Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Nanopore sequencing of cell-free DNA for the sensitive detection, molecular profiling and monitoring of childhood cancers

Cel

Paediatric cancer is the leading cause of death in children post infancy in the Western world. The integration of high-throughput molecular profiling is now urgently needed to guide clinical decision-making and treatment stratification. However, access to adequate tumour material for genomic profiling remains highly challenging, particularly in children with refractory cancers, due to sampling difficulties and small sample volumes. The analysis of cell-free DNA (cfDNA) from liquid biopsies for the detection of circulating tumour DNA (ctDNA) could offer a powerful, minimally invasive alternative to tumour profiling, thus circumventing sampling limitations. However, current ctDNA approaches have limited specificity and sensitivity, and their clinical implementation is hindered by poor scalability and high costs associated with conventional sequencing technologies. In contrast, emerging nanopore sequencing platforms have faster turnaround times, are more affordable and significantly smaller than conventional sequencers, making them easy to deploy and implement in healthcare settings. However, their utility for cfDNA analyses remains largely unexplored. Here, using available data and liquid biopsy samples from ~500 children with cancer, I will develop computational tools for the detailed analysis of cfDNA nanopore sequencing data. By harnessing nanopores ability to sequence native DNA, thus allowing the detection of mutational DNA alterations and epigenetic modifications from the same assay, I will: (a) establish highly sensitive and specific approaches for the detection and molecular profiling of ctDNA, (b) develop methylation-based disease classifiers for accurate diagnosis and treatment stratification, and (c) evaluate the clinical utility of cfDNA nanopore sequencing to monitor treatment response and detect cancer relapse. The clinical implementation of these approaches could therefore significantly improve disease management and outcomes for children with cancer.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Wkład UE netto

Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.

€ 220 908,48
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych

Partnerzy (1)

Moja broszura 0 0