing and mapping algorithm (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Progress report on the state of library preparation, sequencing, and mapping algorithm developments.

Interim report on the state of algorithm developed in WP3, including benchmarks (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Updated progress report on the state of algorithm developments in WP3, including a list of links to a GitHub repository containing code

Progress report on the state of algorithm developments in WP4 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
LongTREC website and social network profiles (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Publikacje

IsoTools 2.0: Software for Comprehensive Analysis of Long-read Transcriptome Sequencing Data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yalan Bi, Tom Lukas Lankenau, Matthias Lienhard, Ralf Herwig
Opublikowane w: Journal of Molecular Biology, 2025, ISSN 0022-2836
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jmb.2025.169049

Icarust, a real-time simulator for Oxford Nanopore adaptive sampling (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rory Munro, Satrio Wibowo, Alexander Payne, Matthew Loose
Opublikowane w: Bioinformatics, Numer 40, 2024, ISSN 1367-4811
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/bioinformatics/btae141

Long-read transcriptome sequencing of CLL and MDS patients uncovers molecular effects of<i>SF3B1</i>mutations (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Alicja Pacholewska, Matthias Lienhard, Mirko Brüggemann, Heike Hänel, Lorina Bilalli, Anja Königs, Felix Heß, Kerstin Becker, Karl Köhrer, Jesko Kaiser, Holger Gohlke, Norbert Gattermann, Michael Hallek, Carmen D. Herling, Julian König, Christina Grimm, Ralf Herwig, Kathi Zarnack, Michal R. Schweiger
Opublikowane w: Genome Research, Numer 34, 2024, ISSN 1088-9051
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/GR.279327.124

Evidence-based unification of potato gene models with the UniTato collaborative genome browser (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Maja Zagorščak, Jan Zrimec, Carissa Bleker, Nadja Nolte, Mojca Juteršek, Živa Ramšak, Kristina Gruden, Marko Petek
Opublikowane w: Frontiers in Plant Science, Numer 15, 2024, ISSN 1664-462X
Wydawca: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FPLS.2024.1352253

Toward the use of nanopore RNA sequencing technologies in the clinic: challenges and opportunities (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Xanthi-Lida Katopodi, Oguzhan Begik, Eva Maria Novoa
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 53, 2025, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAF128

Profiling the epigenome using long-read sequencing (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tianyuan Liu, Ana Conesa
Opublikowane w: Nature Genetics, Numer 57, 2025, ISSN 1061-4036
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41588-024-02038-5

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Moja broszura 0 0