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Contenuto archiviato il 2024-05-27

Molecular modelling of the cannabinoid CB1 receptor homodimer and its interaction with ligands: the role of membrane cholesterol and the CRIP1a protein

Obiettivo

The cannabinoid CB1 receptor (CB1R) is an attractive molecular target for the treatment of substance abuse, drug addiction, schizophrenia, bipolar disorder, motor dysfunction including Huntington’s disease, as well as cardiometabolic disease and metabolic syndrome.
The general aim of the project is to investigate in silico the phenomenon of the homodimerization of the CB1R, the interaction of the CB1R homodimer with ligands, and to study the effect of membrane cholesterol and the cannabinoid receptor interacting protein 1a, CRIP1a, on the functioning of the CB1R homodimer. The project is intended to verify a set of hypotheses: (i) homodimerization of the CB1R is agonist-mediated; (ii) the interface transmits cross-talk between protomers; (iii) cholesterol promotes CB1R homodimerization; (iv) cholesterol stabilizes the inactive state of the CB1R homodimer; (v) the CRIP1a stabilizes the inactive state of the CB1R monomer; (vi) the CRIP1a hampers CB1R homodimerization. The project involves the following detailed objectives:
(1) homology modelling of the CB1R monomer in the active and inactive state;
(2) application of protein-protein docking and surface roughness-based scoring to construct a model of the CB1R homodimer in the active, inactive and “mixed” state;
(3) all-atom molecular dynamics (MD) simulations of respective dimers and monomers in a lipid bilayer;
(4) all-atom MD simulations of the respective dimers and monomers in a lipid bilayer containing cholesterol;
(5) modelling of CRIP1a;
(6) modelling of the CB1R-CRIP1a complexes applying protein-protein docking and MD simulations;
(7) coarse-grained MD to investigate the assembly of CB1R monomers and CB1R-CRIP1a complexes in a lipid bilayer;
(8) coarse-grained MD to investigate the assembly of CB1R monomers and CB1R-CRIP1a complexes in a lipid bilayer containing cholesterol;
(9) application of structure-based drug design methods to elaborate compounds that modulate dimer activity.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2011-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

ITA-SUOMEN YLIOPISTO
Contributo UE
€ 272 231,80
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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