Opis projektu
Rola mikroorganizmów skórnych w metabolizmie leków
Nasza skóra jest domem dla milionów mikroorganizmów, które zapewniają homeostazę i właściwe funkcjonowanie tkanek. Pojawiające się dowody sugerują również rolę mikrobiomu skóry w metabolizmie leków, ponieważ zawiera on duży zbiór enzymów metabolicznych. Po chemioterapii u wielu pacjentów występuje zespół ręka-stopa (ang. hand-foot syndrome, HFS) związany z zaczerwienieniem i obrzękiem wewnętrznych części dłoni i podeszew stóp. W związku z tym zespół finansowanego przez UE projektu DiAMonD zamierza określić rolę mikrobiomu skóry w ochronie przed skórną niepożądaną reakcją polekową. Naukowcy wyizolują i zbadają drobnoustroje występujące w przypadku HFS wraz z ich zdolnością do metabolizowania określonych leków chemioterapeutycznych. Wyniki tych badań utorują drogę do spersonalizowanych interwencji po chemioterapii mających na celu uniknięcie wystąpienia HFS.
Cel
The microbiome plays relevant functions on human health and disease, including roles in the efficacy and security of drug treatments. Capecitabine is a pro-drug of 5-fluorouracil, which is an active metabolite that targets tumor cells. This treatment is used for diverse cancers, including colon tumors, and is commonly associated with diverse adverse reactions such as the hand-foot syndrome (HFS), a skin deterioration for which there has not been discovered its causal mechanism. Preliminary data suggest that some skin microbes interact with 5-flourouracil.
Here, I aim to study the dynamics and features of the skin microbiome of patients treated with capecitabine. Using massive parallel sequencing methods, I will look for microbial taxa, genes and/or functions associated with the presence/absence of HFS adverse reaction. Based on those data, I will select appropriate conditions to isolate microbial taxa likely implicated in HFS and I will study their ability to metabolize capecitabine and 5-florouracil. Then, with those microbes showing this activity, I will analyze their genomes and transcriptomes in presence/absence of these drugs to select candidate genes involved in this drug metabolism. Afterwards, I will perform docking methods to decipher more precisely the likelihood of the encoded protein to interact with the drug. Finally, I will validate this data with the phenotypic study of knock-out mutants lacking selected genes likely implicated in the drug metabolism.
This project will provide understanding related with the roles of the skin microbiome in the appearance or protection against a skin adverse drug reaction. This knowledge may be used for the advance of a precise and personalized medicine in which the individual microbiome can be considered. The proposed project will allow me to gain skills in novel methods of microbiome studies and in project management, and will extend my research network boosting my career towards a mature and independent stage.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Temat(-y)
Zaproszenie do składania wniosków
HORIZON-WIDERA-2022-TALENTS-02
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordynator
142 00 Praha 4
Czechy