Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-06-18

The mechanisms for lateral gene transfer in nature as reflected in prokaryote genomes

Cel

Lateral gene transfer (LGT) is the process by which prokaryotes acquire DNA across wide taxonomic boundaries and incorporate it into their genome. Accumulating evidence shows that LGT plays a major role in prokaryote evolution. The biological and evolutionary significance of lateral gene transfer has broad implications for our understanding of microbial biology, not only in terms of evolution, but also in terms of human health.
Mechanisms of lateral gene transfer include: transformation, transduction, conjugation, and gene transfer agents. Each of these transfer mechanisms leaves distinct and recognizable molecular footprints in genome sequences. The molecular details of these footprints betray the workings of the corresponding mechanisms in nature, but their relative contributions to the evolution of sequenced genomes have so far not been investigated. By identifying these footprints one can specify and quantify the relative contribution of the different LGT mechanisms during prokaryote genome evolution and thereby uncover more of the biology underlying prokaryote evolution in nature. The goal of this proposal is to quantify those contributions and to bring forth a general computer-based model of prokaryote genome evolution that approximates the underlying evolutionary process far more realistically than phylogenetic trees alone possibly can.
Here I propose to apply directed networks to the study of prokaryotic genome evolution in an evolutionary model that allows both for vertical inheritance and for lateral gene transfer events. With methods to identify gene donors, all recent LGTs can be described in a single directed network. This is a fundamentally new, biologically more realistic and evolutionarily more accurate, general computational model of prokaryote genome evolution. Such a model will substantially enrich our ability to understand the process of prokaryote evolution as it is recorded in genomic and metagenomic data.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

ERC-2011-StG_20101109
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Instytucja przyjmująca

CHRISTIAN-ALBRECHTS-UNIVERSITAET ZU KIEL
Wkład UE
€ 1 415 507,20
Adres
OLSHAUSENSTRASSE 40
24118 Kiel
Niemcy

Zobacz na mapie

Region
Schleswig-Holstein Schleswig-Holstein Kiel, Kreisfreie Stadt
Rodzaj działalności
Higher or Secondary Education Establishments
Linki
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych

Beneficjenci (2)

Moja broszura 0 0