Enabling personalised diagnosis, treatment, and stratification through whole-body metabolic modelling of an individual’s genome, metabolome, and metagenome.

Informacje na temat projektu

AVATAR

Identyfikator umowy o grant: 101125633

DOI

10.3030/101125633

Data podpisania przez KE 15 Marca 2024

Data rozpoczęcia 1 Kwietnia 2024

Data zakończenia 31 Marca 2029

Finansowanie w ramach

• European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 999 991,00

Wkład UE

€ 1 999 991,00

Koordynowany przez

UNIVERSITY OF GALWAY
Ireland

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (8)

MicroMap: a network visualisation resource for human microbiome metabolism

Autorzy: Cyrille C. Thinnes, Renee Waschkowitz, Eoghan Courtney, Eoghan Culligan, Katie Fahy, Ruby A. M. Ferrazza, Ciara Ferris, Angeline Lagali, Rebecca Lane, Colm Maye, Olivia Murphy, David Noone, Saoirse Ryan, Mihaela Bet, Maria C. Corr, Hannah Cummins, David Hackett, Ellen Healy, Nina Kulczycka, Niall Lang, Luke Madden, Lynne McHugh, Ivana Pyne, Ciara Varley, Niamh Harkin, Ronan Meade, Grace O’Donnell, Bram Nap, Filippo Martinelli, Almut Heinken, Ines Thiele
Opublikowane w: npj Biofilms and Microbiomes, Numer 11, 2025, ISSN 2055-5008
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41522-025-00853-0

Personalized metabolic whole-body models for newborns and infants predict growth and biomarkers of inherited metabolic diseases

Autorzy: Elaine Zaunseder, Ulrike Mütze, Jürgen G. Okun, Georg F. Hoffmann, Stefan Kölker, Vincent Heuveline, Ines Thiele
Opublikowane w: Cell Metabolism, Numer 36, 2024, ISSN 1550-4131
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cmet.2024.05.006

Characterisation of conserved and reacting moieties in chemical reaction networks

Autorzy: Hadjar Rahou, Hulda S. Haraldsdóttir, Filippo Martinelli, Ines Thiele, Ronan M.T. Fleming
Opublikowane w: Journal of Theoretical Biology, Numer 621, 2026, ISSN 0022-5193
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JTBI.2025.112348

A genome-scale metabolic reconstruction resource of 247,092 diverse human microbes spanning multiple continents, age groups, and body sites

Autorzy: Almut Heinken, Timothy Otto Hulshof, Bram Nap, Filippo Martinelli, Arianna Basile, Amy O’Brolchain, Neil Francis O’Sullivan, Celine Gallagher, Eimer Magee, Francesca McDonagh, Ian Lalor, Maeve Bergin, Phoebe Evans, Rachel Daly, Ronan Farrell, Rose Mary Delaney, Saoirse Hill, Saoirse Roisin McAuliffe, Trevor Kilgannon, Ronan M.T. Fleming, Cyrille C. Thinnes, Ines Thiele
Opublikowane w: Cell Systems, Numer 16, 2025, ISSN 2405-4712
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CELS.2025.101196EXTERNALLINK

The nutrition toolbox permits in silico generation, analysis, and optimization of personalized diets through metabolic modelling

Autorzy: Bram Nap, Bronson Weston, Annette Brandt, Maximilian F Wodak, Ina Bergheim, Ines Thiele
Opublikowane w: Bioinformatics advances, ISSN 2635-0041
Wydawca: Bioinformatics advances
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF325

In silico metabolic modelling links microbiome-derived metabolites to risk factors of Alzheimer’s disease

Autorzy: Tim Hensen, Shahzad Ahmad, Gabi Kastenmüller, Robert Kraaij, Mohsen Ghanbari, Arfan Ikram, Rima Kaddurah-Daouk, Ines Thiele
Opublikowane w: Gut Microbes Reports, Numer 2, 2025, ISSN 2993-3935
Wydawca: Informa UK Limited
DOI: 10.1080/29933935.2024.2443171

XomicsToModel: omics data integration and generation of thermodynamically consistent metabolic models

Autorzy: German Preciat, Agnieszka B. Wegrzyn, Xi Luo, Ines Thiele, Thomas Hankemeier, Ronan M. T. Fleming
Opublikowane w: Nature Protocols, 2025, ISSN 1754-2189
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41596-025-01288-9

Microbial Abundances Retrieved from Sequencing data—automated NCBI Taxonomy (MARS): a pipeline to create relative microbial abundance data for the Microbiome Modelling Toolbox and utilizing homosynonyms for efficient mapping to resources

Autorzy: Tim Hulshof, Bram Nap, Filippo Martinelli, Ines Thiele
Opublikowane w: Bioinformatics Advances, Numer 4, 2024, ISSN 2635-0041
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/bioadv/vbae068