Opis projektu
Wyjaśnienie mechanizmów genetycznej ochrony przed toksynami morskimi
Nasilające się szkodliwe zakwity planktonu stanowią poważne zagrożenie dla ekosystemów, zdrowia ludzi i gospodarek obszarów przybrzeżnych. Uwalniane w czasie zakwitów oksylipiny, podobnie jak wielonienasycone aldehydy, sieją spustoszenie wśród organizmów morskich, ale mimo to wciąż nie poznaliśmy ich skutków dla genetyki. Wspierany w ramach działań „Maria Skłodowska-Curie” (MSCA) projekt OikoDefensome koncentruje się na larwach z gatunku Oikopleura dioica, należącego do gromady ogonic. Jego celem jest odkrycie mechanizmu obronnego, określonego mianem „defensomu”, który jest zestawem genów aktywowanych w momencie ekspozycji na wielonienasycone aldehydy. Wykorzystując zaawansowane techniki genomiczne, takie jak sekwencjonowanie RNA (RNASeq) i CRISPR, zespół projektu zamierza wyjaśnić różne adaptacyjne reakcje organizmów morskich na biotoksyny. Dzięki możliwości opracowania uniwersalnych markerów stresu dla różnych gatunków te przełomowe badania mogą przynieść wiedzę kluczową dla ochrony ekosystemów morskich w obliczu eskalacji szkodliwych zakwitów planktonu.
Cel
Intensification of the frequency and severity of harmful algae blooms (HABs) has recently increased due to climate change and global warming, affecting environment, human health as well as local economies based on fishing and/or recreational activities. Some diatom species (representing half of the primary production of the oceans) synthesize biotoxic compounds derived from secondary metabolites known as oxylipins, which are highly produced during HABs upon cell damage. Several studies have reported that Polyunsaturated aldehydes (PUAs), among the most studied oxylipins, have negative effects on many marine organisms, reporting impairment of growth, reproduction, cell homeostasis and detoxification. However, the genetic mechanisms that regulate these physiological responses are still unknown. It has been proposed that some organisms could have a set of conserved genes that will be activated upon PUAs exposure, the so call ‘Defensome’, but few members had been described. The larvacean Oikopleura dioica is one of the many organisms affected by PUAs. In addition of being among the most abundant components of the mesozooplankton, O. dioica is an “evolutionary-knockout” for many signalling pathways being a perfect candidate to study biological adaptations by gene loss.
Using O. dioica as animal model we aim to identify conserved Defensome genes shared among marine animals and to study the developmental pathways affected by biotoxins. To achieve this goal, we will combine transcriptomics (RNASeq), chromatin accessibility (ATAC-Seq) and gene interference approaches (RNAi, DNAi, Cas9-CRISPR). The results of this project will be key for understanding the genetic adaptive response of marine embryos to the biotoxic impact of HABs on marine environments worldwide. Moreover, the discovery of a conserved set of Defensome genes across different groups of marine animals, could provide a useful set of pan-markers of environmental stress for be applied in many different species.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki rolniczerolnictwo, leśnictwo i rybołówstwołowiska
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaembriologia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznafizjologiahomeostaza
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordynator
08007 Barcelona
Hiszpania