Opis projektu
Nowy pomysł na rozwiązanie zagadek dotyczących drobnoustrojów
Mikroorganizmy kształtują biogeochemię Ziemi od miliardów lat. Jednak beztlenowe archeony, kluczowe dla obiegu węgla, pozostają w dużej mierze niezbadane ze względu na trudności w ich hodowli. Ta „mikrobiologiczna ciemna materia” kryje w sobie enzymatyczną, której nie da się badać konwencjonalnymi metodami. Finansowany przez ERBN projekt EnLightEn zakłada rozszyfrowanie tych procesów. Badając nieizolowane archeony w ich rodzimych siedliskach, zespół chce wyjaśnić molekularne zawiłości związane z przetwarzaniem węgla. Dzięki badaniom biochemicznym i zaawansowanym technikom, takim jak chromatografia i krystalizacja, projekt EnLightEn powinien przyczynić się do lepszego poznania metabolizmu drobnoustrojów, oferując bezprecedensowy wgląd w ziemskie ekosystemy. Projekt stanowi krok w kierunku zrozumienia tajemnic „mikrobiologicznej ciemnej materii” i jej wpływu na naszą planetę.
Cel
"Microorganisms have shaped the Earth's biogeochemistry for almost 4 billion years. Among them, anaerobic archaea dominate the carbon one-unit cycle, nourish ecosystems, and orchestrate the final step of organic matter degradation. They remain mainly uncharacterised and uncultured while harbouring a universe of concealed enzymatic chemistry, which cannot be approached via classic omics. EnLightEn will study these non-isolated archaea as part of the ""microbial dark matter"" by exploiting native biomass rather than artificial systems. The overall carbon-processing catabolic landscape will be pictured through an anaerobic pipeline, simultaneously investigating multiple enzymes bound to physiological partners and equipped with native (metallo)cofactors. This approach proved its success by deciphering the first and last steps of the ethane-oxidation process from an anaerobic microbial enrichment breaking the accepted metabolic model of archaeal alkanotrophy.
EnLightEn will develop into three branches. (i) We will pioneer the biochemical investigations of enzymes from methanotrophic archaea enrichments. (ii) The native catabolic machinery from acetate-degrading methanogens, the prime methane producers in the world, will be isolated from mesocosms. (iii) As the most challenging project, we will study marine environmental enzymes from sediments and microbial mats conducting anaerobic methanotrophy and methanogenesis.
Catabolic enzymes are naturally in high abundance in these multiple subspecies communities. Single protein populations will be sorted out by chromatography and ultimately by crystallisation and studied by a suite of biophysical, biochemical and structural technics, as we recently did for a methane-generating enzyme isolated from a wastewater treatment plant.
EnLightEn will open a field to characterise the functional dark matter, which can be further applied to other metabolisms and offer an unprecedented view of the molecular tricks used by the microbial world."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologiczneekologiaekosystemy
- nauki przyrodniczenauki chemicznechemia organicznazwiązki alifatyczne
- nauki przyrodniczenauki biologicznemikrobiologia
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałkaenzymy
- nauki przyrodniczenauki o Ziemi i pokrewne nauki o środowiskugeochemiabiogeochemia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Temat(-y)
System finansowania
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstytucja przyjmująca
75015 PARIS 15
Francja