Opis projektu
Poznawanie funkcji globalnej hipometylacji w linii zarodkowej
W rozwijającej się linii zarodkowej ssaków usuwana jest metylacja DNA, czyli znacznik epigenetyczny, który normalnie ma kluczowe znaczenie dla utrzymania stabilności genomu. Ten stan hipometylacji jest przejściowy u mężczyzn, ale utrzymuje się w żeńskich komórkach rozrodczych lub oocytach aż do okresu dojrzewania. Finansowany przez ERBN projekt hypomethGENOME zbada konsekwencje tej hipometylacji w komórkach rozrodczych i oocytach. W tym celu zespół wykorzysta transgeniczne modele myszy i opracuje pionierską metodę badania propagacji epigenomu in vivo. Śledząc cząsteczki DNA i ich znaczniki metylowe podczas podziału u żywych ssaków i zarodków, zespół projektu hypomethGENOME odkryje funkcje i konsekwencje globalnej hipometylacji w linii zarodkowej.
Cel
Replication in S phase duplicates not only the genome but also the epigenome, to ensure cell identity is propagated and genome stability maintained in daughter cells. Epigenome propagation in development has been understudied due to lack of appropriate methods, even though replication is widely accepted to be a primary vehicle through which programmed epigenetic changes occur in vivo. In mammalian germline development, the epigenome is reprogrammed via impairment of the epigenome maintenance network. By dividing without maintaining core components of the epigenome, primordial germ cells harbor genomes devoid of the crucial repressive mark DNA methylation. Hypomethylation is destabilizing because it de-represses transposable elements. Despite this, oocytes arrest in a hypomethylated state, regaining methylation only in preparation for ovulation as part of puberty. In parallel, two-thirds of the oocyte pool dies around birth in mammals, and the features delineating oocytes that survive this process from those that die are unclear.
I propose that hypomethylation is alternately selected for and against across gametogenesis. Specifically, that hypomethylation a positive feature in primordial germ cells but a deleterious feature in the female germline after sex specification. To test this, we will develop novel transgenic mouse models and technologies to study epigenome propagation in vivo, and utilize state-of-the-art sequencing, mass spectrometry, microscopy, and metabolic labelling approaches. By developing a method for tracking DNA molecules and their associated methyl marks across division in live animals and embryos, we will establish an unprecedented technology for understanding epigenome propagation in development. Cumulatively, this work will uncover the functions and consequences of global hypomethylation in the germline, and provide groundbreaking insights into the nature of mitotic and intergenerational epigenetic inheritance in vivo.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- nauki przyrodniczenauki fizyczneoptykamikroskopia
- nauki przyrodniczenauki biologicznezoologiamammalogia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaembriologia
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Temat(-y)
System finansowania
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstytucja przyjmująca
1165 Kobenhavn
Dania