Opis projektu
Odkrywanie czynników transkrypcyjnych specyficznych dla cytokin w makrofagach
Makrofagi są istotnymi elementami układu odpornościowego, biorącymi udział w nieswoistej odpowiedzi odpornościowej i stanie zapalnym. Rozpoznają, wchłaniają i niszczą patogeny, szczątki komórkowe i martwe komórki w procesie zwanym fagocytozą. Wiele chorób zapalnych jest związanych z rozregulowaną funkcją makrofagów. Finansowany przez Europejską Radę ds. Badań Naukowych projekt CYTOMAC ma na celu określenie specyficznego oddziaływania cytokin na zachowanie makrofagów, biorąc pod uwagę, że pomimo ich przeciwnych funkcji mają one podobne szlaki sygnalizacyjne. Badacze skupią się na konkretnych czynnikach transkrypcyjnych odpowiedzialnych za aktywność cytokin. Badania te mogą przyczynić się do rozwoju ukierunkowanych interwencji w przypadku chorób na tle zapalnym, a także do poprawy dostępnych metod leczenia.
Cel
Dysregulated macrophage function underlies many inflammatory diseases. Cytokines, small secreted signaling molecules with immune-modulatory functions, shape the macrophages phenotype, thereby affecting disease states. Puzzlingly, many cytokines with opposing functions, utilize highly similar JAK-STAT signaling cascades, leaving it unclear how cytokine-specific responses can occur.
In my previous work, I studied enhancer activation in mouse macrophages from genetically different strains. By studying genetic variation, I found that transcription factor (TF) motifs crucial for enhancer activation can be identified. I further developed the bio-informatic tool MAGGIE to study TF motif mutations in different strains of mice, which subsequently enabled me to discover a novel TF important for enhancer activation by the cytokine interleukin-4.
Based on my findings, I hypothesize that cytokines require specific, yet unidentified TFs that cooperate with JAK-STAT signaling to mount cytokine-specific effects.
CYTOMAC aims to identify these cytokine-specific TFs downstream of JAK-STAT that direct appropriate cell responses. I will exploit the genetic variation across mouse strains and study enhancer activation in macrophages from these strains in response to different disease-related cytokines. Specifically, I will: (1) use genetic diversity between mouse strains to identify specific TFs regulating cytokine-specific responses; to then target these novel TFs in (2) mouse and (3) human macrophages and (4) translate my findings to human disease and inflammatory disease models.
Inhibitors targeting JAK-STAT show high potential in clinically treating inflammatory diseases, including rheumatoid arthritis. However, as they affect generic pathways of many cytokines they come with considerable side-effects, limiting applicability. CYTOMAC will reveal novel, cytokine-specific TFs, which will aid in developing better tailored intervention strategies.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez zespół projektowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez zespół projektowy.
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Temat(-y)
System finansowania
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstytucja przyjmująca
1081 HV Amsterdam
Niderlandy