Opis projektu
Zrozumienie mechanizmów adaptacyjnych linii bakterii S. Typhimurium
Salmonella enterica serowar Typhimurium ST313, linia 3 (L3), to niedawno opisana linia bakteryjna wrażliwa na wszystkie badane antybiotyki, w której inwazyjne zakażenia wywoływane przez nietyfusowe pałeczki Salmonelli powodują około 77 500 zgonów rocznie. Odkrycie to podważa przekonanie, że antybiotykooporność jest głównym czynnikiem decydującym o sukcesie patogenów. Zespół projektu ATLAS, realizowanego przy wsparciu z działań „Maria Skłodowska-Curie”, zbada, dlaczego szczep L3 rozwija się pomimo braku oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe, łącząc fenogenomikę, genomikę funkcjonalną i analizy multiomiczne w celu porównania izolatów L2 i L3. Koncentrując się na krążących szczepach L3, badacze będą dążyli do odkrycia mechanizmów wirulencji specyficznych dla L3 i stworzenia ogólnodostępnego atlasu ewolucji ST313, aby ocenić, czy wydajność metaboliczna i unikanie odpowiedzi immunologicznej mogą odgrywać większą rolę w przeżywalności bakterii niż oporność na antybiotyki.
Cel
The ATLAS project tackles a critical paradox in bacterial evolution: the rise of pan-susceptible S. Typhimurium ST313 Lineage 3 (L3), which is displacing multidrug-resistant Lineage 2 (L2) across sub-Saharan Africa, a region where invasive non-typhoidal Salmonella causes around 77,500 deaths annually. This phenomenon challenges the prevailing view that antibiotic resistance is the main driver of pathogen success. Building on the host laboratory’s discovery of L3 and preliminary evidence of its hyper-replication in macrophages, ATLAS seeks to uncover why L3 thrives despite lacking antimicrobial resistance.
ATLAS employs a uniquely integrative strategy combining phenogenomics, functional genomics, and multi-omics analyses. We will compare L2 and L3 isolates using parallel workflows: phenotypic assays and pangenome analysis (WP1), coupled with dual RNA-seq, Tn-seq during macrophage infection, and integration with genome-scale metabolic models (WP2). These datasets will converge in WP3 through GWAS and a comprehensive comparative network analysis to reveal the mechanisms driving lineage replacement. This integrated approach is essential to capture the interplay of virulence, metabolism, and immune evasion, factors invisible to single-method studies.
By focusing on circulating L3 strains and applying simultaneous multi-omics integration, ATLAS moves beyond prior studies limited to early isolates and sequential analyses. Leveraging the host lab’s optimized protocols, Tn-seq libraries, and transcriptomic resources, the project will generate transformative insights: L3-specific virulence mechanisms and metabolic adaptations enabling systemic infection will be mapped, creating at the same time an open-access atlas of ST313 evolution. This resource will shift the field from descriptive observation to predictive frameworks, providing the basis to determine whether metabolic efficiency and immune evasion can outweigh antibiotic resistance in bacterial success.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
L69 7ZX LIVERPOOL
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.