Opis projektu
Budowanie genomów, jedna nić na raz
Wraz z rozwojem biologii syntetycznej, tworzenie kompletnych genomów od podstaw staje się coraz bardziej wartościowe dla medycyny, biotechnologii i rozwiązań środowiskowych. Genomika syntetyczna idzie o krok dalej, umożliwiając składanie całych genomów z małych fragmentów DNA. Jednak wydajność tego procesu zmniejsza się wraz ze wzrostem rozmiaru fragmentu. Jest to głównie kwestia fizyczna: dłuższe nici DNA mają mniejsze szanse na znalezienie i związanie się ze sobą. Pokonanie tego wyzwania jest kluczem do zwiększenia skali syntezy genomu. Zespół finansowanego przez ERBN projektu SynGene rozwiązuje ten problem, wykorzystując kanały nanofluidyczne do rozciągania DNA i odsłaniania jego końców w celu hybrydyzacji. Wykorzystując maszynerię rekombinacji drożdży i szablony krótkich fragmentów DNA, badacze oferują nową, potężną metodę skuteczniejszego manipulowania całymi genomami.
Cel
Synthetic genomics is a rapidly growing branch of synthetic biology where the goal is to assemble a complete genome from small synthetic DNA fragments. The main obstacle is the later stages of assembly where fragments on the kilobasepair length scale are to be assembled, where the efficiency rapidly falls off with increasing fragment size. A large contribution to this bottleneck is purely physical, where the probability of DNA ends meeting decreases with increasing DNA size. My solution to this problem is to force DNA ends to meet using nanofluidic channels. In such channels DNA is stretched out to almost the complete contour length, exposing the ends for hybridization. As part of my ongoing ERC-CoG, I have demonstrated several principles that will make it possible to use nanofluidic devices for genome assembly. Long DNA can be entropically trapped in nanochannels to force DNA ends to meet to promote hybridization of complementary overhangs. The bacterial protein Ku stably anneals 4 bp complementary overhangs, making it possible to engineer which fragments that are annealed. Bacterial Ligase D then binds to Ku to ligate the DNA.
Within this PoC project I will take the next steps to bring this principle to a commercially feasible platform.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2025-POC
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
412 96 Goteborg
Szwecja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.