Enabling personalised diagnosis, treatment, and stratification through whole-body metabolic modelling of an individual’s genome, metabolome, and metagenome.

Informazioni relative al progetto

AVATAR

ID dell’accordo di sovvenzione: 101125633

DOI

10.3030/101125633

Data della firma CE 15 Marzo 2024

Data di avvio 1 Aprile 2024

Data di completamento 31 Marzo 2029

Finanziato da

• European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 999 991,00

Contributo UE

€ 1 999 991,00

Coordinato da

UNIVERSITY OF GALWAY
Ireland

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (8)

MicroMap: a network visualisation resource for human microbiome metabolism

Autori: Cyrille C. Thinnes, Renee Waschkowitz, Eoghan Courtney, Eoghan Culligan, Katie Fahy, Ruby A. M. Ferrazza, Ciara Ferris, Angeline Lagali, Rebecca Lane, Colm Maye, Olivia Murphy, David Noone, Saoirse Ryan, Mihaela Bet, Maria C. Corr, Hannah Cummins, David Hackett, Ellen Healy, Nina Kulczycka, Niall Lang, Luke Madden, Lynne McHugh, Ivana Pyne, Ciara Varley, Niamh Harkin, Ronan Meade, Grace O’Donnell, Bram Nap, Filippo Martinelli, Almut Heinken, Ines Thiele
Pubblicato in: npj Biofilms and Microbiomes, Numero 11, 2025, ISSN 2055-5008
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41522-025-00853-0

Personalized metabolic whole-body models for newborns and infants predict growth and biomarkers of inherited metabolic diseases

Autori: Elaine Zaunseder, Ulrike Mütze, Jürgen G. Okun, Georg F. Hoffmann, Stefan Kölker, Vincent Heuveline, Ines Thiele
Pubblicato in: Cell Metabolism, Numero 36, 2024, ISSN 1550-4131
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cmet.2024.05.006

Characterisation of conserved and reacting moieties in chemical reaction networks

Autori: Hadjar Rahou, Hulda S. Haraldsdóttir, Filippo Martinelli, Ines Thiele, Ronan M.T. Fleming
Pubblicato in: Journal of Theoretical Biology, Numero 621, 2026, ISSN 0022-5193
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JTBI.2025.112348

A genome-scale metabolic reconstruction resource of 247,092 diverse human microbes spanning multiple continents, age groups, and body sites

Autori: Almut Heinken, Timothy Otto Hulshof, Bram Nap, Filippo Martinelli, Arianna Basile, Amy O’Brolchain, Neil Francis O’Sullivan, Celine Gallagher, Eimer Magee, Francesca McDonagh, Ian Lalor, Maeve Bergin, Phoebe Evans, Rachel Daly, Ronan Farrell, Rose Mary Delaney, Saoirse Hill, Saoirse Roisin McAuliffe, Trevor Kilgannon, Ronan M.T. Fleming, Cyrille C. Thinnes, Ines Thiele
Pubblicato in: Cell Systems, Numero 16, 2025, ISSN 2405-4712
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CELS.2025.101196EXTERNALLINK

The nutrition toolbox permits in silico generation, analysis, and optimization of personalized diets through metabolic modelling

Autori: Bram Nap, Bronson Weston, Annette Brandt, Maximilian F Wodak, Ina Bergheim, Ines Thiele
Pubblicato in: Bioinformatics advances, ISSN 2635-0041
Editore: Bioinformatics advances
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF325

In silico metabolic modelling links microbiome-derived metabolites to risk factors of Alzheimer’s disease

Autori: Tim Hensen, Shahzad Ahmad, Gabi Kastenmüller, Robert Kraaij, Mohsen Ghanbari, Arfan Ikram, Rima Kaddurah-Daouk, Ines Thiele
Pubblicato in: Gut Microbes Reports, Numero 2, 2025, ISSN 2993-3935
Editore: Informa UK Limited
DOI: 10.1080/29933935.2024.2443171

XomicsToModel: omics data integration and generation of thermodynamically consistent metabolic models

Autori: German Preciat, Agnieszka B. Wegrzyn, Xi Luo, Ines Thiele, Thomas Hankemeier, Ronan M. T. Fleming
Pubblicato in: Nature Protocols, 2025, ISSN 1754-2189
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41596-025-01288-9

Microbial Abundances Retrieved from Sequencing data—automated NCBI Taxonomy (MARS): a pipeline to create relative microbial abundance data for the Microbiome Modelling Toolbox and utilizing homosynonyms for efficient mapping to resources

Autori: Tim Hulshof, Bram Nap, Filippo Martinelli, Ines Thiele
Pubblicato in: Bioinformatics Advances, Numero 4, 2024, ISSN 2635-0041
Editore: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/bioadv/vbae068