Opis projektu
Czterowymiarowy model procesów rozwoju
Rozwój jest intrygującym procesem tworzenia się całego organizmu z pojedynczej komórki. Pomimo szeroko zakrojonych badań nie rozumiemy w pełni, w jaki sposób tak niezwykła różnorodność komórkowa wyłania się z genomu. Finansowany przez program działań „Maria Skłodowska-Curie” projekt 4D Development ma na celu udzielenie odpowiedzi na to kluczowe pytanie w biologii poprzez zmierzenie transkrypcji komórek u Drosophila melanogaster podczas jej dziesięciodniowego rozwoju. Naukowcy będą mierzyć przestrzenną ekspresję 1600 genów w rozdzielczości pojedynczej komórki co 4 godziny i wykorzystają te dane do stworzenia modeli 3D i 4D. Efektem tych prac powinno być poznanie sieci regulacji genów będących motorem rozwoju Drosphila i zrozumienie bardziej złożonych zwierząt, w tym myszy i ludzi.
Cel
How the genome regulates the differentiation trajectories that instruct a single fertilised egg to develop into an adult organism is a longstanding question in biology. Here, high-throughput spatial transcriptomics will be leveraged to virtually measure all cellular states of the Drosophila melanogaster. The entire ten-day development of the fruit fly will be sampled with a four-hour interval, where the spatial gene expression of 1,600 genes will be measured in a serially sectioned fly at single cell resolution. The sections will subsequently be reconstructed into 3D models. This approach enables whole-body-biology where a complex measurement is taken of all cells of an entire individual and is here used to densely sample development.
In order to reconstruct differentiation trajectories, the 3D fly models will be anatomically aligned between timepoints so that cellular states can be linked and transitions in transcriptional profiles can be studied. The spatial information will substantially simplify this challenge because progenitors and putative progeny will be in the same anatomical compartment. This will generate a 4D developmental model of the fruit fly that links cells, cell types, anatomy and differentiation in space and time.
The 4D developmental fly and the cell type trajectories will serve as the manifold onto which single cell transcriptomics (RNA-seq) and chromatin accessibility (ATAC-seq) data will be integrated. Then, Gene Regulatory Network inference tools can be used to identify transcription factors and enhancer sequences that drive lineage decisions. Investigating the enhancer sequences will reveal how cell type specificity is encoded and how the arising complexity is regulated during development.
This project will give a unique insight into development, patterning and the emergence of cellular diversity from the genome, and will form an important proof of concept to approach development in other larger organisms such as mice and humans.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna anatomia i morfologia
- nauki rolnicze rolnictwo, leśnictwo i rybołówstwo rolnictwo ogrodnictwo sadownictwo
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgia
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.