Opis projektu
Niekodujące regiony DNA i ich rola w adaptacji i ewolucji człowieka
Ewolucja sekwencji kodujących białka w genomach jest dobrze poznana, czego nie można powiedzieć o ewolucji sekwencji niekodujących kontrolujących ekspresję genów. Elementy cis-regulatorowe, w tym promotory oraz sekwencje wzmacniające i wyciszające, są ważnymi regulatorami transkrypcji. Trudność polega na zidentyfikowaniu ich zmian i powiązaniu ich z fenotypami. Finansowany przez ERBN projekt RegEvoHum zakłada wykorzystanie najnowszych metod, hybrydowych komórek małp człekokształtnych i wysoce równoległych testów reporterowych w celu zidentyfikowania cis-regulatorowych zmian ekspresji oddzielających ludzi od małp człekokształtnych i określenia ich funkcji. Naukowcy opracują również nową metodę mapowania roli metylacji DNA w kształtowaniu ekspresji genów. Wyniki tych prac pozwolą rozpocząć odkrywanie roli regulacji genów w ewolucji człowieka.
Cel
While the phenotypes that set us apart from our closest extinct and extant relatives have been largely demarcated, we are still far from understanding the genetics of human adaptation, and how these changes affect our current anatomy, physiology, and health. Most human adaptations have likely occurred in regulatory regions, particularly in cis-regulatory elements, such as promoters and enhancers. However, our ability to study cis-regulatory evolution is limited due to the complexity of identifying cis-regulatory changes and linking them to phenotypes.
We believe these limitations can now be tackled by merging several cutting-edge approaches, primarily hybrid cells and massively parallel reporter assays (MPRAs), augmented by developing sorely needed new ones. In Aim 1, we will generate human-ape hybrid cells and use them to identify the gamut of cis-regulatory expression changes separating humans from other apes. In Aim 2, we will perform MPRAs to map the function of each of the variants that distinguish modern humans, Neanderthals, Denisovans and apes. In Aim 3, we will develop methMPRA, a novel method to map the role of DNA methylation in shaping gene expression. In Aim 4, we will synergize these data to study human evolution at the sequence, methylation, expression and phenotypic level.
The proposed project will: (a) generate comprehensive resources, including the first catalogs of the sequence and methylation changes that shaped human gene regulation; (b) Develop a novel method to characterize en masse the cis-effects of methylation on expression; (c) Develop novel platforms (human-ape hybrid cells) to map human cis-regulation; and (d) Identify genetic changes underlying human traits. Together, this will pave the way to understanding the role of gene regulation in human evolution.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznezoologiamammalogiaprymatologia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaanatomia i morfologia
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznafizjologia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Temat(-y)
System finansowania
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstytucja przyjmująca
7610001 Rehovot
Izrael