Opis projektu
Lek przeciwwirusowy zwalczający potencjalne nowe lub powracające wirusy
W walce z wirusami niezwykle ważne jest opracowywanie nowych metod leczenia zakażeń wirusowych, szczególnie w przypadku wirusów, które przez Światową Organizację Zdrowia (WHO) zostały uznane za nowe i powracające wirusy o wysokim priorytecie. Jedną z obiecujących opcji leczenia są ukierunkowane na gospodarza leki przeciwwirusowe o szerokim spektrum działania. Jednak identyfikacja istotnych czynników gospodarza metodą wykluczania genów obejmującą cały genom stanowi wyzwanie ze względu na rozbieżności w uzyskiwanych wynikach. Może to zmienić finansowany przez Unię Europejską projekt APPEAL, którego celem jest ustanowienie procedury umożliwiającej identyfikację i walidację leków przeciwwirusowych ukierunkowanych na określone wirusy, a także opracowanie co najmniej jednego leku przeciwwirusowego o szerokim spektrum działania do zwalczania potencjalnych nowych i powracających wirusów ujętych w wykazie WHO. Procedura będzie oparta na uczeniu maszynowym, macierzach komórkowych o wysokiej gęstości i deskryptorach genów, dzięki czemu umożliwi identyfikację czynników gospodarza, które hamują rozwój wirusa.
Cel
Developing new antiviral treatment against viruses and particularly high-priority emerging and re-emerging viruses as listed by the WHO, remains crucial as, among other aspects, the viruses evolve under selection. Broad spectrum host-directed antiviral drugs (HDA) are promising therapeutic options, however the robust identification of relevant host factors by genome-wide knockout screens is challenging due to low consistency in the resulting hits. Our project aims to (1) establish a computational and experimental pipeline to identify and validate an antiviral for these viruses, and (2) identify at least one broad spectrum antiviral drug against potential emerging and re-emerging viruses as listed by the WHO. To address these, we will implement a drug selection pipeline following several strategies: We will employ (i) machine learning, based on data from knockout screens, proteomics, protein interaction, transcriptomics of infected cells with pandemic-related viruses, Genome-Wide Association Studies, and generic gene descriptors, (ii) High Density Cell Arrays, which provide much more detailed readouts compared to state of the art pooled knockout screens, (iii) primary cell cultures obtained from a diverse array of human tissues, as they are more appropriate to study the host cell physiology during infection, compared to cancer cell lines, and (iv) use the pipeline to identify host restriction factors, which, when activated, challenge the virus; followed by innovative drug development and delivery based on small activating RNA. The pipeline comprises an Expedited Arm for which broad spectrum antiviral drugs for repurposing will be selected followed by in vitro and in vivo efficacy testing, and a clinical trial as a proof of concept. The elaborated Arm includes all strategies (i)-(iv) and will provide a sustainable pandemic preparedness pipeline ready-to-operate to identify the appropriate treatment against the emerging virus at the early time of a new outbreak.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- medycyna i nauki o zdrowiunauki o zdrowiuchoroby zakaźnewirus RNA
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałkaproteomika
- nauki przyrodniczenauki biologicznemikrobiologiawirusologia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaonkologia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznafizjologia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-RIA - HORIZON Research and Innovation ActionsKoordynator
07747 Jena
Niemcy