Cel
"Somatic structural variation (i.e. those structural rearrangements arising in a tumour) is found in almost all cancer genomes studied in detail. Current next-generation sequencing (NGS) strategies allow the identification of genomic structural variation with an unprecedented base pair resolution, revealing a complex landscape of somatic rearrangements in several cancer types. The studies carried out so far have focused upon four main types of rearrangement, namely deletions, amplifications, inversions, and translocations, but the complement of somatic insertions that characterizes cancer genomes remains mostly unexplored. These genomic insertions are mainly caused by transposable elements (TEs) and exogenous viruses, and despite the fact that these sequences can lead to disease little is known about the extent they can generate diversity in somatic cells and contribute to cancer development. Thus, taking advantage of the availability of the sequencing data generated by the international cancer genome consortium (ICGC), the purpose of this project is to use NGS data to explore and characterize the landscape of somatic insertions attributable to TEs and exogenous viruses in human cancer. TASK 1 of this project aims to identify the somatic insertions due to TEs and exogenous viruses in a total of 1,000 human cancer genomes for breast, bone and blood. A unique bioinformatics pipeline will be developed to identify the entire complement of somatic insertions by the analysis of whole-genome sequencing data of these cancers. TASK 2 aims to determine if somatic insertions in Task 1 impact gene function, by investigating the presence of aberrant splicing and/or gene expression and aberrant methylation profiles using RNA sequencing data and whole-genome methylation data. This project will provide essential insights into structural and functional impact of genomic insertions in cancer. This will lead to a better understanding of molecular mechanisms involved in oncogenesis."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia wirusologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
CB10 1SA SAFFRON WALDEN
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.