Opis projektu
Badanie strategii obronnych bakterii
Bakterie mają kluczowe znaczenie dla ekosystemów, a w jednym gramie gleby znajduje się ich nawet do 10 miliardów. Muszą jednak stawić czoła ciągłym zagrożeniom ze strony drapieżników - pierwotniaków, jednokomórkowych eukariontów, które zjadają bakterie, a także bakteriofagów, czyli wirusów, które je infekują i zabijają. Łącznie drapieżniki te niszczą do 20 % globalnej populacji bakterii dziennie, zmuszając bakterie do rozwoju mechanizmów obronnych. Pomimo ich dużego znaczenia, interakcje między tymi trzema grupami pozostają słabo poznane. Zespół finansowanego ze środków działania „Maria Skłodowska-Curie” projektu DictyDefense bada, w jaki sposób profagi (wirusy zintegrowane z genomami bakterii) pomagają bakteriom bronić się przed drapieżnictwem pierwotniaków. Projekt wykorzystuje testy fluorescencyjne i zaawansowane techniki badawcze w celu odkrycia genetycznych i biochemicznych mechanizmów stojących za tymi strategiami obronnymi.
Cel
Bacteria are the backbone of natural communities. A single gram of soil may contain up to 10 billion cells. Two types of bacterial predators are also abundant: protozoa, single-celled eukaryotes that phagocytize bacteria, and bacteriophages (phages), viruses that only infect bacteria. Each day, up to 20% of the global bacterial population is killed by these two predators. This puts pressure on bacteria to adapt defense strategies, but also on each predator to out-compete the other. However, the interplay between bacteria, phages, and protozoa is rarely studied.
Certain phages can integrate into bacterial genomes, becoming prophages, and encode beneficial traits for host fitness, like protection from other phages. My hypothesis is that prophages encode defense mechanisms that may interfere with protozoan predation and protect the bacterial host, thereby indirectly benefiting the prophage.
To investigate this, I will develop a high-throughput quantitative fluorescence predation assay, using the amoeba Dictyostelium discoideum as the model protozoan. Changes in abundance of fluorescently tagged bacteria with and without defense functions will report the strength of predation defense in a large bacterial isolate panel harbouring thousands of prophages. The assay will be scaled up with robotics platforms. Gain of function screens will be used to link defense phenotype with individual genes. After prioritizing the defense hits for novel biology, the major stages of predation that are inhibited can be observed by real time tracking of interactions between fluorescently tagged cells. Biochemical and genetic follow-ups will pinpoint the exact mechanisms of defense. Proteomic, transcriptomic, and lipidomic methods will assess changes in bacterial and protozoan physiology. Overall, this proposal addresses an important blind-spot in the interactions of bacteria, protozoa, and phages and will reveal new aspects on how predatory interactions shape microbial ecosystems.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia bakteriologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia wirusologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne ekologia ekosystemy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologiczne nauki behawioralne etologia zależności międzygatunkowe
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
69117 Heidelberg
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.